DNA metil transferaz enzimlerinin yaşlanma ile ilgili insan klotho geni anlatımı üzerine etkilerinin araştırılması
Investigation of effects of DNA methyltransferase enzymes on aging-related human klotho gene expression
- Tez No: 359695
- Danışmanlar: PROF. DR. KADİR TURAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Biyokimya, Genetics, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: DNA Metilasyonu, DNMT-3A, DNMT-3B, Klotho, Yaşlanma, DNA, Enzimler, Gen ifadesi, Genler, Metilasyon, Metiltransferaz, DNA Methylation, DNMT-3A, DNMT-3B, Klotho, Aging, DNA, Enzymes, Gene expression, Genes, Methylation, Methyltransferase
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Yaşlanma sürecini belirleyen hem çevresel hem de kalıtsal faktörler vardır. İnsanlar için yaşlanma sürecini etkileyen çevresel faktörlerin başında beslenme alışkanlıkları ve yaşanılan ortamın kalitesi (hava ve su gibi) gelmektedir. Genetik faktörler ise oldukça karmaşıktır. Birçok genin rol aldığı, farklı hücre içi metabolik yolaklar yaşam sürecini etkilemektedir. Yaşlanma ile ilişkilendirilen önemli genetik faktörlerden biri klotho genidir. Klotho geni tarafından kodlanan Klotho proteinin etki mekanizmaları ile ilgili yapılan çalışmalarda bu proteinin çeşitli metabolik yolaklar üzerinde pozitif ya da negatif yönde etkili olduğu görülmüştür. Bununla birlikte klotho geninin regülasyonu hakkında çok fazla bilgi mevcut değildir. Yakın tarihte yayınlanan bir çalışmada, insan klotho geni promotör bölgesinin, metilasyon ile epigenetik olarak kontrol edilebileceği yönünde bulgular rapor edilmiştir. Bu bakımdan klotho geninin regülasyonunda DNMT enzimlerinin önemli olacağı düşünülmüştür. Buna karşın somut olarak hücre içerisinde DNMT enzimlerinin miktarlarının değişmesinin klotho gen anlatımını etkileyip etkilemediğini ortaya koyan bir çalışmaya rastlanmamıştır. Dolayısıyla bu tez çalışmasında, yaşlanma ile ilişkisi kanıtlanmış önemli bir genetik faktör olan klotho geni anlatımı üzerine DNMT3A ve DNMT3B enzimlerinin etkilerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaç doğrultusunda, yapay olarak DNMT3A ve DNMT3B enzim miktarları değiştirilmiş insan orijinli HEK-293 hücrelerinde, belirteç lusiferaz geninden yararlanılarak klotho geni promotörünün nasıl etkilendiği araştırılmıştır. Çalışma sonucu elde edilen veriler, DNMT enzimlerinin kromatin halinde organize olmuş klotho geni promotörü üzerinde baskılayıcı etki gösterdikleri, buna karşın, plazmit DNA'sı üzerinde yer alan klotho promotörü üzerinde ise arttırıcı etkiye sahip olduklarını ortaya koydu. Bu sonuçlar insan klotho geninin işleyiş mekanizmasının aydınlatılması açısından büyük önem taşımaktadır.
Özet (Çeviri)
There are both environmental and genetic factors affecting the aging process. The most important environmental factors affecting the human aging process are eating habits and the quality of the living environment (air, water, etc.). The genetic factors are quite complex. Several intracellular metabolic pathways in which many genes take role affect the aging process. One of the important genetic factors associated with aging is klotho gene. In scientific researches to reveal the action mechanism of Klotho protein encoded by klotho gene, it was shown that this protein has the positive or negative regulatory effects on many metabolic pathways. However, much information about the regulation of klotho gene is not available. In a recently published study, it was reported the results suggesting that the promoter region of human klotho gene could be epigenetically controlled by DNA methylation. In this regard, it is thought to be important of DNMT enzymes for regulation of klotho gene. In contrast, it has not been found a study perceptibly revealing whether the change of expression level of DNMT enzymes in the cells affect the klotho gene expression or not. Therefore, in this thesis, it was aimed to reveal the effects of DNMT3A and DNMT3B enzymes on the expression of klotho gene, which is an important genetic factor having relationship with the aging process. For this purpose, it was artificially changed the expression level of DNMT3A and DNMT3B in human originated HEK293 cells and investigated by using reporter luciferase gene how klotho gene promoter activity was affected. The results obtained in this research showed that DNMT enzymes have negative regulatory effects on klotho gene promoter organized as a chromatin structure, whereas they are enhancing effect on promoter activity when it was located on plasmid DNA. These results have a great importance to elucidate the functional mechanism of human klotho gene.
Benzer Tezler
- Çocukluk çağı akut lenfoblastik lösemilerinde DNA metiltransferaz 1, 2, 3A ve 3B ekspresyonu
DNA methyltransferase 1, 2, 3A and 3B expression in childhood acute lymphoblastic leukemia
DERYA BEYZA SAYIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
Tıbbi BiyolojiAnkara ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. IŞIK BÖKESOY
- Analysis of histone modifications in familial Mediterranean fever patients using chromatin immunoprecipitation sequencing assay
Ailesel Akdeniz ateşi hastalarinda histon modifikasyonlarinin kromatin immünopresipitasyon dizileme kullanarak analizi
BEGÜM FİDAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. EDA TAHİR TURANLI
- Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Escherichia coli suşlarında metil patern farklılıklarının belirlenmesi
The determination of methyl pattern differences Escherichia coli strains isolated from different clinical samples
ÖZLEM KIVANÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2004
MikrobiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ZEYNEP SÜMER
- Molecular determinants of DNA methylation mechanismsin mammals
Memelilerde DNA metilasyon mekanizmasını belirleyen moleküler faktörler
DENİZ DOĞAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyofizikDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EZGİ KARACA EREK
- Pectobacterium chrysanthemi pektin metilesteraz enziminin Pichia pastoris ile rekombinant üretimi
Recombinant production of pectin methylesterase from Pectobacterium chrysanthemi by Pichia pastoris
MELEK ACAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyoteknolojiAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YAĞMUR ÜNVER