Geri Dön

Investigation of collagen type II mechanical and structural properties with the atomic force microscope

Tip II kollojenin yapısal ve nanomekaniksel özelliklerinin atomik kuvvet mikroskobu ile incelenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 290292
  2. Yazar: SWABİR SİLAYİ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. KURTULUŞ GÖLCÜK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyofizik, Biophysics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Fatih Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Artiküler katilajı oluşturan kollajenler, ağlar ve matrisler, dokuya yapısal ve mekaniksel fonksiyon sağlarlar. Gerinime ve eklemler arasındaki sıvı basıncına karşı dayanıklıdırlar. Kollajen molekülünün biyomekaniksel ve yapısal özelliklerinin bilinmesi; kollojenlerin oluşumu, hücre dışı matrislerle hücrelerin etkileşimi ve doku dejenerasyonun özünün anlaşılması için önemlidir.Bu çalışmada, Kollajen Tip II proteinin mekaniksel ve yapısal özellikleri Atomik Kuvvet Mikroskobu (AFM) kullanılarak incelenmiştir. Bovin kartilajından izole edilen Kollajenler oda sıcaklığında farklı pH değerlerde farklı zaman aralıklarında inkübe edilerek etkileri AFM ile incelenmiştir. Ayrıca, tek molekül kuvvet spektroskopisi (SMFS) ile kollajenin mekanik özellikleri incelenmiştir.Farklı pH (4, 6, 8 ve 10) değerlerinde kollajenin yapısal değişikliklere maruz kaldığı görülmüştür. Düşük pH değerlerde (pH 4) kollajen mollekülleri bir araya gelerek granül yapılarda oldukları gözlenmiştir. Yüksek pH değerlerinde fibril yapılarda oldukları gözlenmiştir. Uzun süreli inkübasyonda fibril oluşumlarının arttığı gözlenmiştir. SMFS ölçümleri WLC modeliyle örtüştürülerek, kontur uzunluğunu 209 nm ve persistans uzunluğu 11.72 nm olarak ölçülmüştür.

Özet (Çeviri)

Collagens and the networks and matrices they form in the articular cartilage function to provide structural and mechanical support to connective tissue. They resist the tension and also augment the pore fluid pressures within the joints. Knowledge of the biomechanical and structural properties of the collagen molecules is essential in understanding the self assembly of the collagens, the interactions of cells with the extracellular matrices and the relationship between the structures and the biomechanical functions and properties of tissues in addition to discerning the origin and effects of tissue degeneration.In this study, we used the AFM to examine the mechanical and structural properties of the Collagen Type II protein. The collagens were extracted from bovine cartilage and incubated at room temperature, 23oC, for different periods at different pH values and the effects of these observed from the AFM images. Additionally, single molecule force spectroscopy (SMFS) was done to determine some mechanical properties of the collagen.The AFM images taken of the collagens at different pH (4, 6, 8 and 10) showed consistency with observations that had been made earlier in literature. Basically, thestructure of the collagens changed depending on the pH, with aggregated granules presenting at lower pH 4 and the fibrils becoming more distinct and isolated as the pH increased. Increasing incubation time served to emphasize the fibril formation. The force curves obtained from the SMFS measurements were fitted using the WLC model to give us values of approximately 209nm contour length and 11.72nm persistence length, both comparable to values observed in literature.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    470925

    Farklı yöntemlerle kaplanmış süperhidrofobik ve süperoleofobik CP-Ti malzemenin elektrokimyasal,optik, in vitro ve in vivo özelliklerinin araştırılması

    Investigation of the electrochemical, optical, in vitro and in vivo properties of superhydrophobic and superoleophobic CP-Ti material coated with different methods

    MEVRA ASLAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Makine MühendisliğiAtatürk Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYHAN ÇELİK

    YRD. DOÇ. DR. TUBA YETİM

  2. Tez No

    307979

    Diabetik ve diabetik olmayan lomber disk hernili olgularda kollajen tip ıx düzeylerinin karşılaştırılması

    Comparison of the type ix collagen levels in the cases with diabetic and non-diabetic lomber disc herniation

    LUTFÜ ARICI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    NöroşirürjiFırat Üniversitesi

    Beyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. METİN KAPLAN

  3. Tez No

    439623

    Investigation of the effects of chrome-tanned leather additives in natural rubber and styrene-butadiene rubber

    Kromla tabaklanmış deri katkısının doğal kauçuk ve stiren-bütadien kauçuğuna etkisinin incelenmesi

    SEMİH ŞAŞMAZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Polimer Bilim ve Teknolojisiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Polimer Bilim ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURSELİ UYANIK

  4. Tez No

    213810

    Elektrodöndürme tekniğiyle oluşturulan polimer nano-liflerin memeli hücresi etkileşimlerinin incelenmesi

    Investigation of the interaction of mammalian cells with polymer nanofibers formed by the electrospinning technique

    YAVUZ EMRE ARSLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyokimyaAnkara Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. Y. MURAT ELÇİN

  5. Tez No

    321430

    Kalvaryal defektlerin onarımında jelatin/hidroksiapatit esaslı kriyojel doku iskelelerinin etkisi

    Effect of gelatin/hydroxyapatite based cryogel scaffolds for calvarial defect repair

    İLYAS İNCİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyomühendislikHacettepe Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İBRAHİM VARGEL

    PROF. DR. ERHAN BİŞKİN

Geri Dön