Geri Dön

GbVe geninin allelik varyasyonu ve pamuk (Gossypium barbadense L.) bitkisinden izolasyonu

Allelic variation of gbve gene homolog and its isolation from cotton (Gossypium barbadense L.)

  1. Tez No: 343589
  2. Yazar: AYSEL ÖZGÜL ŞİŞMAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. YÜKSEL BÖLEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Pamuk, Türkiye'de ve dünyada tarımsal üretimi yapılan ve tekstil sanayiinin hammaddesi olan lifi için üretilen önemli bir endüstri bitkisidir. Ancak diğer bitkilerde olduğu gibi pamukta da üretimi sınırlandıran ve kalitesinde azalmalara neden olan pekçok hastalık vardır. Bu hastalıkların başında toprak kökenli bir fungus olan Verticillium dahliae Kleb.'in neden olduğu solgunluk hastalığı gelmektedir. Bu çalışmada, Gossypium barbadense türünde GbVe genininin pamuk bitkisinden izolasyonun yapılması ve allelik varyasyonunun araştırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla, GbVe geni üzerinde dizayn edilen primeler ile Gossypium hirsutum L. ve G. barbedense L. türlerinin yanısıra diploid pamuk türlerinine ait 32 adet pamuk genotipinde GbVe geninin amplifikasyonu yapılmıştır. Ayrıca, Gossypium barbedense L. türü içerisinde bulunan Aşkabat- 100 genotipinde, 1550 bç uzunluğunda homoloğu izole edilmiş ve sekanslanmıştır. Yapılan amplifikasyonlar sonucu farklı uzunlukta bantlar elde edilmiştir. Aşkabat- 100 genotipinden izole edilen sekans üzerinde ise 1836, 2059, 2853, 2944, 2945, 2946, 2949, 2952, , 2992, 3092, 3281 noktalarında tek nükleotid farklılıkları belirlenmiştir. Bununla birlikte, 1627. bazdan sonra 3 baz, 1503. ve 1803. bazlardan sonra birer baz eklendiği belirlenmiştir. Ayrıca, genotiplerde yapılan amplifikasyon sonucu 1000 bç büyüklüğünde bir bant elde edilmiş ve bu bantın solgunluk hastalığına dayanıklılıkları bilinen G. barbadense çeşitlerinde olmayıp, hastalığa hassas olan genotiplerde görüldüğü belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

Cotton is an important crop cultivated in Turkey and World for its fiber needed in textile industry. There are a lot of diseases of cotton reducing quality and yield as it happens in other plants. Soil born fungi, Verticillium dahliae Kleb. causes wilt disease is the most devastating disease of cotton. The goal of this work is to isolate GbVe gene from cotton (Gossypium barbadense) and to investigate its allelic variations. For this, the primers designed from GbVe gene used to amplify 32 cotton genotypes belonging to Gossypium hirsutum L. and G. barbadense L. and some diploid cotton species. On the other hand, 1550 bp of GbVe gene homolog was isolated and sequenced from Aşkabat- 100 genotype belonging to G. barbadense. After all amplifications, polymorphic bands were obtained. Single nucleotide polymorphism was detected at nucleotides at 1836, 2059, 2853, 2944, 2945, 2946, 2949, 2952,, 2992, 3092 and 3281 of sequences from Aşkabat- 100. It was also determined that 3 bases after the point of 1627, 1 base after 1503 and 1803 were added to the sequence. Also, amplification of genotypes yielded 1000 bp bands in G. hirsutum L. genotypes know as verticillium susceptible but no bands were in the G.barbadense L. genotypes know as verticillium resistance.

Benzer Tezler

  1. Primer glioblastoma (DSÖ 4. derece) hastalarında mdr1 geni ekspresyon ve metilasyonu

    Mdr1 gene expression and methylation on primary glioblastoma (who grade IV) patients

    YAHYA EFE GÜNER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    NöroşirürjiAnkara Üniversitesi

    Nöroşirürji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN ÇAĞLAR UĞUR

    YRD. DOÇ. DR. MEHMET TAŞPINAR

  2. Primer glioblastoma tümörlerinde long non coding RNA MALAT1'in prognostik öneminin araştirilmasi

    Investigation of the prognostic importance of long non coding RNA MALAT1 in primary glioblastoma tumors

    ÖMER GÖKAY ARGADAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    GenetikBursa Uludağ Üniversitesi

    Beyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN KOCAELİ

  3. Çelikhan-Erkenek arasında Doğu Anadolu Fayı`nın özellikleri

    Properties of the East Anatolian fault between Çelikhan and Erkenek

    OKTAY PARLAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Deprem Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Katı Yer Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. SERDAR AKYÜZ

  4. Ekmeklik buğday (Triticum aestivum L.) genotiplerinin kahverengi pas hastalığına dayanıklılığının doğal koşullarda morfolojik belirlenmesi ve moleküler karakterizasyonu

    Morphological and molecular characteristics of natural conditions of leaf rust resistance in bread wheat (Triticum aestivum L.) F2 populations

    EYLEM ÖRS

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    ZiraatNamık Kemal Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMET BAŞER

  5. Risk assessment and marine accident analysis in ice-covered waters

    Buzlu sularda risk değerlendirmesi ve deniz kaza analizi

    BEKİR ŞAHİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Denizcilikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Deniz Ulaştırma İşletme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERDAR KUM