Türkiye florasında yetişen kuzu göbeği mantarlarının moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of Morchella spp. in the flora of Turkey
- Tez No: 287225
- Danışmanlar: PROF. DR. SAADET BÜYÜKALACA
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Türkiye florasında yetişen kuzu göbeği mantarı (Morchella spp.) türlerinin belirlenmesi ve bunların Dünya'nın farklı ülkelerinde yetişen türler ile karşılaştırılması amacıyla yapılan bu çalışmada, 2007-2010 yılları arasında Türkiye'nin farklı bölgelerinden toplanan 490 adet örnekten oluşan bir koleksiyon oluşturulmuştur. Bu koleksiyonun moleküler analizleri, Amerika Birleşik Devletleri Tarım Bakanlığı (USDA, Peoria-Illinois) Bakteriyel Kaynaklı Patojenler ve Mikoloji Bölümü laboratuarlarında yapılmıştır. Koleksiyon, protein kodlayan genler olan RNA polimeraz I (RPB1), RNA polimeraz II (RPB2), translasyon uzama faktörü (EF1-?) gen bölgeleri ve 28S (LSU) rDNA gen bölgesi ile bireysel ve kombine olarak tür çeşitliliğini belirlemek amacıyla analiz edilmiştir. Aynı zamanda Elata grubu (M. elata) içerisinde tür zenginliğinin fazla olduğu ve Elata alt grubu olarak dizayn edilen grupta transkripsiyonu yapılamayan bölge-ITS rDNA bölgesinin DNA dizi analizleri de sağlanmıştır. İsveç Müzesi'nden temin edilen 18 adet kuzu göbeği mantarının moleküler analizleri de bu çalışma kapsamında yapılmıştır. Türkiye türlerinin diğer ülke türleri ile karşılaştırılması için, Türkiye türlerinin DNA dizileri; İsveç türleri ve global bir sörvey çalışması ile belirlenen filogenetik olarak farklı türlerle (O'Donnell ve ark. 2011) birlikte değerlendirilmiştir. Gen bölgelerinin bireysel ve kombine datasetlerinin filogenetik analizleri, Türkiye'de 15 adet Elata (siyah) ve 5 adet de Esculenta (sarı) kuzu göbeği mantarı türü olduğunu göstermiştir. Esculenta grubu içerisindeki 5 adet türün 2 adedi, Elata grubu içerisinde de 15 adet türün 7 adedi sadece Türkiye'de belirlenmiş ve Türkiye için endemik olarak değerlendirilmiştir.
Özet (Çeviri)
A collection of 490 morels (Morchella spp.) was made from different provinces of Turkey during 2007-2008 in order to determine Morel species grown in Turkey flora and compare them with species of other region of world. Molecular analyses of this collection were made in laboratories of Bacterial Foodborne and Mycology Department of United States Department of Agriculture (USDA-Peoria, Illinois). The collection was analyzed individually and combined for species diversity using phylogenetic analyses of protein-coding genes, RNA polymerase I (RPB1), RNA polymerase II (RPB2), translation elongation factor (EF1-?) and nuclear ribosomal large subunit (28S, LSU) rDNA gene sequences. Also nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) rDNA sequences were generated within a species-rich lineage within the M. elata clade designated the Elata Subclade. Molecular analyses of 18 Morel samples from Swedish Museum of Natural History were made in this study. DNA sequences of Turkey species were assessed together with Sweden species and phylogenetically distinct species detected in a global survey (O?Donnell et al. 2011). Phylogenetic analyses of the individual and combined dataset of gene sequences indicated that the Elata Clade (black morels) and Esculenta Clade (yellow morels) in Turkey were represented by 15 and 5 species, respectively. Seven of 15 the Elata Clade species and two of 5 within the Esculenta Clade were only detected in Turkey, and these species were evaluated endemic for Turkey.
Benzer Tezler
- Türkiye florasında yetişen elaeagnus türleri üzerinde farmakognozik araştırmalar
Pharmacognostical researches on elaeagnus species grown on the flora of Turkey
HAFİZE YUCA
Doktora
Türkçe
2020
Eczacılık ve FarmakolojiAtatürk ÜniversitesiFarmakognozi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜHAL GÜVENALP
- Türkiye doğal florasında yetişen Oxytona seksiyonuna ait papaver türlerinin morfolojik ve palinolojik yönden incelenmesi
Morphologic and palynologic observation of Oxytona section belongs to papaver kind which grows up in natural flora of Turkey
SEVAL ŞAHİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
BiyolojiGaziosmanpaşa ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. İSKENDER PARMAKSIZ
- Türkiye doğal florasında yetişen oxytona seksiyonuna ait bazı papaver türlerinin kromozom sayılarının belirlenmesi
Determining chromosome numbers of papaver species belong to oxytona section grown in the natural flora of Turkey
ERKAN KESAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
ZiraatGaziosmanpaşa ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET YILDIRIM
- Türkiye florasında doğal olarak yetişen bazı bitki türlerinin antimikrobial ve antioksidan aktivitelerinin incelenmesi
Investigation of antimicrobial and antioxidant activities of some herb species which are naturally grown in Turkey flora
ELİF ÜNAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
BiyolojiAtatürk ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. AHMET ÇAKIR
Y.DOÇ.DR. AYDAN KARA
- Türkiye doğal florasında yetişen Papaver cinsi Oxytona seksiyonuna ait gen havuzunun SSR tekniği ile genetik karakterizasyonu
Molecular characterization of gene pool of Papaver genus Oxytona section grown in wild flora of Turkey by SSR technic
İSMAİL BENLİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BotanikGaziosmanpaşa ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. İSKENDER PARMAKSIZ