Geri Dön

Enterobacteriaceae klinik izolatlarında karbapenemaz varlığının fenotipik yöntemlerle araştırılması

Exploration of carbapenemase presence via phenotypic methods in clinical enterobacteriaceae isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 351236
  2. Yazar: EMRAH AYDIN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ABDURRAHMAN KİREMİTÇİ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Enterobacteriaeceae, karbapenem direnci, karbapenema, Enterobacteriaceae, Fenotip, Karbamazepin, İlaçlara direnç, İlaçlara direnç-mikrobiyal, Enterobacteriaceae, carbapenem resistance, carbapenemase, Phenotype, Carbamazepine, Drug resistance, Drug resistance-microbial
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Karbapenemler beta-laktam antibiyotikler arasında en geniş aktivite spektrumuna sahip ilaçlardır. Ancak günümüzde karbapenem dirençli Enterobacteriaeceae enfeksiyonları dünya çapında bildirilmektedir. Bu direncin esas nedeni, genetik olarak aktarılabilir karbapenemaz üretimidir. Bu çalışmada, Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Mikrobiyoloji Anabilim Dalında klinik örneklerden izole edilen ve Phoenix (BD Diagnostics, ABD) otomatize sistemi ile karbapenem minimal inhibitör konsantrasyon (MİK) değerlerinde artış saptanan 190 Enterobacteriaceae suşundan 104'ünde Etest (bioMerieux, Fransa) yöntemi ile MiK değerlerinde artış olduğu doğrulanmıştır. Bu suşlar üzerinde yapılan fenotipik testler ile, karbapenem direnç mekanizması olarak; 33'ünde (%31,5)“genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) + OXA-48 ve benzeri profil”, 26'sında (%25) OXA-48 ve benzeri profil, 18'inde (%17,5) metalo-beta-laktamaz (MBL), 13'ünde (%12,5)“KPC+MBL”, 13'ünde (%12,5)“GSBL+Porin kaybı”ve 1'inde (%1) KPC saptanmıştır. Ayrıca Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Tıp Fakültesinde çeşitli servislerde yatmakta olan 210 farklı hastadan alınan rektal sürüntü örnekleri 1 μg/ml dozda imipenem içeren EMB agar besiyerlerine ekilmiş, izole edilen 16 suşta Etest yöntemi ile karbapenem MiK artışı olduğu doğrulanmıştır. Bu suşlar üzerinde yapılan fenotipik testler ile, karbapenem direnç mekanizması olarak; 11'inde (%5) OXA-48 ve benzeri profil, 3'ünde (%1,5)“KPC+MBL”, 2'sinde MBL (%1) mekanizması saptanmıştır. Bu çalışmaya göre; otomatize sistem sonuçlarına göre karbapenem MİK değerlerinde artış saptanan izolatlarda bu artışın doğrulanması ve hastane içinde, karbapenem dirençli Enterobacteriaceae prevalansının arttığı birimlerde karbapenem içeren besiyeri kullanılarak taşıyıcılık taraması yapılması mantıklı görünmektedir.

Özet (Çeviri)

Carbapenems have the widest spectrum of activity among beta-lactam antibiotics. However, today, carbapenem resistant Enterobacteriace infections have been reported worldwide. The main cause of this resistance is the genetic transfer of carbapenemase genes. In this study, 104 of 190 Enterobacteriaeceae strains which were isolated from clinical specimens at Eskisehir Osmangazi University Medicine of Faculty, Department of Microbiology and detected as having increased MIC values by Phoenix (BD Diagnostics, USA) automated system were confirmed as having increased MIC values by using Etest (bioMerieux, France) method. By using phenotypic methods on these strains, the mechanisms of carbapenem resistance have been detected as follows: At 33 strains (%31,5) as“extended spectrum beta-lactamase (ESBL) + OXA-48-like profile”, at 26 strains (%25) as OXA-48-like profile, at 18 strains (%17,5) as metallo-beta-lactamase (MBL), at 13 strains (%12,5) as“KPC+MBL”, at 13 strains (%12,5) as“ESBL+Porin loss”and at 1 strain (%1) as KPC. On the other hand, 210 rectal swabs collected from hospitalised patients at various services of Eskisehir Osmangazi University Faculty of Medicine were plated on EMB agar media which contain imipenem at 1 μg/ml dose for each. Sixteen of isolated strains were confirmed as having increased carbapenem MIC values by using Etest method. By using phenotypic methods on these strains, the mechanisms of carbapenem resistance have been detected as follows: At 11 strains (%5) as OXA-48-like profile, at 3 strains (%1,5) as“KPC+MBL”, at 2 strains (%1) as MBL (%1). According to this study, confirmation of increased carbapenem MIC values detected by automated system and screening of the carriers by using carbapenem containing media at the units that have increased carbapenem resistant Enterobacteriaceae prevalance, seem reasonable.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    559394

    Kan kültüründen izole edilen karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae ve Escherichia coli suşlarında karbapenemaz varlığının fenotipik ve moleküler yöntemlerle araştırılması

    Investigation of the presence of carbapenemase in K. pneumoniae and E.coli strains isolated from blood culture by phenotypic and molecular methods

    ASİYE BIÇAKÇIGİL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BANU SANCAK

  2. Tez No

    494712

    Farklı klinik numunelerden izole edilen e. coli ve klebsiella pneumoniae suşlarında karbapenem, kinolon, kolistin direncinin araştırılması ve karbapenem dirençli suşlarda multipleks pcr yöntemi ile kpc, ndm, vım, oxa-48, ımp-1 genlerin tespiti

    An investigation of carbapenem, quinolone and colistin resistance in e. coli and klebsiella pneumoniae strains isolated from different clinical samples and detection of kpc, ndm, vim, oxa-48, imp-1 genes by multiplex pcr in carbapenem-resistant strains.

    ÖZGE ALKAN BİLİK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiHarran Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET BAYRAKTAR

  3. Tez No

    440159

    Toplum ve hastane kaynaklı klebsiella pneumoniae suşlarında oxa-48 ve alt türevlerinin konvansiyonel ve moleküler yöntemlerle belirlenmesi

    Determining OXO-48 and its variants with conventional and molecular methods in klebsiella pneumoniae isolates originated from community and hospital

    ARZU UYANIK PARLAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    MikrobiyolojiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HÜSEYİN GÜDÜCÜOĞLU

  4. Tez No

    875923

    Çeşitli klinik örneklerden elde edilen klebsiella pneumoniae'de karbapenemaz üretimi ve tiplendirilmesinde fenotipik ve genotipik yöntemlerin değerlendirilmesi

    Evaluation of phenotypic and genotypic methods in carbapenemaseproduction and typing in klebsiella pneumoniae obtained from various clinical samples

    ŞURA BAŞDAĞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET BURAK AKSU

  5. Tez No

    847396

    Klinik örneklerden izole edilen Klebsiella pneumoniae izolatlarında karbapenem direncini saptamakta kullanılan fenotipik yöntemlerin performanslarının karşılaştırılması

    Comparison of the performance of phenotypic methods used to detect carbapenem resistance in Klebsiella pneumoniae isolates from clinical samples

    MUHARREM NASLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiKarabük Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞERİFE YILMAZ

Geri Dön