Determination of genetic diversity and population structure in faba bean (Vicia faba L.)
Baklada (Vicia faba L.) genetik çeşitlilik ve populasyon yapısının belirlenmesi
- Tez No: 405205
- Danışmanlar: PROF. DR. ANNE FRARY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bakla (Vicia faba L.), tohumunun yüksek protein ve nişasta içeriğinden dolayı önemli bir baklagil türüdür. Bakla, değişik iklim koşullarında yetiştirilebilmektedir ve kök sisteminin azot bağlayan bakteriler ile oluşturduğu simbiyotik ilişki sayesinde ideal bir rotasyon bitki türüdür. Dünya genelinde pek çok ülkede taze sebze olarak tüketilir. Ancak, bakla germplazmlarının barındırdığı genetik çeşitliliğin karakterizasyonuna ilişkin çalışmalar yetersiz olup, bu baklagil türü için sistematik ıslah programları da oluşturulmuş değildir. Önerilen projenin esas amacı, ETAE, ICARDA, CGN, NGB ve Adelaide Üniversitesi'nden temin edilen bakla germplazmlarının genetik çeşitlilik ve populasyon yapısı bakımından kapsamlı bir şekilde incelemesinin yapılmasıdır. Bu amaçla, 259 bakla germplasmı 32 adet SSR primeri ile karakterize edilmiştir. Toplamda, 302 polimorfik SSR fragmenti analiz edilmiştir. Bakla örnekleri, Neighborjoining algoritması (r = 0.9062) ile analizi sonucunda coğrafi orijin ve tohum büyüklüğüne göre iki ana kümeye ayrılmıştır. Popülasyon yapısının belirlenmesi için STRUCTURE 2.2.3 programı kullanılmıştır. K, 2 alt popülasyon olarak tespit edilmiştir. Küme 1'de 87, küme 2'de 162 ve hiçbir gruba bağlı olmayan 10 birey vardır. Genetik olarak iyi karakterize edilmiş 45 bakla bireyi çekirdek koleksiyon oluşturmak için seçilmiştir. Bu koleksiyon daha sonraki ıslah çalışmalarında kullanılabilecektir.
Özet (Çeviri)
Faba bean (Vicia faba L.) is an important legume species because of the high protein and starch content of its seeds. Broad bean can be grown in different climatic conditions and is an ideal rotation crop because of the symbiotic relationship between the plant and nitrogen fixing bacteria in its roots. Broad bean seeds are consumed as fresh vegetables in many countries throughout the world. However, the genetic diversity found in this germplasm has not yet been characterized and has not been systematically used in broad bean breeding programs. In this project, faba bean individuals obtained from International Center for Agricultural Research in the Dry Areas (ICARDA), Centre for Genetic Resources (CGN), Aegean Agricultural Research Institute (AARI), Nordic Gene Bank (NGB) and Australia (The University of Adelaide, Jeffrey Paull) were examined for their genetic diversity and population structure. For this purpose, 259 faba bean germplasm accessions were characterized using 32 SSR primers. A total of 302 polymorphic SSR fragments were analyzed. According the results, faba bean individuals were divided into two main clusters based on Neighbor-joining algorithm (r = 0.9062) with some clustering based on geographical origin as well as seed size. STRUCTURE 2.2.3 program was used to determine population structure. K was determined as 2 subpopulations. Cluster 1 had 87 individuals; cluster 2 had 162 individuals and 10 individuals were intermixed with results generally agreeing with the dendrogram analysis. A total of 45 well-characterized faba bean individuals were selected for the core collection to be used in breeding studies.
Benzer Tezler
- Determination of genetic diversity and population structure in eggplant
Patlıcan genetik çeşitliliğın ve populasyon yapısının belirlenmesi
TESFA ALTAYE
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ANNE FRARY
- Development of single nucleotide polymorphism markers using genotyping by sequencing technique for determination of genetic diversity and population structure in hazelnut
Fındıkta genetik çeşitlilik ve popülasyon yapısının belirlenmesi için dizileme ile genotipleme tekniği kullanılarak tek nükleotid polimorfizm markörlerinin geliştirilmesi
ERTUĞRUL GAZİ YANAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAMİ DOĞANLAR
- Geleneksel küflü peynirlere has küflerin genetik özelliklerinin ve Penicillium roqueforti çeşitliliğinin belirlenmesi ve elde edilen izolatların peynir üretiminde kullanımı
Identification of genetic characteristics of filamentous fungi isolated from traditional mold-ripened cheeses and determination of Penicillium roqueforti diversity and utilization of the obtained isolates in cheese production
HATİCE EBRAR KIRTIL
Doktora
Türkçe
2025
Mikrobiyolojiİstanbul Sabahattin Zaim ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BANU METİN
PROF. DR. MUHAMMET ARICI
- Mitokondri ve mikrosatellit DNA analizleriyle Türkiye denizlerindeki hamsi (Engraulis encrasicolus, L.) populasyonlarının genetik yapısının belirlenmesi
Determination of population genetic structure of European anchovy (Engraulis encrasicolus L.) in the Turkish seas using mitochondrial and microsatellite DNA analyses
SERAP ŞENOL TUNCAY
- Türkiye'de dağılım gösteren mezgit balığının (Merlangius merlangus Linnaeus, 1758) popülasyon genetiği yapısının moleküler yöntemlerle belirlenmesi
Determination of population genetic structure of whiting (Merlangius merlangus Linnaeus, 1758) distributed in Turkey by the using molecular methods
ÜMİT GÜR
Doktora
Türkçe
2023
Balıkçılık TeknolojisiOrdu ÜniversitesiBalıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YILMAZ ÇİFTCİ