Geri Dön

Meme kanseri kök hücrelerinin karakteristik özellikleri

Gene expression characteristics of breast cancer stem cells

  1. Tez No: 386498
  2. Yazar: SAİT MURAT DOĞAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SAFİYE AKTAŞ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Onkoloji, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Gen ifadesi, Kök hücreler, Meme neoplazmları, Neoplazm kök hücreleri, Neoplazmlar, Gene expression, Stem cells, Breast neoplasms, Neoplastic stem cells, Neoplasms
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Meme kanseri kadınlarda tüm dünyada temel halk sağlığı problemlerinden biridir. Gelişmiş ve gelişmekte olan ülkelerde, kadınlarda görülen en sık kanserdir. Kanser hücrelerinin küçük bir kısmının yeni tümör oluşumuna neden olabildiği ve bu hücrelerin tedaviye dirençli olduğu gösterildikten sonra, kanser kök hücreleri kanser tedavisinde yeni bakış açıları sunmuştur. Bu çalışmada , meme kanserinin gen ekspresyon profili ile onun kök hücrelerini farklı biyolojik özelliklerini esas alarak kıyaslanması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Farklı moleküler ve biyolojik özelliklerdeki dört meme kanseri hücre serisi kültüre edildi. ( MDA-MB-231: ER-PR-HER2-; MCF-7 (HTB-22): ER+PR+HER2-; BT474 (HTB-20): ER+PR+HER2+; T47D (HTB-133): ER+PR+HER2-). Bu hücreler pozitif kontrollerdi. Kanser kök hücreleri CD44+CD24- özellikleri göz önüne alınarak manyetik izolasyon yöntemiyle ayrıştırıldı. Hücrelerin her iki grubu için RNA izolasyonu ve cDNA dönüşümü yapıldı. Meme kanseri ile ilişkili 84 gen dizilim ekspresyonları RT-PCR ile değerlendirildi. Veri analizleri SABioscience web sayfasında yapıldı. Bulgular: Kanser kök hücreleri HTB-133 de VEGFA'nın gen ekspresyonu artarken MKI67 ve TFF3 azaldı. HTB-20 kanser kök hücrelerinde CTNBB1, CDKN1A, JUN, TFF3 azaldı. MCF-7 (HTB-22) kök hücrelerinde SLC39A6, TFF3, XBP1, RB1, MAPK3 artarken ADAM23, PLAU, GSTP1, BCL2, MMP2, MMP9, MGMT azaldı. MDA-MB-231 kök hücrelerinde ABCB1 ve SLC39A6 artarken MMP9 and MKI67 azaldı. Meme- kanseri hücreleri ve onların kök hücreleri arasında özellikle anjiogenezis, migrasyon, proliferasyon and DNA onarım genlerinin ekspresyonlarında farklılıklar belirlendi. Meme kanser hücreleri ve onların kök hücrelerinde AKT1, CTNNB1, THBS1, Tp53 ve XBP1 genlerinde artış olduğu tespit edildi. Sonuç: Verilerimiz meme kanseri için genel bir kanser kök hücresi bulunmadığını göstermektedir. Farklı genetik özellikte ve fenotipte farklı meme kanser kök hücreleri bulunmaktadır. Çalışmamız“meme kanseri başlatan hücreler ”kavramının ''meme kanseri kök hücreleri'' yerine kullanılmasının daha uygun olacağı düşüncesini desteklemektedir. Nihayi tedavi hedeflerinin, tüm bu genetik farklılıklar göz önüne alınarak planlanması gerektiğini düşünmekteyiz.

Özet (Çeviri)

Breast cancer in women is a major public health problem throughout the world. It is the most common cancer among women both in developed and developing countries. Cancer stem cells have gained new insights in cancer treatment after it was shown that only a small proportion of cancer cells retains the ability to form new tumors and these cells show resistance to therapy. In this study we aimed to compare gene expression profile of breast cancer and their stem cells in different biologic characteristics. Four breast cancer cell lines in different molecular and biologic characteristics (MDA-MB-231: ER-PR-HER2-; MCF-7 (HTB-22): ER+PR+HER2-; BT474 (HTB-20): ER+PR+HER2+; T47D (HTB-133): ER+PR+HER2-) were cultured. These cell s were positive controls. Magnetic isolation for CD44+CD24- cells were done to separate cancer stem cells. RNA isolation, cDNA conversion were done to both group of cells. Breast cancer related 84 gene array (PAHS-131Z) expressions were evaluated by RT-PCR. Data analysis was done on SABioscience web page. Gene expression of VEGFA was increased MKI67 and TFF3 was decreased in HTB-133 cancer stem cells. CTNBB1, CDKN1A, JUN, TFF3 were decreased in HTB-20 cancer stem cells. SLC39A6, TFF3, XBP1, RB1, MAPK3 were increased and ADAM23, PLAU, GSTP1, BCL2, MMP2, MMP9, MGMT were decreased in MCF-7 (HTB-22) cancer stem cells. In MDA-MB-231 cancer stem cells ABCB1 and SLC39A6 were increased and MMP9 and MKI67 were decreased. We determined differences in gene expression between breast cancer cells and their stem cells, besides differences between stem cells especially in angiogenesis, migration, proliferation and DNA repair genes. We found increase in AKT1, CTNNB1, THBS1, Tp53and XBP1 genes in all breast cancer cells and stem cells. Our data suggest that there is not a common cancer stem cell for breast cancer. There are different breast cancer stem cells with different genetic characterization and phenotypes, so it is suggested that the usage of“breast cancer initiating cells”term can be more convenient than the term of breast cancer stem cell. Besides these differences, we found 5 common gene expressions in all cancer cells and cancer stem cells which were AKT1, CTNNB1, THBS1, TP53 and XBP1. The novel therapeutical targets might be planned including these genetic changes.

Benzer Tezler

  1. Karaciğer kanseri kök hücrelerinde SIP1 gen ifadesinin analizi

    Evaluation of SIP1 gene expression in liver cancer stem cell

    METİN ÇETİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiGebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TAMER YAĞCI

  2. Kök hücre-benzeri meme kanseri hücrelerinin metilpridinyum fonksiyonlu P-Ter-bütilkaliks[4]aren diamid nanolif iskeleler üzerinde büyütülerek zenginleştirilmesi

    Enrichment of stem cell-like breast cancer cells by growth on metylpyridinium functionalized P-Tert-butylcalix[4]arene diamide nanofiber scaffolds

    NOORA OMAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyoteknolojiSelçuk Üniversitesi

    Nanoteknoloji ve İleri Malzemeler Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ PEMBEGÜL UYAR ARPACI

    PROF. DR. ŞEREF ERTUL

  3. Effect of naringin, a natural compound, on stem cell phenotype of breast cancer

    Bir doğal bileşen olan naringinin meme kanseri hücrelerinin kök hücre fenotipi üzerindeki etkisi

    RAZİYE PİRANLIOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    Bilim ve TeknolojiYeditepe Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİKRETTİN ŞAHİN

  4. Effect of bisphosphonate/graphene oxide complex on proliferation and differentiation of mesenchymal stem cells and breast cancer cells

    Bisfosfonat/grafen oksit komplekslerin mezenkimal kök hücre ve meme kanseri hücrelerinin çoğalma ve farklılaşmasına etkisi

    GÖKÇEN BORAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    BiyoteknolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ DUYGU EGE

  5. Meme kanseri ve meme kanser kök hücrelerinde telomeraz inhibitörü bıbr1532 ajanının etkisinin moleküler biyolojik açıdan incelenmesi

    Molecular biological investigation of telomerase inhibitor bibr1532 agent effect in breast cancer and breast cancer stem cells

    FATMA DOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Tıbbi BiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÇIĞIR BİRAY AVCI