Geri Dön

Amasya, Samsun ve Tokat illerinde domates yetiştirilen alanlarda enfeksiyon oluşturan domates lekeli solgunluk virüsü (Tomato spotted wilt virus, TSWV) izolatlarının karakterizasyonu

Characterizaiton of tomato spotted wilt virus (TSWV) isolates causing infection in tomato fields in Amasya, Samsun and Tokat provinces

PDF İndir

  1. Tez No: 406157
  2. Yazar: BAHADIR ŞİN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. MİRAY SÖKMEN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Bitki virüsleri, Domates, Domates lekeli solgunluk virüsü, Lycopersicon esculentum, Plant viruses, Tomato, Tomato spotted wilt virus, Lycopersicon esculentum
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Domates lekeli solgunluk virüsü (Tomato spotted wilt virus, TSWV), Dünya'da kültür bitkilerinde zarar yapan en tehlikeli 10 bitki virüsünden birisidir. Orta Karadeniz Bölgesi'nde Amasya, Samsun ve Tokat illerinde son yıllarda domates alanlarında TSWV' nin problem oluşturduğu gözlenmektedir. Bu tez çalışması kapsamında Amasya, Samsun ve Tokat illerinde domates üretimi yapılan alanlardan çeşit isimleri öğrenilerek, 2014 yılı içerisinde 510 adet simptomlu domates meyve ve yaprak örneği toplanmıştır. Alınan örneklerdeki TSWV'nin bulaşıklık durumu DAS-ELISA (Double antibody sandwich-enzyme linked immunosorbent assay) yöntemi ile belirlenmiştir. Elde edilen test sonuçlarına göre örneklerin % 16.1 (83)'inin TSWV ile enfekteli olduğu belirlenmiştir. Örneklerin illere göre bulaşıklık oranları; Amasya'da % 13.6, Samsun'da % 22.6, Tokat'ta ise % 13.5 olarak belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlara göre, özellikle TSWV'ye karşı dayanıklı olduğu bilinen bazı domates çeşitlerinde doğal şartlarda TSWV'nin enfeksiyon oluşturduğu tespit edilmiştir. ELISA absorbans değeri en yüksek olan örnekler seçilerek biyolojik ve moleküler çalışmalarda kullanılmıştır. Bu çalışmalar sırasında bazı izolatların çoğaltımında başarılı olunamamıştır. Çoğaltılan izolatlardan SÇ-13, SB-01, TP-16 ve AM-29 izolatlarının test bitkilerindeki reaksiyonları bakımından izolata göre herhangi bir farklılık belirlenememiştir.TSWV kılıf protein genine (N) spesifik primerler ile RT-PCR yöntemi kullanılarak SÇ-13, SB-01 ve TP-16 izolatlarının N geninin tamamını içine alan bölge çoğaltılmış ve daha sonra nükleotit dizisi elde edilmiştir. İzolatların sekans verileri GeneBank (NCBI)'a kayıt edilmiştir. İzolatların kendi aralarındaki ve diğer izolatlar ile olan genetik ilişkileri incelenmiştir.

Özet (Çeviri)

Ranking among the top 10 most economically important plant viruses worldwide, Tomato spotted wilt virus (TSWV) causes significant problems in tomato growing areas in the world. It has been noticed that TSWV is one of the main tomato disease agent in Amasya, Tokat, Samsun provinces in the Black Sea Region. Surveys was carried out in tomato growing areas located in these provinces in 2014, and a total of 510 leaf and fruit samples were collected. The incidence of TSWV in the samples were examined by DAS-ELISA (Double antibody sandwich-enzyme linked immunosorbent assay). According to ELISA results, 83 samples (16.1%) were found to be infected with TSWV. The incidences of TSWV infections in three provinces were 13.6%, 22.6% and 13.5% in Amasya, Samsun and Tokat, respectively. According to symptom appearance and ELISA results, it was determined that some TSWV isolates are able to infect some tomato cvs. which are known as TSWV-resistant. The samples giving high ELISA absorbance values were selected and used in biological characterisation and molecular studies. Mechanical inoculation and propagation studies of some TSWV isolates in herbaceous hosts were not successful. No differences were observed in host reaction studies according to TSWV isolates of SC-13, SB-01, TP-16 and AM-29, after mechanical inoculation.RT-PCR were applied with primers spesific to N gene encoding the caot protein region of TSWV, and the nucleotide sequences of the isolates, SC-13, SB-01 and TP-16, were obtained and depozited in GeneBank (NCBI). Genetic relationships among TSWV isolates were investigated.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    457280

    Orta Karadeniz bölgesinde hale yanıklığı (Pseudomonas savastonoi pv. phaseolicola) ile adi yaprak yanıklığı (Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli) etmenlerinin belirlenmesi ve fasulye hatlarının bu hastalıklara karşı reaksiyonları

    Identification of bean halo blight (Pseudomonas savastanoi pv. phaseolicola) with bean common bacterial blight (Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli) diseases and determination of their reactions on bean lines at Middle Black Sea region

    DEMET ÇELİK ERTEKİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Bilim ve TeknolojiGaziosmanpaşa Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ÖZER ÇALIŞ

    PROF. DR. YUSUF YANAR

  2. Tez No

    86263

    Samsun alt bölgesinin (SMAB) sosyo-ekonomik analizi -uygulamalı bir yaklaşım-

    Başlık çevirisi yok

    MUSTAFA AYYILDIZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    EkonomiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    İktisat Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. METİN BERBER

  3. Tez No

    376113

    Tr 83 bölgesinde süt ve süt ürünleri tüketiminde tüketici davranışlarını etkileyen faktörler ve talebinin belirlenmesi

    Determining the factors and the demand affecting consumer attitudes in consuming milk and dairy products in Tr83 region

    RÜVEYDA KIZILOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    EkonomiGaziosmanpaşa Üniversitesi

    Tarım Ekonomisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HALİL KIZILASLAN

  4. Tez No

    653075

    Sığır beslemede kullanılan bazı yem hammadde ve karma yemlerin besin değerlerinin kimyasal analiz ve yakın kızılötesi spektroskopi yöntemleri ile belirlenmesi

    Determination of nutritional values of some feed raw materials and compound feeds used in cattle feeding by chemical analysis and near infrared spectroscopy method

    HARUN OCAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Veteriner HekimliğiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Hayvan Besleme ve Beslenme Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMAİL KAYA

  5. Tez No

    282283

    Multipl Skleroz'un Orta Karadeniz Bölgesindeki prevalansı ve hastaların demografik özellikleri

    The prevalence of Multiple Sclerosis in Middle Black Sea Region and demographic characteristics of patients

    NESLİHAN ÜNAL AKDEMİR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    DemografiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Nöroloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MURAT TERZİ

Geri Dön