Geri Dön

Mısır (Zea mays L.) ve mısır pası (Puccinia sorghi Schw.) interaksiyonunda ekspresyonu değişim gösteren mRNA'ların tanımlanması, sekans karakterizasyonu ve interaksiyonda rollerinin değerlendirilmesi

Identification, sequence characterization and determination of the roles mRNAs, expression of which are modulated in the interaction between Maize (Zea mays L.) and common maize rust (Puccinia sorghi Schw.)

  1. Tez No: 390402
  2. Yazar: NEVZAT PARLAK
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MEHMET ALİ SÜDÜPAK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Mısır, mısır pası, bitki-fungus interaksiyonu, cDNA-AFLP, Corn, common corn rust, plant-fungus interaction, cDNA-AFLP
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Bozok Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışmada, modifiye cDNA-AFLP tekniği kullanılarak, mısır (Zea mays) ve mısır pası (Puccinia sorghi) interaksiyonunda ekspresyonu değişim gösteren 100 cDNA-AFLP fragmenti tanımlanmış, bunlar klonlanarak 68 tanesinin değerlendirilebilir sekansı elde edilmiştir. Sekansların gen bankası taramaları yapılarak en yakın benzerleri belirlenmiştir. Etiketlerden iki tanesi Rp3 pas direnç geni sekansına benzer iken birisi de pas orijinli trankript benzerleri olarak bulunmuştur. Sekansı yapılan diğer etiketlerin 12'si fotosentez, hücre metabolizması ve madde taşımada, beş tanesi protein sentezi, katlanması ve yıkımında, dokuzu sinyal iletimi, redoks durumu ve transkripsiyonel düzenlemede, geriye kalan 39 etiket sekansınında yapısal, hipotetik ve karakterize edilmemiş proteinleri ve diğer stres ile ilgili mesajları kodlayan mRNA'ların benzerleri oldukları bulunmuştur. Genel olarak bilinen fonksiyonlarla assosiye olan bu etiketlerin bitki-mikrop interaksiyonunda rol oynadıkları görülmektedir. Bu sonuçların önemli verim kayıplarına neden olan mısır pasına direncin karakterizasyonuna, mısır ve mısır pası interaksiyonunda gerçekleşen olayların moleküler detaylarının ortaya çıkarılmasına katkı sağlaması beklenmektedir.

Özet (Çeviri)

In this study, using a modified cDNA-AFLP technique, 100 cDNA-AFLP fragments, expressions of which are modified in corn (Zea mays) and corn rust (Puccinia sorghi) interaction, have been identified. They were cloned, sequenced, and 68 of which yielded clear sequencing results. The closest sequence similars of these sequences were determined by screening Genebank database. Two of these tags appeared to be similar to the Rp3 sequence, while one tag appeared to be similar to a rust originated transcript. 12 of the remaining tags were found to be similar to the genes encoding protein functioning in photosynthesis, cell metabolism and transport, five tags were found to be similar to the sequences encoding functions protein synthesis, folding and catabolism. The nine tag sequences were found to be similar to the sequences encoding functions signal transduction, redox status and transcriptional regulation, and the remaining 39 tag sequences were identified as similars of mRNA sequences encoding structural, hypothetic and uncharacterized proteins and other stress-related messages. Overall, the majority of tags which were found to be associated with known functions, appear to play a role in plant-microbe interactions. The results are expected to shed some light on characterization of resistance to common corn rust, the molecular details of the interaction occurring between corn and the common corn rust, which causes significant damages to the corn production.

Benzer Tezler

  1. 3um N-kuyu CMOS teknolojisi ile test kırmığı tasarımı ve tranzistor eşik gerilimi ayarı

    Test chip design for 3 um N-well CMOS fabrication technology and threshold voltage adjustment

    ZEYNEP D. TOROS

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1991

    Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    PROF.DR. DURAN LEBLEBİCİ

  2. Mısır (Zea mays L.) ve börülce (Vigna sinensis L.)'nin ikinci ürün olarak birlikte yetiştirmenin yeşil ot verimi ve bazı tarımsal karakterlere etkilerinin araştırılması

    Corn (Zea mays L.) and vigna (Vigna sinensis L.) double crop and effeccts of intercropping on biomas yield and related charecters were evaluated

    NİL GÜREL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    ZiraatHarran Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA OKANT

  3. Mısır (Zea mays L.) ve buğdayın (Triticum aestivum L.) kuraklık streslerine karşı dayanıklılıklarının biyokimyasal ve fizyolojik parametreler ile belirlenmesi

    Determination of drought stress tolerance of maize (Zea mays L.) and wheat (Triticum aestivum L.) with biochemical and physiological parameters

    ZELİHA ÖZDEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiGiresun Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZAFER TÜRKMEN

    YRD. DOÇ. DR. ÖZLEM ARSLAN

  4. Mısır (Zea mays l.) ve sorgumun (Sorghum bicolor l.) farklı bitkilerle birlikte yapılan silajlarının karşılaştırılmaları

    Comparisons of maize and sorghum silages mixed with different plants

    MEHMET ARSLAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    ZiraatAkdeniz Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SADIK ÇAKMAKÇI

  5. Mısır (Zea mays L.) ve Yonca (Medicago sativa L.) bitkilerinin farklı oranlarda karıştırılmasıyla elde edilen silajların kalite özelliklerinin belirlenmesi

    Determination of quality characteries of silages obtained by mixing corn (Zea mays L.) alfalfa (Medicago sativa L.) plants at differnet rates

    ADEM TÜRKER BÜYÜKUYSAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatAkdeniz Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET ARSLAN