Sparıdae (Perciformes, actinopterygii) türlerinde mitokondriyal genom evrimi
Mitochondrial genome evolution in sparidae (Perciformes, actinopterygii) species
- Tez No: 299268
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. MEHMET BAKİ YOKEŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Deniz Bilimleri, Biology, Genetics, Marine Science
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Haliç Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Populasyon çalışmaları ve filogenetik analizler, türler içindeki ve türler arasındaki bağlantıları ortaya koymanın yanı sıra bireylerin kendi aralarındaki ve çevre ile etkileşimlerini de açıklamaya yarar. Farklı coğrafi ve iklimsel koşullara uyum sağlamaya çalışan türlerin gen havuzlarında olan değişimler evrimin temel mekanizmasını oluşturur. Bireylerin genetik yapısındaki değişime sebep olan mutasyonlar, bu mekanizmanın temel direğidir.Tür içinde ve türler arasındaki evrimsel ilişkileri açıklamak için belirli genler kullanılırlar. Bu genler sahip oldukları korunmuşluk derecesi veya hızlı değişim özellikleri ile populasyon çalışmalarının özelleşmesini sağlarlar. Mitokondrinin büyük çoğunlukla anasal kalıtım göstermesi, genomunun küçük olması, mutasyon hızının yüksek olması, aşırı değişken bölgelerdeki kodlayıcı veya düzenleyici bölgelerin eksikliği ve rekombinasyona uğramaması mitokondriyal genlerin markör olarak tercih edilme sebeplerindendir. Evrimsel olarak korunmuş 16S rRNA ve COI genleri türler arası filogenetik analizler ve tür-spesifik çalışmalar için uygundur.Bu çalışmada, Akdeniz'de yaşayan Sparidae (Perciformes, Actinopterygii) türlerinde tür içi ve türler arası evrimsel ilişkileri açıklamak için mitokondriyal 16S rRNA ve COI genleri MrBayes ve PAUP platformlarında incelenmiştir. Spicara cinsi kök atanarak çizilen soy ağaçları Diplodus cinsinin monofiletik olduğunu ve Oblada melanura türünün Diplodus cinsine dahil edilmesi gerektiğini, Dentex ve Pagellus cinslerinin parafiletik kökenlere sahip olduğunu göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Population studies and phylogenetic analyses exhibit interspecific and intraspecific relations while explaining inter individuals and environmental interactions.The changes in the gene pool of the species which endeavour the adaptation to the different geographical and climatological conditions constitute the fundamental mechanism of evolution. The mutations which cause the changes in the genetic structure of individuals are essential for this mechanism.Certain genes are used to describe interspecific and intraspecific evolutionary relations. These genes provide the specificity of population studies with their conservation degree or rapid change properties. Since mitochondria are generally maternally inherited, have a rapid mutation rate and a small genome along with the lack of coding and noncoding sites in hypervariable regions and nonoccurrence of recombination, mitochondrial genes are preferred markers. Evolutionary conserved 16S rRNA and COI genes are suitable for intraspecific phylogenetic analyses and species specific studies.In this study, mitochondrial 16S rRNA and COI genes have been investigated on MrBayes and PAUP platforms in order to explain interspesific and intraspecific relations in Sparidae (Perciformes, Actinopterygii) members native to Mediterranean Sea. It has been shown that genus Dentex and Pagellus have paraphyletic origin while genus Diplodus has monophyletic origin and that Oblada melanura should be included in Diplodus genus, when genus Spicara are assigned as outgroup on the phylogenetic tree.
Benzer Tezler
- Türkiye kıyısal sularında dağılım gösteren Sparidae familyasına ait taksonların mitokondriyal DNA dizilerine dayalı genetik analizi
Genetic analysis of the taxa belonging to the family Sparidae (Pisces: Perciformes) distributed in Turkish coastal waters based on mitochondrial DNA sequences
İSMAİL AKSU
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YUSUF BEKTAŞ
- Sparidae familyasına ait balıklarda yetiştiricilik koşularında gözlenen kemik ve kıkırdak deformasyonlarının belirlenmesi
Determination of bone and cartilage deformation in culture condition in sparidae
DENİZ ÇOBAN
Doktora
Türkçe
2005
Su ÜrünleriEge ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ŞAHİN SAKA
- Çanakkale Boğazı'ndaki bazı genç Sparidae türlerinde beslenme alışkanlıkları
Feeding habits of some young of the year Sparidae species in Dardanelles
AYTAÇ ALTIN
Doktora
Türkçe
2011
Su ÜrünleriÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiSu Ürünleri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ADNAN AYAZ
- Ağ kafeslerde alternatif sparıdae türlerinin; sinagrit (Dentex dentex L., 1758), sivriburun karagöz (Diplodus puntazzo cetti, 1777), kırma mercan (Pagellus erythrinus L., 1758), mırmır (Lithognathus mormyrus L., 1758), çipuraya (sparus aurata L., 1758) göre gelişim parametrelerinin karşılaştırılması
Comparison of growth performance; alternative sparidae species common dentex (Dentex dentex L., 1758), sharpsnout seabream (Diplodus puntazzo cetti, 1777), common pandora (Pagellus erythrinus L., 1758), striped seabream (Lithognathus mormyrus L.,1758) with gilthead seabream (sparus aurata L.,1758) in net cages
SAİT CENK SERT
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
Su ÜrünleriEge ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Bölümü
YRD. DOÇ. DR. ALİ YILDIRIM KORKUT
- Ege Denizi'ndeki Sparidae familyasına ait bazı türlerin DNA profillerinin çıkarılması
DNA profile determination of the some Sparidae genus inhabiting in the Aegean Sea
BAHADIR KANDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Balıkçılık TeknolojisiEge ÜniversitesiAvlama ve İşleme Teknolojisi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CAN ALTINELATAMAN