Fetal sığır serum asetilkolinesterazının tetramerik yapısını organize eden poliprolin peptidlerin kütle spektrometre ile analizi
Determination of polyproline tetramer organizing peptides in fetal bovine serum acetylcholinesterase by mass spectrometry
- Tez No: 375000
- Danışmanlar: PROF. DR. ÖZDEN TACAL, PROF. DR. Oksana Lockridge
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Asetilkolinesteraz, Elektroforez-agar jel, Elektroforez-poliakrilamid jel, Enzimler, Fetüs, Kütle spektrometri, Peptidler, Acetylcholinesterase, Electrophoresis-agar gel, Electrophoresis-polyacrylamide gel, Enzymes, Fetus, Mass spectrometry, Peptides
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Fetal sığır serumunda bulunan asetilkolinesteraz (AChE), tetramerik yapıda bir enzimdir. İnsan ve at serumunda bulunan ve AChE ile ilişkili bir enzim olan bütirilkolinesterazın (BChE) tetramerik yapıya dönüşmesinde poliprolin peptidlerin rolü bilinmektedir. Bu çalışmanın amacı, çözünür, tetramerik AChE'ın yapısında tetramer yapıyı organize eden peptidlerin olup olmadığını incelemektir. Çalışmada öncelikle fetal sığır serum AChE'ı, kaynatılarak denatüre edildi ve böylece non-kovalent bağlı peptidlerin AChE'dan salınmasına izin verildi. Peptidler, daha sonra ana proteinden filtrasyon ve HPLC yöntemleri kullanılarak saflaştırıldı. Salınan peptidlerin kütlesi ve amino asit dizisi, MALDI–TOF–TOF ve LTQ-Orbitrap kütle spektrometresi ile belirlendi. Çalışmanın sonunda 5 aile içerisinde sınıflandırılan ondört poliprolin peptid tanımlandı. Çalışılan peptidlerden en uzun peptidin, başka bir amino asit olmaksızın 25 tane ardışık prolin aminoasiti içerdiği bulundu. Diğer poliprolin peptidlerin yapısında ise bir adet farklı bir amino asitin bulunduğu gözlendi. Memeli proteom veritabanında yapılan araştırma sonucunda poliprolin peptidlerin, en azından 5 farklı prekürsör proteinden kaynaklandığı ve onların membrana-bağlı AChE'ın ColQ veya PRiMA'dan bağımsız olduğu bulundu. Günümüze kadar, AChE ve BChE, yapılarında tetramer yapıyı oluşturan poliprolin peptidleri içerdiği bilinen iki proteindir.
Özet (Çeviri)
Acetylcholinesterase (AChE) in the serum of fetal bovine is a tetrameric enzyme. The related enzyme, butyrylcholinesterase (BChE), in the sera of humans and horse requires polyproline peptides for assembly into tetramers. The goal of this study was to determine whether soluble tetrameric AChE includes tetramer organizing peptides in its structure. In this study, fetal bovine serum AChE was denatured by boiling to release non-covalently bound peptides. Released peptides were separated from bulk protein by filtration and by high performance liquid chromatography. Peptide mass and amino acid sequence of the released peptides were determined by MALDI–TOF–TOF and LTQ-Orbitrap mass spectrometry. Fourteen polyproline peptides, divided into 5 families, were identified. The longest peptide contained 25 consecutive prolines and no other amino acid. Other polyproline peptides included one nonproline amino acid. A search of the mammalian proteome database suggested that this assortment of polyproline peptides originated from at least 5 different precursor proteins, none of which were the ColQ or PRiMA of membrane-anchored AChE. To date, AChE and BChE are the only proteins known that include polyproline tetramer organizing peptides in their tetrameric structure.
Benzer Tezler
- Sığır oositlerinin in vitro olgunlaştırılmasında kültür medyumuna serum ilavesinin ısı şok protein70 miktarına etkisinin belirlenmesi
Effect of serum supplementation to culture media in vitro maturation of bovine oocytes on the level of HSP70 synthesis
RABİA YAŞAR TÜREGÜN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyoteknolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET KURAN
- Farklı sıcaklıklarda in vitro olgunlaştırılan sığır oositlerinde ısı şok proteini 70'in belirlenmesi
Determination of heat shock protein 70 in bovine oocytes matured different culture temperatures in vitro
LEYLA BENER
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyoteknolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET KURAN
- Sığırlarda oosit in vitro maturasyonunda plateletten zengin plazma ve farklı hormonların kullanımı
Use of platelet rich plasma and different hormones in the in vitro maturation of oocyte in cattle
ALİ ŞENOK
- Surface morphology investigation of a biodegradable magnesium alloy
Biobozunur magnezyum alaşımının yüzey morfolojisinin araştırılması
AYDIN TAHMASEBİFAR
Doktora
İngilizce
2015
Mühendislik BilimleriOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMühendislik Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZAFER EVİS
PROF. DR. MUAMMER KOÇ
- Kitosan temelli kullan-at elektrotların geliştirilmesi ve hastane enfeksiyonu etkeni acinetobacter baumannii tayinine yönelik elektrokimyasal DNA biyosensör uygulaması
Development of chitosan-based disposable electrodes and their applications on electrochemical DNA biosensor for the detection of the hospital- acquired infection agent acinetobacter baumannii
AYŞEN BOZOĞLU ÇINAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyoteknolojiEge ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KADRİYE ARZUM ERDEM GÜRSAN
DOÇ. DR. ECE EKŞİN ÇERKEZOĞLU