Zeka geriliğine neden olan delesyon ve duplikasyonların tam genom mikroarray metoduyla belirlenmesi
Detection of deletions and duplications that cause mental retardation by whole genome microarray method
- Tez No: 288984
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. NACİ ÇİNE, DOÇ. DR. BÜLENT KARA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Moleküler Tıp, Genetics, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Mental retardasyon, delesyon, duplikasyon, mikroarray, CGH array, FISH, Genom, Kromozom düzensizlikleri, Kromozomlar, Mikrodizilim analizi, Zeka geriliği, Mental Retardation, deletion, duplication, microarray, CGH array, FISH, Genome, Chromosome aberrations, Chromosomes, Microarray analysis
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kocaeli Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Zeka geriliği (Mental retardasyon) en sık görülen gelişimsel bozukluklardan biridir. Mental retardasyonun prevalansı yaklaşık %1-3 olarak kabul edilmektedir. Mental retardasyonun, doğumsal travmalar ve enfeksiyonlar gibi çevresel nedenleri ile 1000'den fazla bilinen genetik nedeni bulunmaktadır. Bunun yanı sıra, mental retarde bireylerin büyük çoğunluğunda spesifik bir neden tanımlanamamaktadır.Bu çalışmada, mental retarde bireylerde tüm genom taranarak kromozom hasarlarını saptamak amaçlanmıştır.Çalışmamızda cinsiyet farkı gözetmeksizin, 0-18 yaş arası 52 mental retarde bireyden alınan periferik kan örnekleri DNA düzeyinde array-CGH yöntemiyle incelenerek, genetik hasarların en çok hangi moleküler bölgelerde yer aldığı taranmıştır. aCGH çalışmaları sonucunda; 38 (% 73) hastada genomun çeşitli bölgelerinde çeşitli boyutlarda aberasyonlar saptanmıştır. 14 (% 27) hastada ise herhangi bir aberasyona rastlanmamıştır. Non-sendromik mental retarde hastaların 7'sinde (% 70), mental retardasyona eşlik eden dismorfik bulguları olan hastaların 22'sinde (% 78.6), mental retardasyona eşlik eden epilepsi hastalarının 7'sinde (% 87.5) ve mental retardasyona eşlik eden epilepsili ve dismorfizmli hastaların 2'sinde (% 33.3) genomun çeşitli yerlerinde farklı boyutlarda aberasyonlara rastlanmıştır. En sık görülen aberasyon hemen hemen her hastada farklı boyutlar sergileyen 16p11.2 bölgesindeki delesyon olmuştur (toplam 52 hasta arasından 15 kişide görülmüştür).Tam genom analizi üzerinde gerçekleştirilen bu çalışma ile mental retardasyon açısından yeni tanısal-genetik ve patognomonik belirteçler elde edilebilir. Verilerin verifikasyonu ve aynı bölgelere ait gen anlatım ve proteomiks çalışmaları, mantal retardasyonun patogenez mekanizması açısından önemli ipuçları sağlayabilir.
Özet (Çeviri)
Mental retardation is one of the most common developmental disorder. Prevelance of mental retardation is accepted as %1-3 percent of population. There are environmental factors like birth trauma and infections and over 1000 genetic causes for mental retardation. Besides this, in the majority of mentally retarded individuals a specific cause can not be identified.Aim of this study was to determine chromosomal aberrations in patients with mental retardation by scanning whole genom.In our study, regardless of the gender gap peripheral blood samples were taken from 52 individuals between the ages of 0-18 with mental retardation and the molecular regions of most genetic damages were detected on DNA level using array-CGH method. In aCGH studies, aberrations with various sizes were detected in various regions of the genome on 38 (73%) patients. No aberrations were found in 14 (27%) patients. Aberrations with different sizes were found in different parts of the genome on 7 (70%) of non-syndromic mental retardation patients, 22 (78.6%) of patients with mental retardation associated with dysmorphic findings, 7 (87.5%) of patients with mental retardation accompanied by epilepsy and 2 (33.3%) of patients with mental retardation associated with epilepsy and dismorphism. The most frequent aberration seen in almost all patients (were seen totally in 15 people through 52 patients) was deletion of 16p11.2 with different sizes.By this study performed on whole genome analysis, new diagnostic-genetic and pathognomonic markers can be obtained in terms of mental retardation. Verification of data belonging to the same regions by gene expression and proteomics studies may provide important clues for mental retardation mechanism.
Benzer Tezler
- Array CGH (karşılaştırmalı genom hibridizasyonu) tekniğinin mental retardasyonlu olguların rutin tanısındaki yeri ve önemi
The role and importance of array CGH (comperative genomic hybridization) technique in mental retardation cases
BETÜL IŞIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
GenetikÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZTÜRK ÖZDEMİR
- Nedeni açiklanmamiş mental retardasyonu olan hastalarda moleküler karyotipleme yöntemi ile submikroskopik kromozomal anomalilerin araştirilmasi
Investigation of submicroscopic chromosomal anomalies on patients with idiopathic mental retardation with molecular karyotyping
BÜŞRANUR ÇAVDARLI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
GenetikGazi ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. E. FERDA PERÇİN
- Nedeni bilinmeyen mental retardasyonda subtelomerik mikrodelesyon varlığının fluoresans in situ hibridizasyon yöntemi ile araştırılması
The investigation of presence of subtelomeric microdeletion in unknown mental retardation using by fluorescence in situ hybridization technique.
BURCU TAHTAKAYA
- Genel ve palyatif çocuk yoğun bakım ünitelerinde yatan spinal musküler atrofi tanılı hastaların değerlendirilmesi
The evaluation of patients diagnosed with spinal muscular atrophy in the general and palliative intensive care unit
HADİ KIZMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıDicle ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FESİH AKTAR
- In vitro generation and characterization of the Wu syndrome model that causes mental retardation in neural cell lines
Nöral hücre hatlarında zeka geriliğine neden olan Wu sendromu modelinin in vitro oluşturulması ve karakterizasyonu
SÜMEYYE SEHER KARAMAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
GenetikÜsküdar ÜniversitesiMoleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CİHAN TAŞTAN