Geri Dön

Streptomyces coelicolor'da olası poli-ß-hidroksibutirat sentaz geni (phaC) ve antibiyotik biyosentezi arasındaki ilişki

Relation between putative poly-ß- hdroxybutyrate synthase gene (phaC) and antibiotic biosynthesis in streptomyces coelicolor

  1. Tez No: 315075
  2. Yazar: ZEYNEP DEMİR
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. SEDEF TUNCA GEDİK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biyoloji, Biotechnology, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Poli-beta-hidroksibütirik asit, Streptomyces, Streptomyces Coelicolor, Poly-beta-hydroxybutyric acid, Streptomyces, Streptomyces Coelicolor
  7. Yıl: 2012
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Poli-ß-hidroksibutirik asit (PHB) bakteri hücrelerinde granüller halinde depolanan, geri dönüşümlü, suda çözünmeyen, toksik etki göstermeyen, biyouyumlu ve termoplastik özellik gösteren bir polyesterdir. Endüstriyel önemi dışında PHB, hücre içinde önemli bir karbon ve enerji kaynağı olarak da görev yapar. Hücre zarlarına yapısal destek veren PHB, aynı zamanda sinyal iletiminde de önemli roller oynar.Literatürde, PHB'nin antibiyotik üretiminde karbon kaynağı olarak görev yapabileceğini öne süren çalışmalar bulunmaktadır. Bugüne kadar bilgimiz dahilinde PHB üretemeyen mutant suşlarda antibiyotik ölçümü gerçekleştirilmediğinden, bu polimerin antibiyotik biyosentezi için sağladığı düşünülen karbonun önemli olup olmadığı bilinmemektedir. Bu konuya açıklık getirilmesi amacıyla, bu çalışmada, S. coelicolor'ın PHB sentezinden sorumlu PHA sentaz enzimini kodladığı düşünülen olası phaC geni `PCR temelli' bir metod kullanılarak kromozomdan silinmiş ve PHB üretemeyen mutant suşta antibiyotik üretimi (aktinorhodin, undesilprodigiosin) ölçülmüştür. Çalışmadan elde edilen sonuçlar, PHB'den sağlanan karbonun antibiyotik üretimi için oldukça önemli olduğunu göstermiştir.

Özet (Çeviri)

Poly-ß-hydroxybutyrate (PHB), which is stored as granules inside bacterial cells, is a biodegradable, water insoluble, non-toxic, biocompatible and termoplastic polyester. Other than industrial importance, PHB has an important role as carbon and energy source inside the cell. PHB not only support cell membrane structures but also has important roles in signal transduction.In the literature, there are studies showing that PHB can function as carbon source for the production of antibiotics. According to our information no antibiotic measurement is carried out in PHB deficient mutant strains, so it is not known how important is the carbon source supplied from PHB for antibiotic biosynthesis. In order to clarify this point, a `PCR-based? method was used to delete the putative phaC gene, encoding PHA synthase responsible for PHB biosynthesis, of Streptomyces coelicolor and antibiotic production by the mutant strain deficient in PHB production was measured. The results of this study show that carbon source supplied from PBH is rather important for antibiotic production.

Benzer Tezler

  1. Streptomyces coelicolor A3(2)'de Lon proteazın ikincil metabolit üretimine etkisi

    Effect of Lon protease on secondary metabolite production in streptomyces coelicolor A3(2)

    ZEYNEP DEMİR ÖKSÜZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyoteknolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK

  2. Lon proteaz geninin çoklu kopyalarının streptomyces coelıcolor A3(2)'de homolog ifadesi ve Esherichia coli 'de heterolog ifadesi üzerine çalışmalar

    Studies on expression of multiple copies of lon protease gene homologously in streptomyces coelicolor A3(2) and heterologously in Esherichia coli

    HALİL YILMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyoteknolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TUĞRUL DORUK

  3. Studies on testing polyphosphate deficient Streptomyces coelicolor as a host for homolog and heterologous expression of valuable products

    Polifosfat yoksunu Streptomyces coelicolorun değerli ürünlerin homolog ve heterolog ifadeleri için konak olarak test edilmesi çalışmaları

    BUSE ÇINAR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    MikrobiyolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK

  4. Streptomyces coelicolor'da lon proteaz, sınırlandırılmış cevap, polifosfat metabolizması ve antibiyotik üretiminin ilişkilendirilmesi

    Relation between lon protease, stringent response, polyphosphate metabolism and antibiotic production in Streptomyces coelicolor

    ASLI BAYRAKTAR KAVALCI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEDEF TUNCA GEDİK

  5. Polifosfat kinaz (PPK) yoksunluğunun Streptomyces coelicolor'da antibiyotik biyosentezine etkisi

    The effect of polyphosphate kinase deficiency on antibiotic production in Streptomyces coelicolor

    İREM YALIM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    BiyolojiGebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SEDEF TUNCA GEDİK