Geri Dön

Over kanserlerinde tümör dokusunda T hücre reseptörü yeniden düzenlenmesinin multipleks PCR yöntemi kullanılarak araştırılması

Investigation of T-cell receptor rearrangement in tumor tissues in ovarian cancers by means of multiplex PCR method

PDF İndir

  1. Tez No: 384179
  2. Yazar: SULTAN ÖZKAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA COŞAN TEREK
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Kadın Hastalıkları ve Doğum, Obstetrics and Gynecology
  6. Anahtar Kelimeler: Neoplazmlar, Over neoplazmları, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Reseptörler-antijen-T hücre, Neoplasms, Ovarian neoplasms, Polymerase chain reaction, Receptors-antigen-T cell
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Bu çalışmada over karsinomlarında T hücre reseptör yeniden düzenlenmesi çalışılarak olgulardaki klonal seleksiyon araştırılacaktır.. İlerideki immünolojik çalışmalarla olgulardaki klonal duruma göre tedaviye yön verilmesi ve her hastaya özgü bir tedavi tipi geliştirilebilmesi sağlanabilecektir. Yöntem: Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Kadın Hastalıkları ve Doğum Anabilim Dalı'na Kasım 2010-Kasım 2012 tarihleri arasında başvuran 24 malign ve 23 benign adneksiyal kitlesi olan olgu çalışmaya dahil edilmiştir. Over karsinomu tanısı konmuş hastalardan (n=24) cerrahi sırasında primer over tümör dokusundan taze doku örnekleri alınmıştır. Uterusa ait nedenlerle cerrahi geçiren ve profilaktik oooforektomi yapılan non-neoplasik overlerden (n=23) alınan taze doku örneklerinden de çalışılan hücre tipine uygun ticari kit kullanılarak beta, gama ve delta genomik DNA izolasyonu yapılmıştır. İzole edilen genomik DNA örneklerinin miktarı Nano Drop cihazında 260 nm. dalga boyunda ölçülmüştür. Seçilen kaliteli DNA örnekleri T-hücre gen klonalitesini belirlemek için Biomed-2 primerleri kullanılarak multipleks PCR yöntemi ile belirlenmiştir. PCR'ın ardından tüm örneklere yalancı pozitifliği önlemek amacıyla heterodubleks analizi yapılmış, poliakrilamid jel elektroforezi sistemine yüklenmiştir. Daha önceden optimize edilmiş uygun voltaj ve sürelerde poliakrilamid jel elektoforezinde örneklerin yürütülmesinin ardından, EtBr ile jeli boyama ve distile suda yıkama işlemleri gerçekleştirilmiştir. Daha sonra jel görüntüleme sisteminde jel görüntülenmiş ve fotoğrafı çekilmiştir. Çekilen fotoğraftaki bantların büyüklüklerine ve analiz aralıklarına bakılarak her hasta için T hücre klonalitesi değerlendirilmiştir. Hastalardaki yaş, evre, tümör histopatolojik tipi, tümör derecesi, tümör çapı gibi prognostik değişkenler ile T hücre yeniden düzenlenmesi arasındaki ilişki değerlendirilmiştir. Bulgular: Çalışma ve kontrol grubunda TCRB-A pozitiflik oranı anlamlı (p˃0,05) farklılık göstermemiştir. Çalışma grubunda TCRB-B pozitiflik oranı kontrol grubundan anlamlı (p<0,05) olarak yüksek bulunmuştur. Çalışma ve kontrol grubunda TCRB-C anlamlı (p˃0,05) farklılık göstermemiştir. Çalışma ve kontrol grubunda TCRG-A pozitiflik oranı anlamlı (p ˃ 0,05) farklılık göstermemiştir. Çalışma ve kontrol grubunda TCRG-B pozitiflik oranı anlamlı (p ˃ 0,05) farklılık göstermemiştir. Çalışma grubunda TCR-D pozitiflik oranı kontrol grubundan anlamlı (p < 0,05) olarak daha yüksek bulunmuştur. Sonuç: Over kanseri olgu serisinde TCR'nün alt grupları gösterilmiştir. TCRB-B ve TCR-D alt gruplarında saptanan anlamlı farklılık immün tedavilere ışık tutacaktır.

Özet (Çeviri)

Object: In this study, clonal selection in patients will be investigated by searching the T-cell receptor rearrangement in over carcinomas. Through the future immunologic studies, the treatment to be applied will be directed depending on the clonal status of patients and a treatment type specific to each patient will be developed. Method: 24 patients with malign adnexal mass and 23 patients with benign adnexal mass who have applied to Ege University Medical Faculty Department of Obstetrics and Gynecology between the dates of November 2010 and November 2012 were included in the study. Fresh tissue samples were taken from primary ovary tumor tissue of the patients diagnosed with over carcinoma (n=24) during the operation. However, beta, gamma and delta genomic DNA was isolated from fresh tissue samples taken from non-neoplastic ovary which have been operated due to the causes related with uterus and underwent prophylactic oophorectomy (n=23) by means of appropriate commercial kits for the cell type. The amount of the isolated genomic DNA samples was measured at a wavelength of 260 nm. The selected high quality DNA samples were determined by PCR method by using Biomed-2 primaries in order to specify T-cell gene clonality. After PRC, heterodublex analysis was made on all samples in order to prevent false positivity and loaded to Polyacrylamide gel electrophoresis system. After the samples were subjected to Polyacrylamide gel electrophoresis with previously optimized voltage and periods, gel dying with EtBr and distilled water wash operations were carried out. Then, the gel was displayed in the gel imaging system and its photo was taken. Size of bands in the photo and analysis ranges were examined and T-cell clonality was evaluated for each patient. Relationship between T cell rearrangement and prognostic variables such as age of patient, stage, histopathological type of tumor, tumor grade, tumor diameter etc. was evaluated. Findings: TCRB-A positivity ratio showed no significant difference (p˃0,05) in the study and control groups. TCRB-B positivity ratio was found to be significantly higher in the study group compared to the control group (p<0,05). However, TCRB-C showed no significant difference in control and study groups (p˃0,05). In the control and study groups, TCRG-A positivity ratio showed no significant difference (p ˃ 0,05). In the control and study groups, TCRG-B positivity ratio showed no significant difference (p ˃ 0,05). TCR-D positivity ratio was found to be significantly higher in the study group compared to the control group (p<0,05). Result: Sub-groups of TCR were shown in the ovary cancer case series. The significant difference in TCRB-B and TCR-D sub-groups will provide an insight to immunotherapy.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    336817

    Granüloza hücreli over tümörlerinde HER2 amplifikasyonunun FISH (Floresan in situ hibridizasyon), ekspresyonunun IHC (İmmunohitokimya) metodu ile gösterilmesi

    Demonstration of HER2 amplification by FISH (Fluorescence in situ hybridization) and its expression by IHC (İmmunohistochemical) methods in granulosa cell tumors of the ovary

    NESLİHAN UZUN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    PROF. SENİHA HACIHANEFİOĞLU

  2. Tez No

    664011

    Larenks kanseri hastalarında immün mikroçevrenin tayini, regulatuar T hücre markerlarından TIM-3 ve LAG-3 ekspresyonlarının belirlenmesi ve prognoza etkileri

    Determination of immune microenvironment, regulatory T cell markers tim-3 and LAG-3 expressions in laryngeal cancer patients and their effects on prognosis

    FIRAT TEVETOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Kulak Burun ve Boğazİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Kulak Burun Boğaz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAYDAR MURAT YENER

  3. Tez No

    499025

    Tekrarlayan epitelyal over kanserlerinde primer ve sekonder tümör dokusunda CA125 üreten hücre oranının tedavi sonuçlarına etkisi

    Effects of primary and secondary ovarian cancer tissues' CA125 expressing cell ratio on treatment results of recurrent epithelial ovarian cancer

    SABİRE AYGÜN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Onkolojiİstanbul Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FUAT DEMİRKIRAN

  4. Tez No

    59824

    Over kanserlerinde tümör dokusu, normal doku ve serum c-erbB-2 ve mutant p53 onkoproteinlerinin değerlendirilmesi

    c-erbB-2 and mutant p53 over expression in tumor and normal tissue and serum of ovarian cancer

    KENAN SERDAR DOLAPÇIOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Kadın Hastalıkları ve Doğumİstanbul Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FARUK BUYRU

  5. Tez No

    341834

    Çocukluk çağı solid tümörlerinde kanser kök hücre belirteci olarak Piwil2 ekspresyonunun araştırılması ve Piwil2'nin biyomarker olarak kullanılabileceğinin gösterilmesi

    Investigation of Piwil2 expression as a cancer stem cell marker and demonstration of its availability as a biomarker in solid tumors of childhood

    YILMAZ SEÇİLMİŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıErciyes Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSA KARAKÜKCÜ

Geri Dön