Geri Dön

Sığırlarda geniş spektrumlu beta-laktamaz sentezleyen Escherichia coli prevalansının belirlenmesi

Determination of the prevalence of extended spectrum beta-lactamase producing escherichia coli in cattle

  1. Tez No: 340736
  2. Yazar: SİBEL ELMACIOĞLU
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ÖZKAN ASLANTAŞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Geni?lemi? spektrumlu beta-laktamaz, Escherichia coli, sığır, Beta laktamazlar, Prevalans, Sığırlar, Extended spectrum beta-lactamase, Escherichia coli, cattle, Beta lactamases, Prevalence, Cattles
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Mustafa Kemal Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Sağlık Bilimleri Bölümü
  12. Bilim Dalı: Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Sığırlarda Geni?lemi? Spektrumlu Beta-laktamaz Sentezleyen Escherichia coli Prevalansının Belirlenmesi Bu çalı?mada, Hatay?da yetiştirilen sığırlarda geniş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) sentezleyen Escherichia coli prevalansının belirlenmesi amaçlandı. Rektal svab örneklerinden 2 mg/L sefotaksim içeren Eosine Methylene Blue (EMB) agara ekimleri yapıldı. Pozitif izolatlar fenotipik doğrulama testleri ile konfirme edildi ve GSBL tipi polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ve sekans analizi ile araştırıldı. GSBL pozitif izolatların antimikrobiyal duyarlılıkları disk difüzyon testi ile filogenetik dağılımları ise PZR ile belirlendi. GSBL sentezleyen E. coli rektal svab örneklerinin %8.3?ünden (26/312) izole edildi. İzolatlarda en yaygın GSBL genleri sırasıyla blaTEM-1b (n=21), blaCTX-M-15 (n=12), blaCTX-M-1 (n=1), blaCTX-M-3 (n=2) ve blaOXA (n=1) olarak tespit edildi. Fakat izolatlarda blaSHV geni tespit edilmedi. GSBL pozitif izolatların tamamı sefotetan ve imipeneme duyarlı bulunurken; ampisilin (%100), seftriakson (%100), sefalotin (%96.2), sefaperozon (%88.5), streptomisin (%80.8), sulfametoksazol/trimetoprim (%76.9), tetrasiklin (%73.1), kloramfenikol ve kanamisin (%50), nalidiksik asit ve amoksisilin/klavulanik asit (%46.2), aztreonam (%38.5), siprofloksasin (%34.6), gentamisin (%11.5) ve sefoksitine (%3.8) değişen oranlarda direnç saptandı. Filogenetik analizler GSBL pozitif izolatların B1 (n=1, %50), A (n=9, %34.6) ve D1 (n=1, %3.8) olmak üzere 3 grupta yer aldığını gösterdi. Bu çalışma ile Türkiye?de ilk kez sığırlarda CTX-M-15, CTX-M-11, CTX-M-3 ve OXA-1 üreten fekal E. coli taşıyıcılığı tespit edilmiştir. Ayrıca, mevcut çalışmanın sonuçları Hatay ilinde yetiştirilen gerek süt ve gerekse de besi sığırlarının GSBL sentezleyen E. coli yönünden potansiyel rezervuar olduğunu göstermektedir. Bu nedenle, GSBL sentezleyen bakteriler dahil antimikrobiyal dirençli bakteriler hayvanlarda sürekli olarak izlenmeli ve GSBL pozitif bakterilerin klonal yayılımının önlenmesi için antibiyotikler bilinçli olarak kullanılmalıdır.

Özet (Çeviri)

Determination of the Prevalence of Extended Spectrum Beta-lactamase Producing Escherichia coli in Cattle In this study, it was aimed to determine the prevalence of extended-spectrum beta-lactamase (ESBLs) producing Escherichia coli in cattle in Hatay. Rectal swab samples were spread on the Eosin Methylen Blue (EMB) agar containing cefotaxime (2 mg/L). Isolates were confirmed using ESBL confirmatory tests. ESBL types were investigated by polymerase chain reaction (PCR) and sequencing. Antimicrobial susceptibility of the isolates was determined by disk diffussion method and distribution of phylogenetic groups was also determined by PCR. ESBL producing E. coli was isolated from 8.3% (26/312) of rectal swab samples. The most common ESBL gene was blaTEM-1b (n=21), followed by blaCTX-M-15 (n=12), blaCTX-M-1 (n=1), blaCTX-M-3 (n=2), and blaOXA (n=1). Howevwe, blaSHV gene was not detected. All ESBL positive isolates were found to be sensitive to cefotetan and imipenem, while variable rates of resistance were determined against other antimicrobials including ampicillin (100%), ceftriaxone (100%), cefalothin (96.2%), cefaperozone (88.5%), streptomycin (80.8%), trimethoprim-sulfamethoxazole (76.9%), tetracycline (73.1%), chloramphenicol and kanamycin (50%), nalidixic acid, amoxicillin/clavulanic acid (46.2%), aztreonam (38.5%), ciprofloxacin (34.6%), gentamycin (11.5%) ve cefoxitin (3.8%). Phylogenetic analysis revealed three groups being B1 (n=13, 50%), A (n=9, 34.6%), and D1 (n=4, 15.4%). For the first time, faecal carriage of CTX-M-15, CTX-M-11, CTX-M-3 and OXA-1 producing E. coli was detected in cattle in Turkey. In addition, results of the present study showed that both dairy cattle and beef cattle are potential reservoir of ESBL producing E. coli in Hatay. Therefore, continuous monitoring for antimicrobial resistant bacteria including ESBL producing bacteria in animals and prudent use of antimicrobials is necessary to prevent their clonal spread.

Benzer Tezler

  1. Geniş spektrumlu beta laktamaz ve AmpC beta laktamaz üreten escherichia coli ve klebsiella pneumoniae kökenlerinde karbapenemlere direnç ve mutant engelleme konsantrasyonunun belirlenmesi

    Determination of carbapenem resistance and mutant prevention concentration escherichia coli and klebsiella pneumoniae strains producing extended spectrum beta lactamases and AmpC beta lactamases

    GÜLŞEN ALTINKANAT GELMEZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜNER SÖYLEDİR

  2. Burdur ilindeki buzağıların dışkı örneklerinde genişlemiş spektrumlu beta laktamaz (GSBL) üreten Escherichia coli varlığının belirlenmesi

    Detection of extended spectrum beta lactamase producing Escherichia coli in fecal samples of calves in Burdur province

    DURMUŞ YILDIRIM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Veteriner HekimliğiMehmet Akif Ersoy Üniversitesi

    Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FARUK PEHLİVANOĞLU

  3. Farklı lösemi tiplerinde nükleer manyetik rezonans tabanlı metabolomik profilleme

    Nuclear magnetic resonance based metabolomic profiling in different types of leukemia

    AYŞE ZEHRA GÜL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyokimyaBezm-İ Alem Vakıf Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞAHABETTİN SELEK

  4. Retikülo peritonitis traumatikali sığırların teşhis ve prognozunda kan proteinleri ve glutaraldehit testinin önemi

    Başlık çevirisi yok

    MAHMUT OK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1991

    Veteriner HekimliğiSelçuk Üniversitesi

    Veterinerlik İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. VEYSİ ASLAN

  5. Osteoporoz risk faktörleri arasında çinkonun yeri

    The role of zinc in the risk factors of osteoporosis

    GÜLSÜN ÖZTÜRK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    PROF. M ZEKİ TANER