Sepsis tanısında kan kültürü ve multipleks real tıme PCR'ın tanısal performansı
Diagnostic performance of multiplex real time PCR and blood culture in diagnosis of sepsis
- Tez No: 326188
- Danışmanlar: PROF. DR. E. HALİS AKALIN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Sepsis, multipleks real time PCR, kan kültürü, Kan bileşenlerini ayırma, Kan testleri, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Teşhis, Teşhis-ayırıcı, Sepsis, multiplex real time PCR, blood culture, Blood component removal, Hematologic tests, Polymerase chain reaction, Diagnosis, Diagnosis-differential
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Uludağ Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
ÖZETSepsis, bir çok sistemi tutan, özellikle hemodinamik değişikliklere yol açan, şok, organ fonksiyon bozukluğu ve organ yetmezliğine kadar giden öldürücü bir enfeksiyon hastalığıdır. Kan kültürü duyarlılığının düşük olması nedeniyle sepsis şüpheli hastaların önemli bir kısmında etken izole edilememekte, bu durum tanı ve tedavi konusunda sorunlara yol açmaktadır.Bu çalışmada amacımız kan kültürü sistemlerine göre daha hızlı ve daha duyarlı sonuçlar verdiği iddia edilen multipleks real time polimeraz zincir reaksiyonu yönteminin (LightCyclerTM SeptiFast) tanısal performansını ve tedaviye olası etkilerini değerlendirmektir.Çalışmaya nozokomiyal sepsis tanısı alan 67 hastadan toplam 78 sepsis atağına ait örnek dahil edildi. Ateş ve herhangi bir sepsis bulgusu olmayan 22 erişkin ile kontrol grubu oluşturuldu. Sepsis tanısı alan 24'ü kadın(%36), 43'ü erkek(%64) erişkin hastada yaş ortalaması 55,7(21-95) idi.Sepsis ataklarında kan kültürü ile etken mikrooganizmayı saptama oranı %32 olarak, polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile etken mikroorganizmayı saptama oranı ise %44,9 olarak bulundu.Kan kültürü ve PCR'ı birlikte değerlendirdiğimizde, 78 sepsis atağında toplam 65 mikroorganizma türü izole edildi. Bu türlerin 19 tanesi her iki yöntem ile aynı atakta izole edildi. Kan kültürü ile PCR'ın saptayamadığı 8'i etken, 4'ü kontaminasyon olarak değerlendirilen toplam 12 mikroorganizma türü, PCR ile ise kan kültürünün saptayamadığı 33'ü etken, biri kontaminasyon olarak değerlendirilen toplam 34 mikroorganizma türü saptandı.Sepsis ataklarında kan kültürü ile PCR sonuçlarını kendi aralarında karşılaştırdığımızda, iki yöntem arasında istatistiksel olarak orta derecede uyum olduğu görüldü(Kappa değeri: 0,445, p<0,001). Kan kültürü ve PCR tarafından saptanan mikroorganizma türlerini ele aldığımızda iki yöntem arasındaki uyumun istatistiksel olarak yeterli olmadığı belirlendi(Kappa değeri: 0,160, p=0,07). iiiToplam 78 sepsis atağında PCR sonuçları nedeniyle retrospektif olarak değerlendirme yapıldığında tedavi değişikliği yapılabilecek 10 atak (%12,8) olduğuna karar verildi.Yoğun bakım üniteleri gibi sepsis tanısının sık konulduğu ve antibiyotik kullanımının yaygın olduğu bölümlerde sepsis ataklarında kan kültürüne ek olarak SeptiFast yönteminin kullanılmasının faydalı olabileceğini düşünmekteyiz.
Özet (Çeviri)
SUMMARYSepsis is a multisystem disease, typically leading to hemodynamic changes, shock, organ dysfunction and organ failure and can be life threatening. Causative microorganisms can not be isolated in the most of sepsis suspected patients because of the low sensitivity of blood culture. Therefore, it leads to problems in the diagnosis and treatment of disease.The aim of this study is to evaluate the diagnostic performance and the possible effects over treatment of multiplex real time PCR(LightCycler SeptiFast) analysis which is suggested to be faster and more sensitive results incomparison to blood culture systems.A total of 78 sepsis attacks from 67 patients with nosocomial sepsis and a control group of 22 adults without any signs of fever and sepsis were included in this study. Of 24 sepsis patients were female (36%) and 43 patients were male (64%) and the median patient age was 55.7 (21-95) years.The rates of detecting microorganism in sepsis attacks by blood culture and PCR analysis were 32% and 44.9% respectively.Total of 65 strains were isolated by both methods during 78 sepsis attacks. 19 of these strains were isolated by both blood culture and PCR analysis at the same sepsis attack. 8 of 12 strains considered as causative and 4 as contaminant, were isolated by blood culture, but not by PCR method. PCR analysis detected a total of 34 microorganisms, one of them was considered as contamination, which can not be isolated from blood culture.There was moderate concordance between two methods? results during sepsis attacks statistically (kappa value: 0,445, p<0,001). According to vdetected types of microorganisms, there was not sufficient concordance between the blood culture and PCR analysis (kappa value: 0,160, p=0,07).Retrospective evaluation of all 78 sepsis attacks showed that in 10 (%12,8) of them, modification in treatment could be done.As results of our data, it can be considered that SeptiFast method can be useful in addition to blood culture system in intensive care units where sepsis is often diagnosed and in the departments where antibiotics are used widespreadly.
Benzer Tezler
- Sepsis tanısında multipleks `real-time' polimeraz zincir reaksiyonu testi ve prokalsitoninin yeri
Evaluation of multiplex real-time polymerase chain reaction test and procalcitonin in diagnosis of sepsis
ASLINUR ÖZKAYA PARLAKAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıHacettepe ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ BÜLENT CENGİZ
- Deneysel sepsis modellerinde gerçek zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile etkenlerin saptanması
Using real-time Polymerase Chain Reaction (PCR) for detection of agents in the eprimental sepsis models
ALİ A. FOUAD
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE KALKANCI
- Sepsis tanısında yeni moleküler yöntemlerin kullanılması
Examination of new molecular methods in sepsis diagnosis
BURCU YERTUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
MikrobiyolojiGaziantep ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN ZER
- Akut miyokard infarktüsünde intravenöz heparin tedavisi ile alınan sonuçlar (karşılaştırmalı bir çalışma)
Başlık çevirisi yok
MEHMET ALİ ÇOBANOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Kardiyolojiİstanbul Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. REMZİ ÖZCAN