İzmir ve Aydın illerindeki bazı kaplıcalardan izole edilen termofilik bakteri izolatlarının moleküler taksonomisi ve D1021 izolatının glukoz izomerazının karakterizasyonu
Molecular taxonomy of thermophilic bacteria isolated from hot springs in the provinces of Aydin and Izmir, and characterization of glucose isomerase of the isolate D1021
- Tez No: 287449
- Danışmanlar: PROF. DR. ALİ OSMAN BELDÜZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Thermus, Thermus
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Termofilik ortamlar, endüstriyel öneme sahip çeşitli enzimleri üreten termofilik organizmaları barındıran zengin kaynaklardır. Bu çalışmada, Karakoç Kaplıcası, Kaynarca Kaplıcası, Nebiler Kaplıcası, Alangüllü Kaplıcası, Çamköy Çamur Ilıcası ve Aydın Germencik Ömerbeyli Jeotermal sahasından su ve çamurlu su örneklerinden termofilik bakteri izolasyonları gerçekleştirildi. Geobacillus (12 izolat), Anoxybacillus (18 izolat), Brevibacillus (9 izolat), Thermus (5 izolat), Aneurinibacillus (4 izolat) ve Pseudoxanthomonas (1 izolat), Schlegelella (1 izolat) ve Chelatococcus (1 izolat) cinslerine ait izolatların tür seviyesinde sistematikleri yapılmaya çalışıldı. İzmir Kaynarca kaplıcasından izole edilen D1021 izolatın, Anoxybacillus cinsine ait yeni bir tür olduğu belirlendi ve A. kaynarcensis D1021T olarak adlandırıldı. Ayrıca yapılan genotipik analizler sonucunda, yeni tür olma potansiyeline sahip yeni Brevibacillus spp. ve Geobacillus spp. elde edildi. Bu çalışmada ayrıca, A. kaynarcensis D1021T glukoz izomeraz geninin tüm baz dizilimi belirlendi ve pET28a(+) ekspresyon vektörüne klonlandı, üretilip kolon kromatografisi yöntemiyle saflaştırıldı. A. kaynarcensis D1021T GI'sı optimum 80 °C'de ve pH 7,0'de çalışan termofilik bir enzimdir. Enzimin Km'si 101,75 mM Vmax'ı ise 14,06 ?mol/dk/mg protein olarak bulundu.
Özet (Çeviri)
Thermophilic environments are rich resources for thermophilic organisms which synthesize a variety of enzymes that have important industrial applications. Thermophilic bacteria isolations from Hisarkoy Hot Spring (Balikesir), Dikili-Bergama Kaynarca Hot Spring (İzmir), Camkoy Camur Hot Spring (Aydin) and Hidirlar Hot Spring (Çanakkale) were made. Systematics of these isolates belonging to Geobacillus (12 izolates), Anoxybacillus (18 izolates), Brevibacillus (9 isolates), Thermus (5 isolates), Aneurinibacillus (4 isolates) ve Pseudoxanthomonas (1 isolate), Schlegelella (1 isolate) ve Chelatococcus (1 isolate) genus were studied to be made at the species level in these study. D1021 isolates belonging to Anoxybacillus genus from İzmir Kaynarca hot spring was new species designated as A. kaynarcensis D1021T. Based on genetipic analyses, some isolates had potential of being new species belonging to Brevibacillus and Geobacillus genus. Gene coding for thermophilic glucose isomerase of A. gonensis G2T was isolated and its complete nucleotide sequence was determined. The gene has been cloned to plasmid vector pET-28a+ and overexpressed in E. coli BL21(DE3). The enzyme was purified by colon chromatography techniques. The purified GI showed optimal activity at 80°C in pH 7.0. Its Km and Vmax value wase 101,75 mM and 14,06 ?mol/dk/mg protein respectively.
Benzer Tezler
- İzmir ve Aydın yöresindeki topraklardan izole edilen Azotobacter chroococcum (Beijerinck, 1901) izolatlarının tuz, sıcaklık ve bazı ağır metallere toleranslarının belirlenmesi
Salt, temperature and some heavy metal tolerance determination of Azotobacter chroococcum (Beijerinck, 1901) isolated from the soils in İzmir and Aydın environs
NUR HİLAL ÖZCAN
- İzmir , Manisa ve Aydın yörelerindeki süt sığırcılığı işletmelerinde , sağıma ilişkin mekanizasyon düzeyinin saptanması
Başlık çevirisi yok
SELÇUK YİĞİT
- Ege bölgesinde seçilmiş bir yörede kuru incir üretim ve pazarlaması üzerine bir araştırma
A Research on the production and marketing of dried fig in a selected vicinity in Ege region
TAYFUN ÇUKUR
- Ege bölgesinin seçilmiş bazı illerinde (Aydın, İzmir, Manisa) tarım kesiminde vergi potansiyelinin belirlenmesi ve bu potansiyelin değerlendirilme olanakları üzerine bir araştırma
A Research on determining of tax potential in some selected provinces of Aegean region (Aydın, İzmir, Manisa) and evaluation of this potential possibilities in the agricultural sector
DJAVİD SHAKER NAGAD
- Aydın, Balıkesir ve İzmir illerinde zeytin ağaçlarındaki viral hastalık etmenlerinin tanılanması, bulunma durumlarının belirlenmesi ve bazı meyve kalite özellikleri üzerine olan etkilerinin araştırılması
The investigation on the detection of virus diseases in olive trees in Aydin, Balikesir and İzmir provinces, determination of their present status and effects on some fruit quality characteristics
SERPİL ERİLMEZ
