GbVe geninin allelik varyasyonu ve pamuk (Gossypium barbadense L.) bitkisinden izolasyonu
Allelic variation of gbve gene homolog and its isolation from cotton (Gossypium barbadense L.)
- Tez No: 343589
- Danışmanlar: PROF. DR. YÜKSEL BÖLEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik ve Bilimleri Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Pamuk, Türkiye'de ve dünyada tarımsal üretimi yapılan ve tekstil sanayiinin hammaddesi olan lifi için üretilen önemli bir endüstri bitkisidir. Ancak diğer bitkilerde olduğu gibi pamukta da üretimi sınırlandıran ve kalitesinde azalmalara neden olan pekçok hastalık vardır. Bu hastalıkların başında toprak kökenli bir fungus olan Verticillium dahliae Kleb.'in neden olduğu solgunluk hastalığı gelmektedir. Bu çalışmada, Gossypium barbadense türünde GbVe genininin pamuk bitkisinden izolasyonun yapılması ve allelik varyasyonunun araştırılması amaçlanmıştır. Bu amaçla, GbVe geni üzerinde dizayn edilen primeler ile Gossypium hirsutum L. ve G. barbedense L. türlerinin yanısıra diploid pamuk türlerinine ait 32 adet pamuk genotipinde GbVe geninin amplifikasyonu yapılmıştır. Ayrıca, Gossypium barbedense L. türü içerisinde bulunan Aşkabat- 100 genotipinde, 1550 bç uzunluğunda homoloğu izole edilmiş ve sekanslanmıştır. Yapılan amplifikasyonlar sonucu farklı uzunlukta bantlar elde edilmiştir. Aşkabat- 100 genotipinden izole edilen sekans üzerinde ise 1836, 2059, 2853, 2944, 2945, 2946, 2949, 2952, , 2992, 3092, 3281 noktalarında tek nükleotid farklılıkları belirlenmiştir. Bununla birlikte, 1627. bazdan sonra 3 baz, 1503. ve 1803. bazlardan sonra birer baz eklendiği belirlenmiştir. Ayrıca, genotiplerde yapılan amplifikasyon sonucu 1000 bç büyüklüğünde bir bant elde edilmiş ve bu bantın solgunluk hastalığına dayanıklılıkları bilinen G. barbadense çeşitlerinde olmayıp, hastalığa hassas olan genotiplerde görüldüğü belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Cotton is an important crop cultivated in Turkey and World for its fiber needed in textile industry. There are a lot of diseases of cotton reducing quality and yield as it happens in other plants. Soil born fungi, Verticillium dahliae Kleb. causes wilt disease is the most devastating disease of cotton. The goal of this work is to isolate GbVe gene from cotton (Gossypium barbadense) and to investigate its allelic variations. For this, the primers designed from GbVe gene used to amplify 32 cotton genotypes belonging to Gossypium hirsutum L. and G. barbadense L. and some diploid cotton species. On the other hand, 1550 bp of GbVe gene homolog was isolated and sequenced from Aşkabat- 100 genotype belonging to G. barbadense. After all amplifications, polymorphic bands were obtained. Single nucleotide polymorphism was detected at nucleotides at 1836, 2059, 2853, 2944, 2945, 2946, 2949, 2952,, 2992, 3092 and 3281 of sequences from Aşkabat- 100. It was also determined that 3 bases after the point of 1627, 1 base after 1503 and 1803 were added to the sequence. Also, amplification of genotypes yielded 1000 bp bands in G. hirsutum L. genotypes know as verticillium susceptible but no bands were in the G.barbadense L. genotypes know as verticillium resistance.
Benzer Tezler
- Primer glioblastoma (DSÖ 4. derece) hastalarında mdr1 geni ekspresyon ve metilasyonu
Mdr1 gene expression and methylation on primary glioblastoma (who grade IV) patients
YAHYA EFE GÜNER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
NöroşirürjiAnkara ÜniversitesiNöroşirürji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN ÇAĞLAR UĞUR
YRD. DOÇ. DR. MEHMET TAŞPINAR
- Primer glioblastoma tümörlerinde long non coding RNA MALAT1'in prognostik öneminin araştirilmasi
Investigation of the prognostic importance of long non coding RNA MALAT1 in primary glioblastoma tumors
ÖMER GÖKAY ARGADAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
GenetikBursa Uludağ ÜniversitesiBeyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN KOCAELİ
- Çelikhan-Erkenek arasında Doğu Anadolu Fayı`nın özellikleri
Properties of the East Anatolian fault between Çelikhan and Erkenek
OKTAY PARLAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
Deprem Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiKatı Yer Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. SERDAR AKYÜZ
- Ekmeklik buğday (Triticum aestivum L.) genotiplerinin kahverengi pas hastalığına dayanıklılığının doğal koşullarda morfolojik belirlenmesi ve moleküler karakterizasyonu
Morphological and molecular characteristics of natural conditions of leaf rust resistance in bread wheat (Triticum aestivum L.) F2 populations
EYLEM ÖRS
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatNamık Kemal ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMET BAŞER
- Risk assessment and marine accident analysis in ice-covered waters
Buzlu sularda risk değerlendirmesi ve deniz kaza analizi
BEKİR ŞAHİN
Doktora
İngilizce
2015
Denizcilikİstanbul Teknik ÜniversitesiDeniz Ulaştırma İşletme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERDAR KUM