Geri Dön

İnsanda SIRT6 geninde yaşlanmaya bağlı meydana gelen genetik ve epigenetik değişiklikler

Aging-dependent genetic and epigenetic alterations on SIRT6 gene in human

PDF İndir

  1. Tez No: 352241
  2. Yazar: KANİYE ŞAHİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. NERMİN GÖZÜKIRMIZI
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Genetik, Geriatri, Genetics, Geriatrics
  6. Anahtar Kelimeler: SIRT6, SSCA, SNP, yaşlanma, metilasyon, Aktif yaşlanma, Moleküler genetik, SIRT6, SSCA, SNP, aging, methylation, Active ageing, Molecular genetic
  7. Yıl: 2014
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışmada, metabolizma ve hayat döngüsünde önemli işlevleri olan SIRT6 genindeki genetik ve epigenetik değişiklikler ile yaşlanma arasındaki ilişki araştırılmıştır. Toplam 56 bireye (34 kadın ve 22 erkek) ait kan örneklerinden elde edilen genomik DNA'lar SIRT6 geninin 7 eksonunu çoğaltan 7 çift primer ile tarandı. Nükleotit çeşitliliği analizleri için tek iplik konformasyon polimorfizmi tekniği (SSCA) kullanıldı. 1, 2 ve 5. ekson bölgeleri için polimorfik bantlar gözlenirken; 3, 4, 6 veya 7. ekson bölgelerinde hiçbir bireyde farklılık bulunmadı. Bireylerin %17.9'u en az bir eksonik bölge için polimorfik bant profili gösterdi. Bu örneklerin dizi analizi ile intron veya ekson dizilerinde 5 delesyon, 3 insersiyon ve 7 nükleotit çeşitliliği saptandı. Ancak, gözlenen tek nükleotit polimorfizmleri ile uzun yaşam arasında anlamlı bir ilişki bulunamadı. Epigenetik değişiklik olarak SIRT6 geninin promotöründeki metilasyon oranları, genomik DNA'nın bisülfit dönüşümü sonrası real-time PCR analizi ile belirlendi. Buna göre, 0-19 yaş grubundaki bireylerde metilasyon yüzdesi %43.21 iken 20-79 yaş grupları arasında bu oranın %65.63'e çıktığı, 80-99 yaşlarında ise %52.15'e indiği saptandı.

Özet (Çeviri)

In this study, we investigated the association between longevity and genetic and epigenetic alterations in SIRT6 gene which plays important roles in metabolism and life span. Isolated genomic DNAs from blood samples of 56 individuals (34 females and 22 males) were screened using 7 pairs of primers covering 7 exons of SIRT6 gene. Single-strand conformation polymorphism (SSCP) technique was performed for nucleotide variation analyses. We observed polymorphic band patterns for exonic regions 1, 2, and 5; but not for 3, 4, 6 or 7. 17.9% of the subjects retained a polymorphic band pattern for at least one of those exonic regions. The sequencing of those samples revealed 5 deletions, 3 insertions, and 7 single nucleotide variations (SNVs) on either the intronic or exonic sequence. However, we found no significant evidence of an association between observed single nucleotide polymorphisms and longevity. For epigenetic changes, the methylation levels of SIRT6 gene promoter were detected by real-time PCR analysis following bisulfite treatment of genomic DNA. While the results indicated 43.21% methylation in 0-19 age groups, this ratio is found to be increased up to 65.63% in 20-79 age groups, and decreased to %52.15 in 80-99 age groups.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    779247

    Foliküler lenfomalarda sirtuin gen ifade profili

    Gene expression profiling of sirtuins in follicular lymphoma

    LALEH MADAYEN SHISHEVAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLŞAH KAYGUSUZ

  2. Tez No

    502850

    Yaşa bağlı katarak olgularında sırt1 geni ekspresyon düzeyi ile hastalık arasındaki ilişkinin incelenmesi

    Investigation of relation between sirt1 gene expression level and in patient with age related cataract

    NİHAT BUĞRA AĞAOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Göz HastalıklarıAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SALİHA HANDAN YILDIZ

  3. Tez No

    473088

    Association of HLA-B27 with ankylosing spondylitis in the population of Duhok/Iraqi patients

    Duhok, Irak hasta popülasyonunda HLA-B27'nin ankilozan spondilit ile ilişkisi

    OMAR MOHAMMED YOUNUS ALASAADI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Moleküler TıpKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    YRD. DOÇ. DR. SABAHATTİN CÖMERTPAY

  4. Tez No

    396496

    Prematür over yetmezliği olgularında genomik kopya sayısı değişikliklerinin array CGH yöntemi ile değerlendirilmesi

    Assessing copy number variations by array CGH in cases with premature ovarian failure

    HALİME KÜÇÜK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    GenetikEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEVİLHAN ARTAN

  5. Tez No

    648859

    Tip 2 diyabetli hastalarda lökosit telomer uzunluğunun; sirtuin-1 düzeyi, glisemik kontrol, diyabetik komplikasyonlar, vücut yağ dağılımı, beslenme ve egzersiz alışkanlıkları ile ilişkisi

    The relationship between leukocyte telomere length and sirtuin-1 level, glycemic control, diabetic complications, body fat distribution, nutrition and exercise habits in patients with TYPE 2 diabetes

    NAZMİ GÖKHAN ÜNVER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıGazi Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALEV EROĞLU ALTINOVA

    PROF. DR. MÜJDE YAŞIM AKTÜRK

    DOÇ. DR. CEYLA KONCA DEĞERTEKİN

Geri Dön