Geri Dön

Potential role and application of trehalose in the mirna dependent embryonic development of caenorhabditis elegans

Caenorhabditis elegans organizmasında trehalozun mirna ilişkili embriyonik gelişimdeki olası rolü

PDF İndir

  1. Tez No: 397277
  2. Yazar: EKİN GÜNEY
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. FUNDA ŞAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Trehaloz, C. elegans, miRNA'lar, embriyonik ölüm fenotipi, pash-1 (mj100), Trehalose, C. elegans, miRNAs, embryonic lethality, pash-1(mj100), mir-35(ndf50), mir-52(ndf58)
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Koç Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

MiRNA'lar neredeyse tüm biyolojik süreçlerde rol oynayan önemli bir protein kodlanmayan RNA sınıfıdır. Caenorhabditis elegans bir karasal nematoddur ve miRNA'lar bu organizmada bu organizmada bulunmuş ve neredeyse bütün gelişim süreçlerinde önemi gösterilmiştir. Çalışmada pash-1(mj100) suşu kullanılmıştır. pash-1 geni miRNA biyosentezinde görevli olan PASH-1 (PASHA) proteinini kodlamaktadır. pash-1ts suşunda sıcaklığın yükseltilmesiyle, miRNA biyosentezinin ilk aşamasının engellenmesinden dolayı miRNA üretilmemektedir. pash-1ts suşu, 25°C'de büyütüldüğünde erken yaşlanmaktadır. Ayrıca, pash-1ts suşunun 25°C'de üretilen embriyoların hiçbiri L1 evresine geçemez. miRNA'ların yaşlanmadaki rollerini anlamaya çalışırken kullandığımız kimyasalların biriyle son derece ilginç bir fenotip gözlemledik. Trehalozun varlığında pash-1 mutant hayvanlarının embriyonik ölüm fenotipi kurtarılabildi. Trehaloz, indirgeyici olmayan disakkarid [α-D-glukopiranosil- (1 → 1) -α-D-glukopiranozid] iki glükoz molekülü taşımaktadır. Trehaloz bakteriler, mayalar, mantarlar, böcekler, omurgasız ve bitkiler gibi çeşitli organizmalarda mevcuttur. Bu çalışmada, biz miRNA biyogenezinden yoksun C. elegans embriyogenezin üzerindeki trehalozun etkileri üzerinde duruldu. Trehalozun embriyo ölüm fenotipini neden hafiflettiğini anlamak amacıyla, trehaloza paralel olarak, çeşitli diğer kimyasallar da test edilmiştir. Ancak, diğer kimyasallar trehaloz gibi kurtarıcı etki göstermemiştir. Sadece, prolin ve serin trehalozla benzer etkilere sahiptir. Bu çalışmada ilk kez bir kimyasalın miRNA ilişkili bir fenotip üzerinde iyileştirici etkisi gösterilmiştir.

Özet (Çeviri)

MicroRNAs (miRNAs) are an essential class of non-coding RNAs that post-transcriptionally repress mRNAs. miRNAs were first identified in Caenorhabditis elegans as important regulators of developmental timing. Since then, miRNAs have been shown roles in nearly all biological processes. Most important process in which miRNAs take place is developmental processes. Caenorhabditis elegans is a terrestrial nematode and a widely used model organism for studying biological processes development and aging related to miRNA gene function. A conditional allele of miRNA biogenesis gene, pash-1 allows to regulate miRNA production by simply changing the growth temperature in worms. Grown at 15°C, pash-1 mutant animals have normal miRNA levels and shifting the temperature to 25°C ceases miRNA production and leads to rapid ageing, motility defects and embryonic lethality. In our efforts to understand the roles of miRNAs in ageing, we observed a highly interesting phenomenon with one of the chemicals under investigation. Growing the pash-1 mutant animals in the presence of trehalose rescued the embryonic lethality phenotype at 25°C. Trehalose is a non-reducing disaccharide [α-D-glucopyranosyl-(1→1)-α-D-glucopyranoside] of glucose. Trehalose is present in a variety of organisms such as bacteria, yeasts, fungi, insects, invertebrates and plants. C. elegans accumulate detectable amount of trehalose in embryonic and dauer stages of C. elegans. However, the importance of trehalose for developmental processes or its physiology remains to be explored in this model organism. In this study, we focused on the effects of trehalose on the embryogenesis of C. elegans that lacks miRNA biogenesis. While trehalose rescued the embryonic lethality of pash-1(mj100) and mir-35 loss of function mutants, it failed to rescue embryonic lethality of miRNA independent temperature-sensitive embryonic lethal mutants, indicating the specificity of the trehalose effect. Trehalose can function as a chemical chaperone, autophagy inducer, a metabolite and a signaling molecule. In order to understand how trehalose alleviates embryonic lethality phenotype, we tested various chemicals in parallel to trehalose. We showed that autophagy inducer rapamycin does not have the same effect on the embryonic lethality. However, two chemical chaperones proline and serine have similar effects on embryonic lethality as trehalose does. Further efforts will be required to understand how trehalose affects miRNA function in embryogenesis, however, as this is the first time a chemical has been shown to rescue miRNA-related defect, this will have great impact on efforts in developing therapies in various diseases resulting from the loss of miRNA gene function.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    540402

    Use of Swat model to assess the potential evapotranspiration value and the spatial distribution of groundwater recharge rate application to the Dogger aquifer in Poitou-Charantes

    Fransa'nın Poitou-Charantes bölgesinde bulunan Dogger akifer'inde potansiyel su kaybı ve mekansal yeraltı suyu girdisi dağılımı için Swat modelinin kullanımı

    ESRA GÜLŞEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Jeoloji MühendisliğiMuğla Sıtkı Koçman Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BEDRİ KURTULUŞ

    YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA CAN CANOĞLU

  2. Tez No

    435368

    Alışveriş merkezleri geliştirme ve pazarlamasında kuruluş yerinin rolü ve önemi: İzmir kent ölçeğinde bir uygulama

    The role and the importance of location decısıon in shopping center development and marketing ; An İzmir application

    ALEV DENİZ ŞENGÖR ÖZEGELİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    İşletmeYaşar Üniversitesi

    İşletme Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖMER BAYBARS TEK

  3. Tez No

    135579

    Elektronik veri değişimi (EDI) uygulamalarının tedarik zinciri yönetimindeki rolü, ticari ilişkilere etkisinin Türkiye'deki durumu ve kavramsal model önerisi

    The Role of EDI (electronic data interchange) application in supply chain and it's effects on trading partner relationships in Turkey and proposed conceptual model

    AYÇA BABA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Endüstri ve Endüstri MühendisliğiÇukurova Üniversitesi

    Endüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. OYA YÜREĞİR

  4. Tez No

    64134

    Turizmin bölgesel ekonomik kalkınmadaki rolü ve uygulama örneği olarak Eğirdir yöresi

    The Role of tourism in respect of economical development and the region Eğirdir as application model

    MUSTAFA ÖZER ALPAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    EkonomiBalıkesir Üniversitesi

    Turizm İşletmeciliği ve Otelcilik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BURHAN AYDEMİR

  5. Tez No

    661791

    DLD-1 insan kolon kanseri hücre hattında TRP (geçici reseptör potansiyel) kanallarının rolü ve karvakrolün etkileri

    The role of TRP (transient receptor potential) channels in the DLD-1 human colon cancer cell line and the effects of carvacrol

    EZGİ BABAEREN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    FizyolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Fizyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YASEMİN AYDIN

Geri Dön