Kanserde HINT1 gen ekspresyon analizi
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 399191
- Danışmanlar: PROF. DR. SEVGİ AKAYDIN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: HINT1, SOD1, kanser, gen ekspresyonu, HINT1, SOD1, cancer, gene expression
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Evrimsel açıdan yüksek oranda korunmuş olan HIT protein süper ailesinin üyesi Histidin Triad Nükleotid bağlayıcı protein1 (HINT1), memeli dokuları dahil çeşitli türlerde yaygın olarak eksprese edilen bir gendir. HINT1'in önemli bir tümör supresör gen olduğuyla ilgili giderek artan sayıda çalışma olmasına rağmen, onun tümör baskılama konusundaki etkinliği ve mekanizması halen tam olarak bilinmemektedir. Çalışmamızın başlıca amacı HINT1'in değişik kanserlerdeki gen ekspresyon oranlarındaki değişiklikleri incelemekti. Biz ayrıca onun antioksidan özelliği olup olmadığını da incelemeyi amaçladık. Çalışmamızda, RT-PCR yöntemiyle kolorektal, mide ve meme kanserlerinde HINT1'in ve SOD1' in normal ve tümör dokularında gen ekspresyon düzeyleri ölçülmüştür. HINT1'in ekspresyon değerleri, toplam 26 hastanın 14'ünde (%53.85), kolorektal kanseri olan 13 hastanın 8'inde (%61.54), meme kanseri olan 7 hastanın 3'ünde (%42.86) ve mide kanseri olan 6 hastanın 3'ünde (%50) tümör dokusunda normal dokuya oranla daha düşük olduğu gözlenmiştir. Bununla birlikte, HINT1'in tümörlü doku ortalama ekspresyon düzeyleri normal dokulardakinden istatistiksel olarak anlamlı olmasa da yüksek bulunmuştur (p>0.05). Tümör dokularındaki SOD1 ekspresyon değerlerinin, ilginç olarak, toplam 26 hastanın 10'unda (10/26, %38.46), kolorektal kanseri olan 13 hastanın 6'sında (%46.15), meme kanseri olan 7 hastanın 2'sinde (%28.57) ve mide kanseri olan 6 hastanın 2'sinde (%33.33) normal dokuya göre daha az olduğu tespit edilmiştir. Total kanser hastalarının normal dokularında (R=0.768, p<0.0001), kolorektal kanser hastalarının hem normal (R=0.753, p< 0.005) hem de tümör dokularında (R=0.768, p<0.0001), ve mide kanseri hastalarının normal dokularında (R=0.945, p<0.0001) HINT1 ve SOD1 gen ekspresyonları arasında yüksek korelasyon olduğunu gözledik. Meme kanserli hastaların, sadece tümör dokusunda (R=0.758, p<0.05) HINT1 ve SOD1 gen ekspresyonları arasında zayıf pozitif bir korelasyon vardı.Çalışmamızda elde edilen sonuçlara göre, diğer kanserlerde olmasa da, kolorektal kanserli hastaların çoğunda tümör dokusunda azalan HINT1 gen ekspresyonları, bu kanser türünde HINT1'in tümör supressör özelliğini destekler niteliktedir. Ayrıca iyi bilinen bir antioksidan olan SOD1 ile HINT1 arasındaki yüksek korelasyon, HINT1'in bir tümör supressör gen olmasının yanı sıra, p53 gibi bir antioksidan olarak değerlendirilebileceğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Histidine triad nucleotide-binding protein (HINT1), a member of the evolutionary highly conserved HIT protein superfamily, is ubiquitously expressed in diverse species including mammalian tissues. Although an increasing number of studies show that HINT1 is an important tumor suppressor gene, its effectiveness and mechanism of tumor suppression is still unclear. The main purpose of this study was to investigate the changes of HINT1 gene expression rates in various cancers types. We also aimed to study its antioxidant properties by comparing with SOD1, is a well-known antioxidant. The gene expression levels of HINT1 and SOD1 were measured by RT-PCR method in normal and tumor tissues in colon, gastric, and breast cancers. HINT1 expression values were observed to be lower in tumor tissues of 14 of the total 26 patients (%53.85), 8 of 13 patients with colorectal cancer (%61.54), 3 of the 7 patients with breast cancer (%42.86), and 3 of 6 patients with gastric cancer (%50) than in normal tissues . However, the mean levels of HINT1 expression in tumor tissue were higher, but not statistically significant, than those in normal tissues. However, the mean levels of HINT1 expression in tumor tissue were higher, but not statistically significant, than those in normal tissues. Interestingly, SOD1 expression values were found to be lower in tumor tissues of 10 of the total 26 patients (%38.46), 6 of 13 patients with colorectal cancer (%46.15), 2 of the 7 patients with breast cancer (%28.57), and 3 of 6 patients with gastric cancer (%33.33) than in normal tissues. We observed high positive correlations between HINT1 and SOD1 gene expressions in normal tissues (R=0.768, p<0.0001) of total cancer patients, in both normal (R=0.753, p< 0.005) and tumour tissues (R=0.919, p<0.0001) of colorectal cancer patients, and in normal tissues (R=0.945, p<0.005) of gastric cancer patients. There was a weak positive correlation between HINT1 and SOD1 gene expressions in tumour tissue (R=0.758, p<0.05) of patients with breast cancer. According to the results obtained in this study, the decreasing HINT1 gene expressions in tumor tissue in the majority of patients with colorectal cancer support tumor suppressor effect of HINT1 in this type of cancer, but not in other cancers. In addition, high correlation between SOD1, well-known antioxidat enzyme, and HINT1 show to be able to evaluate as an antioxidant rather than a tumour supressor gene.
Benzer Tezler
- Malign melanoma olgularında EGFR, TP53, P16 ve MDM2 genlerinin FISH ile değerlendirilmesi
Evaluation of EGFR, TP53, P16 and MDM2 genes in malignant melanoma cases by FISH
TOLGA TÖRE
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
GenetikEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BEYHAN DURAK ARAS
- Kras mutant larinks kanseri hücrelerinde timokinonun etki mekanizmasının incelenmesi
Investigation of thymoquinone effect on laryngeal cancer cells with kras mutant
VİLDAN BETÜL YENİGÜN
- Kurkumin-oksim bileşiğinin sentezi, karakterizasyonu ve antioksidan özelliklerinin değerlendirilmesi
Synthesis, characterization and evuluation of antioxidant properties of curcumin-oxime compound
HAMİYET AKGÜN GÜLEN
- Çoklu metal (Cd, pb, zn) ile kirlenmiş toprakların fitoremediasyon ve immobilizasyonla arıtımında zeolit, nanozeolit ve edds uygulamasının etkisi ve sağlık risk analizi
The effect of zeolite, nanozeolite and edds application on the treatment with phytoremediation and immobilization of contaminated soils by multiple metal (Cd, pb, zn) and the health risk analysis
ALİ ÇİFTÇİ
Doktora
Türkçe
2020
Çevre MühendisliğiMersin ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURCAN KÖLELİ
- Asetovanilon türevli yeni benzil eterlerin sentezi, karakterizasyonu, teorik analizleri ve biyolojik aktivitelerinin araştırılması
Synthesis, characterization, theoretical analyses, and investigation of their biological activities of acetovanillone-derived novel benzyl ethers
NAZİRE MERVE ÇALKILIÇ