Geri Dön

Türkiye'deki alabalıkların (Salmo trutta L.) moleküler filogenisi

Molecular phylogeny of brown trouts (Salmo trutta L.) in Turkey

  1. Tez No: 334662
  2. Yazar: NAZAN ÖZEN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FEVZİ BARDAKCI
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Alabalıklar, Filogeni, Mitokondriler, Salmo trutta labrax, Trouts, Phylogeny, Mitochondria, Salmo trutta labrax
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Salmo trutta L. Avrasya ve Kuzey Afrika'da bulunan doğal bir salmonid türüdür. Türün doğal yayılış alanı Norveç'in kuzeyinden Kuzey Afrika'daki Atlas dağlarına kadar uzanmaktadır. Bu çalışmada Türkiye'deki Salmo trutta L. populasyonlarının filogenetik ilişkilerinin belirlenmesi amacıyla mitokondrial D-loop (displacement loop) ile nükleer DNA ITS1 bölgeleri kullanılmıştır. Mitokondri DNA verilerinin analizinde daha önceki çalışmalarda kullanılan diziler GenBank'tan alınarak çalışmaya eklenmiştir. Sonuçta altı ana soy hattı tanımlanmış ve bunlardan dört soy hattının (Adriyatik, marmoratus, Tigris, Danubian) Türkiye'de bulunduğu belirlenmiştir. marmoratus soy hattının varlığı ilk kez bu çalışmada ortaya konmuştur. Mitokondri DNA verileri ve nükleer DNA verileri birlikte kullanılarak daha doğru filogenetik çıkarsamalar gerçekleştirilmiştir. Elde edilen veriler özellikle Danubian soy hattı ile Adriyatik ve Tigris soy hattı arasında ikincil temasların olduğunu desteklemiştir. Bu çalışma Türkiye'deki alabalık populasyonlarının yüksek derecede çeşitlilik gösterdiğini ve eşsiz bir genetik profile sahip olduğunu ortaya koymuştur.

Özet (Çeviri)

Salmo trutta L. is a native salmonid species with a range from Eurasia and North Africa. Its natural range extends from northern Norway to the Atlas Mountains of North Africa. In this study, mitochondrial displacement loop (D-loop) and nuclear DNA ITS1 were used for determining the phylogenetic relationships of Salmo trutta L. in Turkey. Mitochondrial DNA data was analysed by combining the sequences of the same mitochondrial DNA region deposited in GenBank belonging to brown trout lineages from other geographic regions. As a result, six main evolutionary lineages were defined, and it was determined that four of them (Adriatic, marmoratus, Tigris, Danubian) are existed in Turkey. The existence of marmoratus lineage was reported in this study for the first time. Phylogenetic inferences has been made by evaluating both mitochondrial and nuclear DNA sequence data. The results of this study indicated the secondary contacts, especially among Danubian, Adriatic and Tigris lineages. In addition, the lineages of Turkish brown trout populations are highly divergent and mainly have a unique genetic structure.

Benzer Tezler

  1. Türkiye doğal alabalık (Salmo trutta L., 1758) populasyonlarında mikrocoğrafik ve makrocoğrafik mikrosatelit DNA varyasyonu

    Micro- and macro-geographic microsatellite DNA variation native brown trout (Salmo trutta L., 1758) populations in Turkey

    SERDAL ARSLAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    BiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FEVZİ BARDAKCI

  2. A study on the structures of natural trout populations in Turkey

    Türkiye'deki doğal alabalık toplumlarının genetik yapılarının incelenmesi

    AYŞE ZEHRA FİDAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1995

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    DOÇ.DR. İNCİ TOGAN

  3. Alkylphenols in two rivers of Turkey and assessment of nonylphenol bioaccumulation leading to histological and biochemical changes in the liver of rainbow trout

    Türkiye'deki iki nehirde alkilfenol ölçümü ve nonilfenolün biyolojik birikimi ile buna bağlı olarak rainbow trout karaciğerlerinde meydana gelen histolojik ve biyokimyasal değişikliklerin tesbiti

    CEVDET UĞUZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2001

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    PROF.DR. MESUDE İŞCAN

    PROF.DR. İNCİ TOGAN

  4. Yersinioz hastalığından korunmada aşı uygulamaları ve bu uygulamaların sonuçlarının değerlendirilmesi

    Başlık çevirisi yok

    T.TANSEL TANRIKUL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1994

    Su ÜrünleriEge Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OSMAN YÜREKLİTÜRK

  5. Türkiye``deki alabalık işletmeciliğinin ekonomik fayda açısından değerlendirilmesi ve Isparta örneği

    A Determination on the economical value of traut farmers in Turkey and Isparta model

    NURDAN KUŞAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    EkonomiSüleyman Demirel Üniversitesi

    İktisat Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. MEVLÜT KARABIÇAK