Geobacillus stearothermophilus 12 suşundan iki farklı alfa-L-arabinofuranosidaz geninin klonlanması, ekspresyonu, saflaştırılması ve karakterizasyonu
Cloning, expresion, purification and characterization of two different alpha-L arabinofuranosidase genes from Geobacillus stearothermophilus 12 strain
- Tez No: 343439
- Danışmanlar: PROF. DR. SABRİYE ÇANAKÇI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Geobacillus stearothermophilus 12, α-L arabinofuranosidaz, enzim saflaştırılması, enzim karakterizasyonu, Geobacillus stearothermophilus 12, α-L arabinofuranosidase, enzyme purification, enzyme characterization
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Gerçekleştirilen bu çalışmada, daha önce yapılan çalışmalarla iki adet arabinofuranosidaz enzimine sahip olduğu belirlenen Geobacillus stearothermophilus 12 bakterisinin bu her iki enzimine ait olan gen dizileri öncelikle ortaya çıkarıldı. Her bir gen bir E. coli ekspresyon vektörü olan pET28a'ya klonlanarak E. coli BL21 pLys hücresi içinde ekspres edildi. Ekspres edilen proteinler sahip oldukları histidin kuyruktan faydalanılarak afinite kromotografisi yardımıyla saflaştırıldı. Saflaştırılan proteinlerin karakterizasyonları gerçekleştirildi. Her iki enzimin de 56-57 kDa civarında olduğu, optimum çalışma sıcaklıklarının birbirlerinden farklı olup Abf1'in optimum olarak 65°C'de, Abf2'nin ise 50°C'de aktivite gösterdiği, optimum çalışma pH'larının ise Abf1'in 6,5; Abf2'nin ise 5,5 olduğu belirlendi. Abf 1'in 6,0'nın üzerindeki pH'larda uzun süre kararlı olduğu, buna karşı Abf2'nin pH kararlılığının iyi olmadığı tespit edildi. Her iki enzimin de subtrat olarak p-NP α-L arabinofuranosidden başka bir substratı kullanmadığı görüldü.
Özet (Çeviri)
This study, firstly, finds out the gene sequence of two arabinofuranosidase enzymes belonging to the bacteria called Geobacillus stearothermophilus 12 which has been found out to have these two enzymes in former studies. On the basis of these sequences, each gene is expressed in the cell of E. coli BL21 plys by cloning them to pET28 which is an E.coli expression vector. The proteins expressed were purified via affinity chromatography and by making use of their Histidine Tag. The characterization of these purified proteins was done. In this study, it is shown that both enzymes are about 57 kDa and that they have different optimum activation temperature. The optimum activation temperature of Abf1 is 65°C whereas it is 50°C for Abf2. Moreover, it is found out that the optimum PH activation of Abf1 is 6,5 and it is 5,5 for Abf2. It is also identified that Abf1 is stable a long time at pH over 6,0 but the pH stability of Abf2 is not good. It is also observed that both enzymes do not use any substrate other than pNP a-L arabinofuranosidase.
Benzer Tezler
- Geobacillus toebii HBB-218 tarafından üretilen bakteriyosinin bozulmayı engellemek amacıyla konserve gıdalara uygulanması
Application of the bacteriocin from geobacillus toebii HBB-218to inhibit spoilage in canned foods
AYŞE ALKIŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GAMZE BAŞBÜLBÜL
- Geobacıllus sp. tarafından termostabil ?-amilaz üretimi
Thermostable ?-amylase production by Geobacillus sp.
SENNUR ÇALIŞKAN
- Comparision of two different methods for the determination of residues of tetracycline antibiotics in beef and chicken meat
Dana ve tavuk etinde tetrasiklin antibiyotiği kalıntılarının tayininde kullanılan iki farklı yöntemin karşılaştırılması
NİL KOÇ
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Beslenme ve DiyetetikYeditepe ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. İSKENDER KARALTI
- Termofilik geobacillus üyelerinin hücresiz süpernatantlarının antimikrobiyal etkilerinin taranması ve potansiyel bakteriyosin benzeri bir termostabil peptidin kısmi karakterizasyonu
Screening of antimicrobial effects of cell-free supernatants of members of thermophilic geobacillus and partial characterization of a potential bacteriocine-like a thermostable peptide
DENİZ ABACI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARZU ÇÖLERİ CİHAN
- Characterisation of immobilised Geobacillus stearothermophilus L-arabinose isomerase
İmmobilize Geobacillus stearothermophılus L-arabinoz izomeraz'ın karakterizasyonu
ZEHRA NAZLI KIZILÇAY
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEVİL YÜCEL