Geri Dön

Anaerobik rumen funguslarının filogenetik analizi ve lipit metabolizmasındaki rollerinin incelenmesi

Phylogenetic analysis of anaerobic rumen fungi and investigation of their roles in lipid metabolism

  1. Tez No: 338776
  2. Yazar: BÜLENT KAR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET SAİT EKİNCİ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Rumen, fungus, filogenetik, moleküler, yağ asidi, konjuge linoleik asit (KLA), Rumen, fungi, phylogenetic, molecular, fatty acid, conjugated linoleic acid (CLA)
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışmada rumen mikrobiyolojisinin en önemli halkalarından birini oluşturan anaerobik rumen funguslarının moleküler yönden tanımlanmaları, filogenetik dağılımın belirlenmesi, hücre yağ asidi kompozisyonlarının belirlenmesi ve konjuge linoleik asit (KLA) sentezindeki rolleri araştırılmıştır. Moleküler yönden Neocallimastix sp. (GMLF1-2-3-4-7-8-9-10-15-20-22-23-24-25), Caecomyces sp. (GMLF12-13-14), Orpinomyces sp. (GMLF5-6-16-18-19-21) ve Piromyces sp. (GMLF17) izolatlarının 18S rRNA, ITS bölgesi ve 28S rRNA bölgeleri incelenmiştir. 1400 bç 18sRNA, 800 bç. ITS bölgesi ve 2650 bç 28S rRNA dizileme sonuçları elde edilmiştir. Toplamda yaklaşık olarak 4850 bç. dizi sonucu elde edilmiştir. Cinslerin filogenetik ağaçlardaki yerleri belirlenmiştir. Yağ asidi kompozisyonları incelendiğinde en yüksek yağ asidi oranı Myristik asit (%36.5) olarak Piromyces sp. (GMLF17) suşunda bulunmuştur. Genel olarak Myristik asit tüm suşlarda yüksek bulunmuştur. Pentadecanoik asit Orpinomyces sp. (GMLF5) suşu hariç diğer suşların hiç birinde belirlenememiştir. Bu çalışma Caecomyces sp., Neocallimastix sp., Orpinomyces sp. ve Piromyces sp. suşlarının KLA formasyonunda doğrudan etkili olduğunu göstermektedir. Ayrıca karışık kültürler yerine cins düzeyinde yapılan ilk çalışma özelliğine sahiptir. KLA aktiviteleri incelendiğinde en yüksek aktivite %17.4 olarak Caecomyces sp. (GMLF12) suşunda belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

In this study, the definition of anaerobic rumen fungi, which constitutes one of the important chains of rumen microbiology, in terms of molecular; the definition of filogenetic distribution and composition of cell fatty acids and the roles in conjugated linoleik acid (CLA) synthesis were investigated. 18S rRNA, ITS regions and 28S rRNA of Neocallimastix sp. (GMLF1-2-3-4-7-8-9-10-15-20-22-23-24-25), Caecomyces sp. (GMLF12-13-14), Orpinomyces sp. (GMLF5-6-16-18-19-21) and Piromyces sp. (GMLF17) samples were investigated in terms of molecular. The region of 1400 bp 18SRNA, 800 bp ITS and the sequencing results of 2650 bç 28S rRNA were obtained. Nearly 4850 bç sequencing results were obtained in total. The places of genus at the filogenetic trees were decided. When the fatty compositions were investigated, the highest rate of fatty acid was found in Piromyces sp. (GMLF17) strains as myristik acid (%36.5). Generally, myristic acid was found in the highest level for all strains. Pentadecanoik acid was not defined in other strains except from Orpinomyces sp. (GMLF5). This study shows that Caecomyces sp., Neocallimastix sp., Orpinomyces sp. and Piromyces sp. strains are directly effective in CLA formations. Furthermore, this is the first study on genus level instead of mixed species for CLA formation. When CLA activities were investigated, the highest activity was found as %17.04 (48th timing zone) in Caecomyces sp. (GMLF12) strains.

Benzer Tezler

  1. Tunceli'de yayılış gösteren ruminant hayvanlardaki anaerobik fungusların moleküler tanımlanması

    Molecular identification of anaerobic fungi in ruminant animals distributed in Tunceli

    MURAT ÜSTÜNTAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyoteknolojiMunzur Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. BÜLENT KAR

  2. Rumenden anaerobik gut fungus izolasyonu ve bazı fibrolitik enzimlerinin karakterizasyonu

    Isolation of anaerobic gut fungis from rumen and characterization of some fibrolytic enzymes

    MAKBULE CAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    GenetikKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Zootekni Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET SAİT EKİNCİ

  3. Effect of rumen fungi on potential of biogas production in anaerobic digesters fed with different lignocellulosic compounds

    Rumen funguslarının farklı lignoselülozik bileşiklerle beslenen anaerobik çürütücülerdeki biyogaz üretim potansiyeline etkisi

    ELİF YILDIRIM

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Çevre MühendisliğiBoğaziçi Üniversitesi

    Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BAHAR İNCE

    DR. SEVCAN AYDIN

  4. Rumen funguslarının izolasyonu ve bu funguslara ait enzim genleri üzerine moleküler çalışmalar

    Isolation of rumen fungi and molecular studies on their enzyme coding genes

    UĞUR ÇÖMLEKCİOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyoteknolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Zootekni Bölümü

    DOÇ. DR. EMİN ÖZKÖSE

  5. Uçucu yağların bazı rumen funguslarının yaşamsal ve fibrolitik enzim sistemleri üzerine etkisinin araştırılması

    The effects of essential oils on the survival and fibrolitic enzyme activities of some rumen fungi

    KADRİYE DALFESOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyoteknolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Zootekni Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET SAİT EKİNCİ