Geri Dön

Identification of complexes that interact with tRNA-derived small RNAs by gene expression methods.

tRNA kökenli küçük RNA'larla etkileşen komplekslerin gen ekspresyonu yöntemleriyle belirlenmesi.

PDF İndir

  1. Tez No: 387156
  2. Yazar: SANİYE ELVAN ÖZTÜRK
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. BÜNYAMİN AKGÜL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

tRNA, hayatın yaşamsal bir molekülü ve bir süredir biyokimyasal araştırmaların hedefi olmuştur. Son zamanlarda tRNA biyolojisinin yeni yönleri açığa çıkarılmaktadır. Biriken datalar, tRNA'nın amino asit kodlamak gibi bilinen rolünün yanında farklı biyolojik fonksiyonlarda da rolleri olduğunu göstermektedir. tRNA yarıları, tRNA molekülünün antikodon bölgesinin angiogenin tarafından kesilmesiyle üretilirler ve olgun tRNA'nın 5' ve 3' uçlarından üretilen daha küçük olan RNA fragmentleri (tRFs) de protein sentezinin inhibisyonu gibi en belli başlı biyolojik fonksiyonları da göstermektedirler. Çalışmamızda, tRF'ler ve RNA'ya bağlanan proteinler arasındaki etkileşimin gösterilmesi amaçlandı. Bu sebeple, insanlardaki TIA-1 ve LA proteinlerinin Drosophila homologu olan iki proteine (Rox8 ve La) karar verildi. Çalışmanın başında bu proteinlerin FLAG-işaretli versiyonları S2 hücrelerinde aşırı-ifade edildi. Sonrasında bu işaretli proteinler sayesinde immunopresipitasyon deneylerini gerçekleştirildi. Çalışmamızın sonunda tRF'ler ve tRF'lerle ilişkili proteinler arasındaki potansiyel ilişki meydana çıkarıldı.

Özet (Çeviri)

tRNA is a vital molecule of life and has been a focus of biochemical research since long. New aspects of tRNA biology have been drawn to light recently. Accumulating data indicates that tRNA has many diverse biological functions other than its canonical role in coding for amino acids. tRNA halves are produced by cutting the tRNA molecule from its anti-codon loop by angiognenin and even smaller RNA fragments (tRFs) produced from 5' or 3' ends of mature tRNA have been shown to have biological functions, most notable of which is the inhibition of the initiation of protein synthesis. In our study, the aim was to show the interaction between tRFs and RNA binding proteins. For this reason, two proteins were determined: Rox8 and D-La which are Drosophila homologs of human TIA-1 and La. In the beginning of study, we overexpressed FLAG-tagged versions of these proteins in S2 cells. Then immunoprecipitation experiments were performed with the tagged proteins. At the end of our research the potential interaction between tRFs and tRF related proteins are demonstrated.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    299165

    Investigation of tRNA-derived small RNAs in Drosophila melenogaster

    Drosophila melanogaster' de tRNA kaynaklı küçük RNA'ların araştırılması

    ÇAĞDAŞ GÖKTAŞ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    Genetikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BÜNYAMİN AKGÜL

  2. Tez No

    636315

    Sanal tarama ve çok boyutlu moleküler modelleme yöntemleri ile p53-MDM2 potansiyel inhibitörlerinin belirlenmesi

    Identification of p53-MDM2 potential inhibitors with virtual screening and multidimensional molecular modeling methods

    GÜLŞAH AYDIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Biyofizikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MİNE YURTSEVER

    PROF. DR. SERDAR DURDAĞI

  3. Tez No

    486584

    Identification of the interaction partners of anti-apoptotic BAG-1M isoform in breast cancer and breast epithelial cells

    Anti-apoptotik BAG-1M izoformunun etkileşim partnerlerinin meme kanseri ve meme epitel hücrelerinde tanımlanması

    NİSAN DENİZCE CAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Onkolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

  4. Tez No

    129226

    Identification of NOx species adsorbed on cobalt(II)-supported zirconia and sulfated zirconia and investigation of their reactivity toward methane

    Kobalt(II) depolanmış zirkonyum ve zirkonyum sülfat üzerine adsorbe olmuş NOx moleküllerinin tanımlanması ve metan ile tepkimesinin araştırılması

    AHMET SELİM VAKKASOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2002

    Kimyaİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MARGARİTA KANTCHEVA

  5. Tez No

    540282

    Synthesis, characterization, electronic structure and DNA binding abilities of platinum(II) complexes containing 2,3-di(2-thienyl)-quinoxaline ligand

    2,3-di(2-tiyenil)-kuinoksalin ligantı içeren platin(II) komplekslerininsentezi, karakterizasyonu, elektronik yapıları ve DNA'ya bağlanma kabiliyetleri

    WADAD S. S. FADEL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    KimyaAtılım Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞENİZ ÖZALP YAMAN

Geri Dön