Mir-96 ifadesinin otofaji üzerinde etkisinin meme kanseri hücre hatlarında araştırılması
Investigation of the effect of mir-96 expression on autophagy in breast cancer cell lines
- Tez No: 359615
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA ULAŞLI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: MiR-96, otofaji, meme kanseri hücre hatları, trastuzumab, everolimus, Antikorlar-monoklonal, Hücre dizisi, Meme neoplazmları, Mikro RNA, Neoplazmlar, Mir-96, autophagy, breast cancer cell lines, trastuzumab, everolimus, Antibodies-monoclonal, Cell line, Breast neoplasms, Micro RNA, Neoplasms
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kanser hücrelerinde mikroRNA'ların (miRNA) ifade seviyelerindeki farklılıklar kanser araştırmacıları için ciddi bir araştırma konusu olmuştur. Tüm kanserlerde olduğu gibi meme kanserinde de kanserleşmeyi teşvik eden veya kanserinin oluşmasını baskılayan miRNA'lar bulunmaktadır ve her geçen gün bunlara yenileri eklenmektedir. miRNA'ların günümüzde meme kanserinin teşhisi, tedavisi, ilerleyişi ve kanserin ilaca verdiği cevap konusunda kullanılabileceği düşünülmektedir. miR-96 meme kanserinde kanserin seyrinin kötüleşmesine sebep olduğu bulunmuştur. Meme kanserinde otofaji yolağının rolünün aydınlatılması kanserin tedavisinde ve ilaçların etkileşimlerinde büyük önem arz etmektedir. Her2 pozitif meme kanserinde trastuzumab ilacı sıklıkla kullanılmaktadır fakat bu ilaç çok fazla etkin değildir. Ayrıca özellikle üçlü negatif meme kanserinde de etkin bir ilaç henüz bulunamamıştır. Everolimus ilacı da mTOR baskılayıcı, dolayısıyla otofaji yolağını uyarıcı rolü olan bir ilaçtır ve meme kanserinde faz çalışmaları yapılmaktadır. Bu çalışmada meme hücre hatlarında miR-96 ifadesi ve miR-96'nın tahmini olarak hedeflediği otofaji ile ilişkilendirilen ATG16L1, ATG9A, ATG7, CTSB, TP73 genlerinin gen ifade seviyeleri ilaç verilmeden, trastuzumab ve everolimus ilaçları ayrı ayrı ve birlikte verilerek araştırılmıştır. miR-96 RT-PCR, ATG16L1, ATG9A, ATG7, CTSB, TP73 genleri fluidigm cihazı ile qRT-PCR yöntemi kullanılarak ifade seviyelerine bakılmıştır. Yapılan gen ifade analizlerinde miR-96'nın normal epitelyum hücre hattına göre MCF-7 ve SKBR-3 meme kanseri hücre hatlarında anlamlı bir artış saptanmıştır. MiR-96'nın tahmini hedeflediği genlerde normal epitelyum hücre hattına göre: SKBR-3'te ATG16L1, ATG9A, ATG7 genlerinde düşüş; CTSB geninde her iki hücre hattında da düşüş; TP73 geninde ise sadece MCF-7'de aşırı bir artış anlamlı olarak gözlemlenmiştir. Everolimus ilacı verildiğinde MiR-96'da bütün hücre hatlarında anlamlı bir artış saptanmış; everolimus ve trastuzumab ilaçlarının her ikisi verildiğinde ise sadece MCF-7'de anlamlı bir artış gözlemlenmiştir.
Özet (Çeviri)
The difference of microRNAs (miRNA) expression level in cancer cells has been an important subject of cancer researchers. As in all cancers, miRNAs promoting or suppressing tumorigeneses in breast cancer were found and additional miRNAs are still being included. miRNAs are thought to be able to use in the subjects of breast cancer diagnosis, treatment, prognosis and also response of cancer to drug. The elucidation of the role of autophagy pathway in breast cancer is greatly important for cancer treatment and drug interactions. Overexpression of miR-96 was associated with poor prognosis in breast cancer. The drug, Trastuzumab, is often used in HER2 positive breast cancer but this drug is not effective enough. Moreover, no drug which is effective in especially triple negative breast cancer has been found yet. The drug, Everolimus, suppresses mTOR pathway, thus stimulates the autophagy pathway, and phase trials have been conducted in breast cancer. In this study, the expression levels of miR-96 and its theoretically targets associated with autophagy, ATG16L1, ATG9A, ATG7, CTSB, TP73 genes were investigated in breast cell lines. In addition, the expression levels were measured in the absence drug treatment and after treatment of trastuzumab and everolimus combination. qRT-PCR for miR-96 and qRT-PCR in fluidigm device for ATG16L1, ATG9A, ATG7, CTSB, TP73 genes were used to measure the expression levels. According to the gene expression analysis, a significant increase in miR-96 expression were detected in MCF-7 and SKBR-3 breast cancer cell lines, compared to normal epithelial cell line. Among genes theoretically targeted by miR-96, significant decrease in ATG16L1, ATG9A, ATG7 genes' expressions in SKBR3, significant decrease in CTSB gene expression in both cell lines and significant increase in TP73 gene expression in only MCF-7 were detected, compared to normal epithelial cell line. When everolimus was administered, miR-96 expression was found significantly increased in all cell lines; when everolimus and trastuzumab were administered together, a significant increase in miR-96 expression was measured in only MCF-7.
Benzer Tezler
- Küçük Yamanlar tepesi örneğinde kent yakın çevresinde rekreasyon alanı düzenleme projesi
Başlık çevirisi yok
NİHAN BULGUN
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Şehircilik ve Bölge PlanlamaEge ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İLÇİN ASLANBOĞA
- Bazı triticale çeşitlerinin kimi teknolojik özellikleri üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
SELMAN TÜRKER
- Kültür mantarı yetiştiriciliğinin ekonomik analizi ve yapılabilirliği
Başlık çevirisi yok
NECDET ÖZBİLGİN
- Computer aided map projections
Başlık çevirisi yok
RASİH SÜHA OLGAY
Yüksek Lisans
İngilizce
1987
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiDOÇ. DR. FATİH CANATAN