Outer membrane protein profiling of escherichia coli O157:H7 in response to phenolic acid stress
Escherichia coli O157:H7?nin fenolik asit stresinde dış membran protein profilinin çıkarılması
- Tez No: 320708
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. FERDA SOYER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Moleküler Tıp, Genetics, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Escherichia coli O157:H7, gıda ve su kaynaklı olarak bulaşan, Gram-negatif, patojen bir bakteridir. E. coli O157:H7'nin düşük dozları, hemorajik kolitis, trombotik trombositopenik purpura ve hemorajik üremic sendromu gibi klinik durumlara yol açabilen enfeksiyonlar için yeterlidir. Bu hastalıklar, çocuklar, yaşlılar ve bağışıklık sistemi baskılanmış olan kişiler için ölümcül olabilir.Fenolik asitler, bitkilerde, çevresel streslere cevap olarak üretilen sekonder metabolitlerdir. İnsan beslenmesinde, sağlığa yararlı özelliklerinden dolayı önemlidirler.Bu çalışmanın amacı, seçilmiş olan fenolik asitlerin E. coli O157:H7 üzerine etki mekanizmalarını belirlemektir. Kafeik, rosmarinik ve vanilik asidin E. coli O157:H7 üzerine antimikrobiyal aktiviteleri, microtiter plate yöntemi ile belirlenmiştir. Her bir madde, çeşitli konsantrayonlarda hazırlanıp bakteriye uygulanmıştır ve minimum inhibisyon konsantrasyonları, kafeik asit için 6.5 mM, rosmarinik asit için 15 mM ve vanilik asit için 8 mM olarak bulunmuştur. Her bir fenolik asitin E. coli O157:H7 hücre yüzeyine etkisi, taramalı elektron mikroskopu ile görüntülenmiştir. Mikroskopik inceleme, kontrol grubu E. coli O157:H7 hücre yüzeyinin düzgün bir yapıda olduğunu gösterirken, fenolik asit ile muamele edilen hücre yüzeylerinde çeşitli bozulmalar olduğunu göstermiştir. %30-50 inhibisyon gösteren fenolik asit konsantrasyonları, fenolik asit stresine cevap olarak dış zar protein profillerinin değerlendirilmesi için bakteriye uygulanmıştır. Dış zar proteinlerinin izolasyonundan sonra, SDS-PAGE ve 2D-PAGE analizleri gerçekleştirilmiştir. Fenolik asit ile muamele edilen bakterilerin dış zar proteinlerinin profilleri incelenmesi sonucunda ekspresyon farklılıkları gözlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Escherichia coli O157:H7 is a Gram-negative foodborne and waterborne pathogenic bacterium. Low doses of E. coli O157:H7 are adequate for infection that results in clinical cases, namely hemorrhagic colitis, thrombotic thrombocytopenic purpura, and hemolytic uremic syndrome. These diseases can be lethal for children, elderly and immunocompromised people.Phenolic acids are herbal secondary metabolites. They are important for the response to environmental stresses. They are significant for human diet due to their health beneficial properties.The objective of this study was the elucidate the antimicrobial mode of action of selected phenolic acids against E. coli O157:H7. The antimicrobial activities of caffeic, rosmarinic, and vanillic acids on E. coli O157:H7 were investigated via microtiter plate assay. Minimum inhibitory concentrations were found as 6.5 mM for caffeic acid, 15 mM for rosmarinic acid and 8 mM for vanillic acid by applying a range of concentrations for each phenolic acid against the bacteria. Effect of each phenolic acid on the cell surface of E. coli O157:H7 was visualized by scanning electron microscopy. Microscopic examination demonstrated that while the surfaces of control group E. coli O157:H7 remained intact, cells treated with phenolic acids displayed disrupted cell surfaces. The bacteria were treated with each phenolic acid at a concentration which resulted in 30-50% inhibition for evaluation of outer membrane protein (OMP) profiles in response to phenolic acids stress. Following OMP isolation, SDS-PAGE and 2D-PAGE analyses were performed. By examining the OMP profiles of phenolic acid treated-bacteria, differences in expression of some proteins were observed.
Benzer Tezler
- Irak'ın Thi-Qar eyaletindeki hastalardan izole edilen escherichia coli'de shigatoxin geninin moleküler tespiti
Molecular detection of shigatoxin gene in escherichia coliisolated from patients in Thi-Qar province, Iraq
TALAL HASAN JABER ALFKAWI
Doktora
Türkçe
2024
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEÇİL AKILLI ŞİMŞEK
- Çevresel su kaynaklarında farklı Escherichia coli patotiplerinin pan-genomik çeşitliliğinin araştırılması
Investigation of pan-genomic diversity of different Escherichia coli pathotypes in environmental water sources
ZÜMRA YENCE
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ELİF BOZÇAL DAĞDEVİREN
- Plant-mediated green synthesis and antibacterial efficacy of silver nanoparticles: A comparative study of cinnamon, hibiscus, and green tea
Bitki özütleriyle gümüş nanopartiküllerin yeşil sentezi ve antibakteriyel etkinliği: Tarçın, hibiskus ve yeşil çay üzerine karşılaştırmalı bir çalışma
EKİN DEREN GÜRTEKİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DR. ÖĞR. ÜYESİ ABDULHALİM KILIÇ
- Protein profiling of human gastric organoid model infected with outer membrane inflammatory protein A (OİPA) on and ΔOIPA helicobacter pylori strains
Dış zar inflamatuar protein A (OIPA) on ve ΔOIPA helicobacter pylori suşları ile enfekte olmuş insan mide organoid modelinin protein profillerinin belirlenmesi
SÜMEYYE AKÇELİK DEVECİ
Doktora
İngilizce
2023
BiyoteknolojiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar ÜniversitesiMedikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SİNEM ÖKTEM OKULLU
- Endemik brucella abortus suşlarının karşılaştırmalı biyoinformatik analizi
Comparative bioinformatic analysis of endemic brucella abortus strains
ALİ ARSLAN
Doktora
Türkçe
2026
BiyolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TÜLİN ÖZBEK