Koyun (Ovis aries) genomunda mikroRNA analizleri
MicroRNA analysis from sheep (Ovis aries) genome
- Tez No: 346632
- Danışmanlar: DOÇ. DR. CEMAL ÜN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Mikro-Ribonükleik Asit ler (miRNA), ~ 22 nükleotid uzunluğunda bulunan, bitkiler, hayvanlar ve virüslerde gen ekspresyon ağlarında anahtar düzenleyiciler olarak birçok biyolojik prosesi etkileyen protein kodlamayan RNA lardır. miRNA lar keşfedildikleri zamandan itibaren medikal, biyolojik ve ziraat bilimlerinde önemli gelişmelere sebep olmuşlardır. Et üretimi için önemli bir çiftlik hayvanı olan koyun aynı zamanda biyolojik ve karşılaştırmalı genomik çalışmaları için de ideal bir model organizmadır. Çalışma perspektifine göre yeni miRNA dizisi belirleme yöntemleri, deneysel metodlar veya bilgisayar temelli teknikler olarak değişebilmektedir. Bu tez çalışmasında, hem deneysel yöntemler hem de biyoinformatik yaklaşımlar uygulanarak koyun genomundan transkribe edilen miRNA dizilerinin belirlenmesi hedeflenmiştir. Bu amaçla koyun kanından elde edilen kısa-RNA?lara ait cDNA dizileri klonlanarak analiz edilmiş ve 1 adet olası aday miRNA dizisi bulunmuştur. Ayrıca, uygulanan homoloji temelli biyoinformatik yöntemde mevcut sığır miRNA?ları kullanılarak 63 homolog aday miRNA dizisi tahmin edilmiştir. Toplam olarak 64 adet olası miRNA saptanmıştır.
Özet (Çeviri)
Micro-Ribonucleic Acids (miRNA) ~ 22 nt. long and non-protein coding RNAs, effect various biological processes as key regulators of gene expression networks in plants, animals and viruses. Since their discovery, miRNAs induce significant developments in medical, biological and agricultural sciences. Sheep an important agricultural livestock for meat production, is also an ideal model organism for biological and comparative genomics researches. Experimental methods and computational technics are the approaches can be changeable according to perspective of the study for identification of novel miRNA sequences. In the present study, identification of miRNA sequences transcribed from sheep genome by both experimental methods and bioinformatics approaches were aimed. With this purpose, cDNA sequences of the small-RNAs obtained from sheep blood were cloned and analyzed. One candidate miRNA sequence was identified. Also, by using known cattle miRNAs in homolgy-based bioinformatics methods, 63 homologous candidate miRNA sequences were predicted. Totally, 64 potential miRNAs were determined.
Benzer Tezler
- Koyun (Ovis aries) rumeninde yaşayan bazı simbiyotik siliyatların sitolojik ve morfolojik yapıları
Cytological and morphological structures of some symbiotic ciliates living in the rumen of sheep (Ovis aries)
İSMAİL YILDIZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1997
BiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NACİYE GÜLKIZ ŞENLER
- Koyun (Ovis aries) PRND geni üzerindeki cinsiyete bağlı genetik farklılıkların araştırılması
Genotyping sheep (Ovis aries) PRND gene for sex-differential polymorphisms
ERDOĞAN PEKCAN ERKAN
- Koyun (Ovis aries)' larda abomazum mukozasındaki glikokonjugatların lektin histokimyasal karakterizasyonu
Lectin histochemical characterization of glycoconjugates in mucosa of the abomasum in the sheep (Ovis aries)
SEÇİL ZORLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
BiyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KENAN ÇINAR
- Koyun (Ovis aries)' ların trake, bronkus ve bronkulus mukoza glikokonjugatlarının histokimyasal karakterizasyonu
The histochemical characterization of mucosa glycoconjugates of trachea, bronchus and bronchulus of sheep (Ovis aries)
EMEL DEMİRBAĞ
Doktora
Türkçe
2012
Histoloji ve EmbriyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KENAN ÇINAR
- Koyun (Ovis aries)'larda makroskobik tükürük bezlerindeki glikokonjugatların lektin histokimyası ile belirlenmesi
The determination of glycoconjugates in macroscobic salivary glands in sheep (Ovis aries) by lectin histochemistry
BORA ÖZKARASU
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Histoloji ve EmbriyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. KENAN ÇINAR