Screening of new drug candidates with antitumor assays
Anti tümör deneyleriyle yeni ilaç adaylarının taranması
- Tez No: 305852
- Danışmanlar: PROF. DR. BARKIN BERK, PROF. DR. IŞIL AKSAN KURNAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2012
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bölümü
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
İlaç geliştirme süreci, keşif ve araştırma, klinik öncesi çalışmalar, klinik çalışmalar ve onay olmak üzere dört ana fazdan oluşur. Keşif ve araştırma süreci boyunca ele alınan temel konulardan biri sentezlenmiş ya da taranmış bileşiklerin farmokolojik aktivitelerinin belirlenmesidir. Çalışmamız sırasında Yeditepe Üniversitesi Eczacılık Fakültesi tarafından sentezlenen, 4-(1,3-dioksiisoindolin-2-yl) benzensülfonomid ve 4-(4,5,6,7-tetrafloro-1,3-dioksiizoindolin-2-yl) benzensulfonamid kimyasal yapısındaki talidomid türevleri, 4-fenilpiperidin türevi olan sigma reseptör ligandları, 1-(naftalin-2-ylmetil) yapısındaki piperazin türevleri, SH-SY5Y insan nöroblastoma hücre hattı, HT29 insan kolon kanseri hücre hattı, MDA-MB-231 insan meme kanseri hücre hatları kullanılarak anti-tümor akitivitelerinin belirlenmesi için taranmıştır. Bileşiklerin sitotoksik etkileri sağlıklı fare fibroblast hücresi olan L929 hücre hattı üzerinde MTT deneyleri ile taranmıştır. Elde edilen sonuçlar bu üç gruptan bazı bileşiklerin klinik kullanımlar için uygun olarak nitelendirilebilecek önemli antitumor aktiviteye sahip olduğunu göstermiştir. Bu ilaç adaylarının etki mekanizmasını anlamak için, hücrelere uygulandıktan sonra hücrelerin DNAsındaki çeşitli genlerin ekspresyon seviyeleri incelenmiştir. Bu aşamada ön çalışma olarak p21, cyclinD-1, c-fos and elk-1 gibi belli başlı hücre döngüsü genlerinin PZR analizlerine odaklanılmıştır. Ancak moleküler mekanizmaların detaylı bir şekilde anlaşılabilmesi için daha kapsamlı moleküler analizler gerekmektedir. Bu aşamada ön çalışma olarak p21, cyclinD-1, c-fos and elk-1 gibi belli başlı hücre döngüsü genlerinin PZR analizlerine odaklanılmıştır. Ancak moleküler mekanizmaların detaylı bir şekilde anlaşılabilmesi için daha kapsamlı moleküler analizler gerekmektedir.
Özet (Çeviri)
Drug development process consists of discovery and research, preclinical studies, clinical trials and approval phases. During discovery and research process, one of the main issues is pharmacological activity determination of either synthesized, proposed or screened compounds. During our study, selected candidates having chemical structures that were 4-(1,3-dioxoisoindolin-2-yl) benzenesulfonamide and 4-(4,5,6,7-tetrafluoro-1,3-dioxoisoindolin-2-yl) benzenesulfonamide structured thalidomide derivatives, 4-phenylpiperidine derivatives for sigma receptor ligands, 1-(naphthalen-2-ylmethyl) piperazine derivatives synthesized in Yeditepe University, Faculty of Pharmacy were screened for their anti-tumor activity by using SH-SY5Y human neuroblastoma cell line, HT29 human colon cancer cell line, MDA-MB-231 human breast cancer cell line. As a healthy control, cytotoxic effects of compounds were assed using L929 mouse fibroblast cell line by MTT experiment. The results showed that some compounds belonging to all three of these groups have significant anti-tumor activity that may qualify them to be suitable candidates for clinical use. In order to understanding the mode of action of these putative drug candidates, examination of expression levels of different genes in cells? DNA after the exposure has been carried out; our preliminary work has at this stage concentrated on RT-PCR analysis of common cell cycle-related genes such as p21, cyclin D1, c-fos and elk-1. However, further detailed molecular analysis will be required to get an in-depth understanding of the molecular mechanisms.
Benzer Tezler
- Prediction of drug response in cancer using hybrid deep neural networks
Hibrit derin sinir ağları ile kanserde ilaç yanıt tahmini
BURAKCAN İZMİRLİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolHacettepe ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TUNCA DOĞAN
- Yapay öğrenme bazlı hesaplamalı modelleme ile geniş çaplı kanser hücre hattı ilaç yanıt tahmini
Comprehensive cancer cell line drug response prediction by machine learning based computational modelling
UMUT ONUR ÖZCAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
GenetikHacettepe ÜniversitesiBiyoenformatik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TUNCA DOĞAN
- Sanal tarama ve çok boyutlu moleküler modelleme yöntemleri ile p53-MDM2 potansiyel inhibitörlerinin belirlenmesi
Identification of p53-MDM2 potential inhibitors with virtual screening and multidimensional molecular modeling methods
GÜLŞAH AYDIN
Doktora
Türkçe
2020
Biyofizikİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİNE YURTSEVER
PROF. DR. SERDAR DURDAĞI
- RAS proteinlerini hedefleyen ilaçların gelişimindeki güncel durumun incelenmesi ve sanal tarama ile yeni inhibitör adaylarının belirlenmesi
Investigation of the current status of drugs targeting RAS proteins and identification of new inhibitor candidates by virtual screening
BİLGEN SAYIM GÜLERLER
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Biyomühendislikİstanbul Medeniyet ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SALİHA ECE ACUNER ZORLUUYSAL
- Theileriosis'in tedavisinde kullanılabilecek yeni bir ilaç adayı tespit etmek için kumarin türevlerinin Theileria annulata enolazını inhibisyon potansiyelinin araştırılması
Investigation on Theileria annulata enolase inhibition potential of coumarin derivatives to identify new drug candidates to be used in the treatment of theileriosis
SİNEM YAKARSÖNMEZ
Doktora
Türkçe
2017
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK BALIK
DOÇ. DR. ÖZKAN DANIŞ