β-giardin ve glutamate dehydrogenase geni kullanılarak giardia intestinalis'in genotiplendirilmesi ve filogenetik analizi
Genotyping of giardia intestinalis using β-giardin and glutamate dehydrogenase gene: A phylogenetic analysis
- Tez No: 390786
- Danışmanlar: PROF. DR. SALİH KUK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Parazitoloji, Parasitology
- Anahtar Kelimeler: DNA analizi, Genotip, Giardiasis, Glütamat dehidrogenaz, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, DNA analysis, Genotype, Giardiasis, Glutamate dehydrogenase, Polymerase chain reaction
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Parazitoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Giardiosis; çocuklarda, malabsorbsiyon ve malnütrisyona bağlı olarak akut ve kronik ishal, zihinsel-bedensel gelişme geriliği, karın ağrısı, alerji; yetişkinlerde ise yine akut/kronik ishaller gibi çeşitli klinik tablolarla ortaya çıkarken bazı bireylerde ise asemptomatik enfeksiyonlara neden olmaktadır. Klinik belirtilerin değişkenlik göstermesinde Giardia intestinalis farklı genotiplerinin sorumlu olabileceği düşünülmektedir. Moleküler biyolojik ve izoenzim çalışmaları ile G. intestinalis genotipleri belirlenebilmektedir. G. intestinalis'in genotiplendirilmesini ve filogenetik analizini yapmak amacıyla; proje kapsamında G. intestinalis'in gdh genine ait 432 kb uzunluğundaki bölge ve β-giardin genine ait 753 bp uzunluğundaki bölgeler PCR yapılarak amplifiye edilmiştir. gdh genine ait PCR ürünü Rsa I ve Nla IV enzimi ile kesilmiş ve bant profilleri elde edilmiştir. β- giardin geninin uzun parçasına ait PCR ürünü HaeIII, kısa parçasına ait PCR ürünü ise Hha I enzimi ile kesilmiş ve bant profili elde edilmiştir. Buna göre gdh geni bakımından 24 izolat BIII ve BIV alt gruplarına benzer profil verirken, β-giardin geni bakımından kesim enzimlerine göre 20 izolat A grubuna benzer profil vermiştir. Ayrıca, laboratuarımıza gelen izolatlara ait PCR ürününden gdh ve β-giardin genlerinin dizi bilgisini elde etmek için DNA dizi analizi yapılmıştır. Filogenetik analiz sonucunda ise; incelenen tüm örneklerin, A genotipine dahil oldukları tespit edilmiştir. Sonuç olarak; gdh ve β-giardin genlerini hedef alan çalışmamızda bu genlerin filogenetik açıdan Giardia genotiplerini belirlemede yeterli ve güvenilir olduğu sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
Giardiosis; In children, malabsorption and malnutrition due to acute and chronic diarrhea, mental-physical growth retardation, abdominal pain, allergies; In adults still acute / chronic diarrhea elicited various clinical manifestations in some individuals with asymptomatic infection causes. We thought that display the variety of clinical symptoms of Giardia intestinalis due to the fact that different genotypes. G. intestinalis genotypes could detect with molecular biology and isoenzyme study. In order to be genotyped and phylogenetic analysis of G. intestinalis; within the project, 753 bp in length regions of β-giardin gene and 432 bp in length regions of gdh genes belonging to G. intestinalis were amplified by PCR. PCR product of gdh, long and small phragment of β-giardin genes were cut with Rsa I, HaeIII, HhaI enzymes, respectively. Then band profiles were obtained. Accordingly, in terms of gdh gene in 24 isolates have similar profiles with subgroups B III and B IV while, in terms of β-giardin gene in 20 isolates have a similar profile with group A according to the enzyme digestions. In addition to, DNA sequence analysis was done for because of learning knowledge of gdh and β-giardin genes diversity. As a result of phylogenetic analysis; of the total samples, were found to be included in the genotype A. As a result; in our study which is targeted gdh and β-giardin genes, these genes were concluded that are sufficient and reliable in determining Giardia genotypes phylogenetically.
Benzer Tezler
- Kedi ve köpeklerde giardiasis ve moleküler teşhisi
Giardiasis and moleculer diagnosis in cats and dogs
BEYZANUR SATAŞMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Veteriner HekimliğiErciyes ÜniversitesiVeterinerlik Parazitolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ARİF ÇİLOĞLU
- Atlarda giardia intestinalis'in moleküler prevalansı ve genotiplendirilmesi
Molecular prevalence and genotyping of giardia intestinalis in horses
KÜBRA DEMİRCAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Veteriner HekimliğiErciyes ÜniversitesiVeterinerlik Parazitolojisi Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ZUHAL ÖNDER
- Giardia duodenalis ile doğal enfekte buzağılarda tek doz seknidazol'ün sağaltım etkinliğinin araştırılması
Investigation on single dose secnidazole treatment efficiency against naturally occuring giardia duodenalis infection in calves
KEMAL GÖKTUĞ TOROS
Doktora
Türkçe
2016
Veteriner HekimliğiAdnan Menderes ÜniversitesiVeterinerlik İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEREM URAL
- İnsan meme kanserlerinde β-catenin stabilitesi, frizzled ve cyclin-D1 proteinlerinin ekspresyonu ve prognoz ile ilişkisi
β-catenin stability, frizzled and cyclin D1 proteins expression in human breast cancer and its relation with their prognosis
BAHA ZENGEL
Doktora
Türkçe
2004
OnkolojiDokuz Eylül ÜniversitesiTemel Onkoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERAL SAKIZLI