Mesane ve böbrek kanserlerinde bikunin geninin ifade düzeyinin araştırılması ve mutasyonel taraması
Mutational screening and investigation of gene expression status of bikunin gene among bladder and kidney cancer patients
- Tez No: 339454
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MEHRİ İĞCİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Böbrek neoplazmları, Gen ifadesi, Genler, Mesane neoplazmları, Mutasyon, Neoplazmlar, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Polimorfizm-genetik, Kidney neoplasms, Gene expression, Genes, Urinary bladder neoplasms, Mutation, Neoplasms, Polymerase chain reaction, Polymorphism-genetic
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Alfa-1-mikroglobulin/bikunin öncül (AMBP) geni 10 ekzon, 9 intron içermekte olup 20 kb uzunluğundadır. AMBP geninin ilk 6 ekzon Alfa-1-mikroglobulini şifrelerken, ekzon 8 ve 9 Bikuninin Kunitz bölgelerini, ekzon 7 ve 10 da bikuninin N ve C sonlarını şifrelemektedir. AMBP ile Bikunin arasında aynı gen üzerinden sentezlenmeleri haricinde işlevsel olarak bir bağlantı yoktur. Son yıllarda yapılan deneysel ve klinik çalışmalar bikuninin birçok olayda yer aldığını göstermektedir. Bikuninin hücre büyümesinde ve tümör hücrelerinin yayılmasında proteaz önleyici etkisinin olduğu bilinmektedir. Bikunin uPA ve uPAR gen ifadesini önemli ölçüde düşürerek kanser hücresi yayılımını azaltmaktadır. Bu zamana kadar mesane ve böbrek kanserinde bikuninin protein seviyesine dayalı deneyler bulunmaktadır. Ancak moleküler düzeyde mesane ve böbrek kanserli hastalarla yapılmış bir çalışma bulunmamaktadır. Mesane ve böbrek kanserinde bikuninin moleküler düzeyde işlevi henüz aydınlatılamamıştır. Bu çalışmada 19 mesane ve 50 böbrek kanserli hastanın normal ve tümörlü dokularından RNA ve DNA elde edildi. Bu örneklerde kısmi miktarlara dayalı RT-PCR yöntemi kullanılarak bikunin mRNA seviyeleri tespit edildi. Ayrıca bikunin geninin ekzonik bölgelerinde gen çokyapılılık (polymorphism) taraması yapıldı. Bu değişimler SSCP yöntemi ve dizileme cihazı ile gösterildi. Çalışma sonucunda bikunin mRNA seviyesinin mesane kanserli dokularda, normal dokulara göre azaldığı görüldü. Ancak mesane kanserli hastalarda anlamlı bir fark bulunamamıştır (p>0,05). Böbrek kanserli hastaların tümörlü dokularında, normal dokularına oranla bikunin mRNA seviyesinde anlamlı bir şekilde azalma tespit edildi (p<0,05). Ayrıca, kanserli dokularda AMBP geninin 10. ekzonunda tek nükleotid değişim gözlendi (rs80057939) (p>0,05). Sonuç olarak; bikuninin böbrek kanserinin moleküler mekanizmasında önemli bir rolü olabileceği, tanı ve tedavide bir belirteç ve ilaç olarak fayda sağlayabileceği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Alpha-1-mikroglobulin/bikunin precursor gene comprises 10 exons and 9 introns, 20 kb in length. First six exons encode Alpha-1-mikroglobulin, 8th and 9th exons encode Kunitz domains, 7th and 10th exons encode C and N terminal regions of bikunin. Experimental and clinical results show that bikunin functions in many processes. Bikunin acts as protease inhibitor in cell growth and spread of tumor cells. Bikunin provides significant reduction in expression of uPA and uPAR, thus the invasion and metastasis of tumor cells. There are some experiments based on bikunin protein level in bladder and kidney cancers. However, there is no such a detailed study at molecular level performed with bladder and kidney tumors. Bikunin molecular function in these cancers remains unclear. Herein, total RNA and DNA were obtained from normal and tumor tissues of 19 bladder and 50 kidney cancer patients. Using RNA samples, bikunin mRNA levels were detected using semi-quantitative RT-PCR. Mutational screening was performed at the exons of bikunin gene via SSCP. SNPs were shown using automatic sequencing device. mRNA levels of bikunin in tumor tissues decreased compared with normal tissues in bladder cancer. However, there is no significant difference between tumor and normal samples of bladder (p>0,05). In kidney cancer, bikunin mRNA levels decreased significantly in tumor tissues compared with normal tissues (p<0,05). rs80057939 was detected at the 10th exon of bikunin in tumor tissues (p>0,05). In conclusion, bikunin might contribute to kidney cancer pathogenesis and may be used as a potential marker and drug for diagnosis and treatment.
Benzer Tezler
- Sitokeratin 7 ve sitokeratin 20 immünboyanmasının kolorektal kanserlerin sito-histomorfolojik ayırıcı tanısına katkısı
Contribution of cytokeratin 7 and cytokeratin 20 immunostaining to the cyto-histomorphologic diferential diagnosis of colorectal carcinomas
TURGUT AYDIN
- Radikal sistektomide ileal konduit üriner diversiyon ile kontinan üriner diversiyon uygulanan hastalardaki yaşam kalitesinin değerlendirilmesi
Evaluation of quality of life of patients with urinary diversion and ileal conduit after radical cystectomy
AYKUT BAŞER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
ÜrolojiPamukkale ÜniversitesiÜroloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALİ ERSİN ZÜMRÜTBAŞ
- Tıbbi Onkoloji Kliniğinde berrak hücreli olmayan böbrek hücreli kanser tanısıyla takip edilen hastaların, demografik, klinik ve patolojik özelliklerinin incelenmesi
Demographic, clinical and pathological characteristics of patients with non-clear cell renal cell carcinoma in the Medical Oncology Clinic
HÜSEYİN İFLAZOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
OnkolojiTrakya Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUHAMMET BEKİR HACIOĞLU
- Mesane tümörlü hastalarda immunoscore'un onkolojik sonuçları ve prognozu öngörmede belirteç olarak değerlendirilmesi
Evaluation of immunoscore as A indicator in predicing prognosis and oncological results in patients with bladder tumor
MUHAMMED FURKAN AYDOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
OnkolojiSelçuk ÜniversitesiÜroloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ALİ FURKAN BATUR
- Berrak hücreli renal karsinoma hastalarında e-kaderin (ECAD) ve ölüm aracılı protein kinaz (DAPK) genlerinde metilasyon araştırması
DNA methylation study of e-cadherin (ECAD) and death-associated protein kinase (DAPK)gene at clear cell renal carsinoma
AYTÜL KİTAPCI