Growth physiology and metabolic remodelling of Saccharomyces cerevisiae under oxidative stress conditions
Saccharomyces cerevisiae'nın oksidatif stres koşulları altında büyüme fizyolojisi ve metabolizmasının yeniden modellenmesi
- Tez No: 310450
- Danışmanlar: DOÇ. DR. CHRİSTOPHER WORKMAN, DOÇ. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Biyokimya, Mikrobiyoloji, Biyoteknoloji, Bioengineering, Biochemistry, Microbiology, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Hidrojen peroksit, Oksidatif stres, Protein kinazlar, Hydrogen peroxide, Oxidative stress, Protein kinases
- Yıl: 2011
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu projede, Saccharomyces cerevisiae'nin protein kinaz/fosfataz geni silinmiş (knock-out) mutantlarında yükseltgen ortamın hücre büyümesine etkisini açıklamak amaçlanmış, ayrıca hücre içi sinyal aktarımında ve çeşitli gen ekspresyon yolizlerinde büyük etkisi olan protein kinaz/fosfataz yolizleri hakkında yükseltgen ajan H2O2'nin etkileri araştırılmıştır. Bunun için S. cerevisiae'nin 2 yaban tipi ve 38 farklı protein kinaz/fosfataz geni silinmiş (knock-out) mutanları incelenmiştir. Bu 38 protein kinaz/fosfataz mutantları, oksidatif stres tepkisinin iletilmesinde en muhtemel adaylar olup hem genel/oksidatif stres tepkileri hem de DNA hasar tepkileri üzerine bilinen aktiviteleri üzerinden seçilmiştir.Büyüme fizyolojisi üzerine elde edilen sonuçların en önemlileri: protein kinaz/fosfatazların dengeleyici mekanizması, OCA1 geninin oksidatif stres tepkilerindeki merkezi etkinliği, DNA hasarı ve hücre döngüsü durması, ayrıca yavaş büyüyen ve geni silinmiş bud32?, vps15?, ptc1? ve oca1? (knock-out) mutantlarının gözlemlenmesi olarak sıralanabilir.BioLector mikrofermentasyon platformu, farklı H2O2 koşullarında S. cerevisiae'nin diauksik fazının kesin zaman aralığını tespit etmeye olanak vermiştir. S. cerevisiae'nin diauksik faz öncesi, süreci ve sonrasında örneklenen önemli karbon metabolizması metabolitleri HPLC ile saptanmıştır. Karbon tüketiminin metabolik gecikmesi, hücrelerin ortamda artan H2O2 stres koşulu ile metabolik aktivitesini düşürdüğünü göstermekle birlikte, ağır stres derişimleri hücrelerin metabolik kısılmaya girmesine neden olmuştur.
Özet (Çeviri)
The objective of the project was to reveal the growth effects of oxidizing environment on protein kinase/phosphatase knock-out (KO) mutants of Saccharomyces cerevisiae. Hence, this study would enhance to investigate the contrast effects of H2O2 as kinase/phosphatase pathways in the cells that have a big impact on signal transduction and various expression pathways. Two wild type strains of S. cerevisiae and 38 different protein kinase/phosphatase KO mutants are investigated for oxidative stress responses. These 38 protein kinase/phosphatase mutants are selected to their known activities on both general/oxidative stress response and DNA damage response as these mutants are the possible candidates for the specific aim of this project.There are many important findings on growth physiology, but the most important ones can be said that the compensatory mechanism of protein kinase/phosphatase, the central activity of OCA1 gene among responses of oxidative stress, DNA damage and cell cycle arrest, and also the investigation of slow grower KO mutants: bud32?, vps15?, ptc1? and oca1?.BioLector microfermentation platform allowed us to detect the exact time interval of diauxic phases of S. cerevisiae upon different H2O2 stress conditions. The important metabolites of carbon metabolism which were sampled before, during and after diauxic phase of S. cerevisiae were detected by HPLC. The metabolic delay of carbon utilization proved that the cells decrease the metabolic activity with increasing H2O2 stress conditions in the environment. Moreover, the harsh stress concentrations make the cells undergo a metabolic turn-down.
Benzer Tezler
- Deneysel tip I diyabette aralıklı hipoksinin sol ventrikül fonksiyonları üzerine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effects of intermittent hypoxia on left ventricle functions in experimental TYPE I diabetes
FIRAT AKAT
- Glioblastoma hücrelerinde mTORC1/2'nin dual hedeflenmesinin globalmetilasyon ve histon modifikasyonları üzerinde yarattığı değişikliklerin incelenmesi
Başlık çevirisi yok
BİLGESU AK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
GenetikEge ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALUK AKIN
PROF. DR. ASUDE DURMAZ
- Siprofloksasin'in tümör dokusunda matriks metalloproteinaz ekspresyonu ile anjiyogenez belirteçler ve inflamatuar süreç üzerine etkilerinin değerlendirilmesi
Assessment of ciprofloxacin effects on matrix metalloproteinase expression with angiogenesis indicator and inflammation process in cancer tissue
ELİF TUĞBA OĞUZ TAYLAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
OnkolojiTrakya Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERNAZ UZUNOĞLU
- Investigation of growth physiology and metabolism of mutant yeasts obtained by metabolic engineering
Metabolizma mühendisliği kullanılarak elde edilen mutant mayaların büyüme fizyolojileri ve metabolizmalarının incelenmesi
ONUR ERCAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesiİleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Sağlıklı gebelerin serum ghrelin, leptin, lipid profili ve büyüme faktörleri ile yenidoğan doğum ağırlıkları arasındaki ilişki
Relation among serum ghrelin, leptin levels of the healthy pregnant women and the growth factors, lipid profile and neonatal birth weights
FİLİZ SAYLAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
Kadın Hastalıkları ve DoğumAfyon Kocatepe ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. GÜLENGÜL NADİRGİL KÖKEN