Hakkari ili bal arılarında (Apis mellifera L.) görülen önemli arı virüslerinin RT-PCR yöntemi ile araştırılması ve moleküler karakterizasyonlarının yapılması
Molecular characterization and the investigation of important honey bee (Apis mellifera L.) viruses in Hakkari province (Turkey) by using RT-PCR
- Tez No: 398724
- Danışmanlar: PROF. DR. HİKMET MURAT SİPAHİOĞLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Yürütülen bu çalışma ile; Hakkari ili bal arılarındaki Deforme kanat virüsü (Deformed wing virus; DWV), Siyah kraliçe hücre virüsü (Black queen cell virus; BQCV), Akut arı felç virüsü (Acute bee paralysis virus; ABPV), İsrail akut felç virüsü (Israeli acut paralysis virus; IAPV), Torba yavru çürüklüğü virüsü (Sacbrood virus; SBV), Kaşmir arı virüsü (Kashmir bee virus; KBV) ve Kronik arı felç virüsü (Chronic bee paralysis virus; CBPV) infeksiyonlarının varlığı ve yaygınlıkları RT-PCR yöntemi ile araştırılmıştır. Moleküler teşhiste kullanılmak üzere araştırılacak her bir virüs genomuna spesifik primerler tasarlanmıştır. Toplam 90 arılıkta araştırılan virüslerden BQCV %32,2, DWV %23,3, SBV %12,2, CBPV %8,8 ve ABPV ise %2,2 oranında tespit edilmiştir. Testlenen örneklerin hiçbirinde KBV ve IAPV infeksiyonuna rastlanmamıştır. Teşhis çalışmaları arıların tekil, ikili ve üçlü infeksiyonlara maruz kaldığını ortaya koymuştur. Test edilen arılıklardaki tekil infeksiyonlar %35,5, ikili infeksiyonlar %20, üç virüsle infeksiyon olanı ise %1,1 olarak tespit edilmiştir. Teşhisi gerçekleştirilen beş virüs (BQCV, DWV, CBPV, ABPV ve SBV) Hakkari ili için, bunlardan SBV ve ABPV ise ülkemiz için ilk kayıt niteliğindedir. Tespit edilen her virüs türünden rastgele seçilen birer izolatın kısmi genom karakterizasyonları gerçekleştirilmiştir. DWV ve CBPV izolatlarının RdRp genlerine, BQCV, ABPV ve SBV izolatlarının ise kılıf protein (CP) genlerine ait kısmi dizileri tasarlanan genom spesifik primerler ile çoğaltılmış ve moleküler klonlamaları gerçekleştirilmiştir. Gen bankasında yer alan dünyadaki diğer izolatlarla yapılan karşılaştırmalar sonucunda; BQCV'nin %89-90 oranında, DWV'nin %96-99 oranında, SBV'nin %77-90 oranında, CBPV'nin % 85-86 oranında ve ABPV'nin ise %85-97 oranında benzerlik gösterdiği tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
The present study investigates the existence and prevalence of the infections of Deformed wing virus (DWV), Black queen cell virus (BQCV), Acute bee paralysis virus (ABPV), Israeli acut paralysis virus (IAPV), Sacbrood virus (SBV), Kashmir bee virus (KBV) and Chronic bee paralysis virus (CBPV) by RT-PCR method in Hakkari province of Turkey. Specific primers were designed for the genome of each virus in order to use for the molecular detection of these viruses. These seven viruses were investigated in 90 apiaries in total. KBV and IAPV could not be detected in any apiaries, the other five viruses' frequencies are varied: BQCV was detected in 32,2% of apiaries, DWV in 23,3%, SBV in 12,2%, CBPV in 8,8% and ABPV in 2,2%. The identification tests showed that many apiaries were infected with one or more viruses: 35.5% of apiaries were positive for a single infection, 20% a double infection and 1.1% a triple infection. In Hakkari province of Turkey, this is the first report for the five viruses. This is also the first record of SBV and ABPV in Turkey. For each identified virus species, a virus isolate was selected randomly, and its partial genomes were characterized. For BQCV, ABPV and SBV partial coat protein (CP) codons and for DWV and CBPV partial RdRp codons were characterized, cloned and sequenced with the specific primers. As a result of blast analysis of NCBI database, the sequenced Hakkari's isolates of BQCV, DWV, SBV, CBPV and ABPV heve been showed nucleic acid similarity as compared to the other regions in the world: 89-90%, 96-99%, 77-90%, 85-86% and 85-97% respectively.
Benzer Tezler
- Doğu Avrupa gelişmeleri -Türkiye'ye etkileri-
Başlık çevirisi yok
MEHMET ERDEM
Yüksek Lisans
Türkçe
1993
Uluslararası İlişkilerİstanbul ÜniversitesiUluslararası İlişkiler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BENER KARAKARTAL
- Hakkari ili ballarında polen analizi
Pollen analysis of the honeys which are produced from Hakkari region
GALİP SARISU
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyolojiAtatürk ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CAHİT DOĞAN
DOÇ. DR. ÜMİT İNCEKARA
- Bal arısı yetiştiriciliğinde yerel kışlatma alanlarının belirlenmesi - Cizre örneği
Determination of lokal wintering areas in honey bee-Cizre example
ÖNDER ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CENGİZ ERKAN
- Van ve İran bal arısı popülasyonlarının geomorfometrik yöntemlerle karşılaştırmalı analizi
Comparative analysis of Van and Iran honey bee populations using geomorphometric methods
SİMANUR AKÇAKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CANSU ÖZGE TOZKAR
DR. ÖĞR. ÜYESİ CENGİZ ERKAN