Stem-loop RT-polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile mikro RNA (miRNA) gen anlatım farklılıklarının tespiti
Micro RNA (miRNA) gene expression discrepancy determination with stem-loop RT polymerase chain reaction (PCR) method
- Tez No: 342083
- Danışmanlar: PROF. DR. UĞUR ÖZBEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Gen ifadesi, Katenin, Lösemi, Mikro RNA, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Prekürsör hücreli lenfoblastik lösemi-lenfoma, Gene expression, Catenin, Leukemia, Micro RNA, Polymerase chain reaction, Precursor cell lymphoblastic leukemia-lymphoma
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
MikroRNA lar (miRNA), 19-23 nükleotid uzunluğunda küçük, tek iplikli ve fonksiyonel protein kodlamayan RNA?lardır. miRNA lar gelişim, hücre farklılaşması, apoptoz ve proliferasyon gibi önemli biyolojik süreçlerde görev yaparlar. Gelişim esnasında ve gen anlatımında büyük roller üstlendiklerinin bilinmesine rağmen normal ve neoplastik hücrelerdeki anlatım düzeyleri ve fonksiyonları hakkında sınırlı sayıda bilgi mevcuttur. Ayrıca miRNA, hem tümör baskılayıcı genleri (TS) hem de onkogenleri regüle etmektedirler, bu fonksiyonları bakımından oncomiR veya TS miRNA olarak adlandırılırlar. miRNA lar hematopoetik hastalıklarda rol oynamaktadır. miRNA gen anlatımlarının farklı kanser türlerinde belirlenmesi, kanser tanı ve tedavisinde de kullanılabilecek önemli bir araç olarak görülmektedir. Çalışmamızda ALL hastalarının (n=42) kemik iliği örnekleri ve ALL açısından sağlıklı bireyin (n=3) periferik kanlarından elde edilen CD19+ örneklerin daha önce yapılan çalışmalar sonucu lösemi hastalarında gen anlatımının aşırı derecede artmış olduğu belirlenen Beta-katenin (CTNNB1) genini hedef alan miR-214 mikroRNA'sı, Stem Loop Ters Transkriptaz Polimeraz Zincir Reaksiyonu (Stem-Loop RT-PZR) ile incelenmiştir. Yayınlarda miR-214'ün CTNNB1'i direkt olarak hedeflediği bildirildiğinden CTNNB1 seviyesi artarken miR-214 seviyesinin azalması beklenirdi fakat çalışmamız sonucu hasta grubumuzda her iki mRNA düzeyinin, miR-214 (p=0,6989) ve CTNNB1(p=0,5027), yüksek olduğu belirlendi. Bu nedenle, diğer hastalıklardan farklı olarak B-ALL hastalarında miR-214'ün CTNNB1'i dolaylı yoldan etkilediği düşüncesine varılmıştır. Ayrıca farklı klinik özellikler ile miR-214 anlatımı arasındaki ilişkiler araştırılmıştır. Bunun yanında çalışmada işlevselliği ve yüksek hassasiyeti nedeniyle seçilen Stem-Loop RT qPZR yöntemi ilk defa B-ALL patogenezi ve miRNA ilişkisinin araştırılmasında uygulanmış ve bu çalışma ile yöntem bölümümüzde farklı araştırmalarda kullanılmaya başlanmıştır.
Özet (Çeviri)
MicroRNAs (miRNAs) are small (~19/23 nt in length), non-protein coding RNAs and play important roles in biological processes like development, cell differentiation, proliferation and apoptosis. Their role in development and gene expression are well known where as limited evidence is published on their roles in normal and neoplastic cells regulations. miRNAs which are associated with various cancers, are located especially in fragile regions of chromosomes. In addition, miRNAs are regulate the tumor suppressor and oncogenes therefore they called as
Benzer Tezler
- Identification of risk factors and bio-markers for food allergy from ingested microRNAs
Mideye girmiş mikro-RNA'lardan yemek alerjisi için yeni biyobelirteç ve risk faktörlerin belirlenmesi
OYA IŞILAY CANİK
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyomühendislikSabancı ÜniversitesiMoleküler Biyoloji, Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ STUART JAMES LUCAS
DR. ÖĞR. ÜYESİ SİBEL ÇETİNEL
- Gemilerin manevra denklemlerinin bilgisayarla çözümü
The Solutions of equations of ship manoeuvres by the computer
EMİN KORKUT
- NiMn,NiMnP+ ve CrFe alaşım ince filmlerinde elektron spin rezonans (ESR) ve direnç ölçümleri
Başlık çevirisi yok
MUSTAFA ÖZDEMİR
Doktora
Türkçe
1998
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiFizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YILDIRHAN ÖNER
- Çok makinalı güç sistemlerinde parametre adaptif kontrol yönteminin incelenmesi
Investigation of parameter adaptive control method for MMPS
AYŞEN DEMİRÖREN
Doktora
Türkçe
1993
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiPROF.DR. M. EMİN TACER
- Elektrik enerji iletim şebekelerinin optimal genişletme planlaması
Optimal expansion planning of power transmission networks
NAZİF HÜLAGÜ SOHTAOĞLU
Doktora
Türkçe
1994
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiPROF.DR. NESRİN TARKAN