Geri Dön

Türkiye sularındaki işkine (Sciaena umbra Linnaeus,1758) ve kötek (Umbrina cirrosa Linnaeus,1758) balıklarının populasyonlarının genetik analizi

Genetic analyses of brown meagre (Sciaena umbra Linnaeus,1758) and shi drum (Umbrina cirrosa Linnaeus,1758) distributed along Turkish coastal waters

PDF İndir

  1. Tez No: 285370
  2. Yazar: ŞİRİN FİRİDİN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. İLHAN ALTINOK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Umbrina cirrosa, Sciaena umbra, Cyt-b, haplotip, RFLP, nükleotitçeşitliliği, Filogeni, Genetik-popülasyon, Umbrina cirrosa, Sciaena umbra, Cyt-b, haplotype, RFLP, nucleotidediversities, Phylogeny, Genetics-population
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Balıkçılık Teknolojisi Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

2008-2010 tarihleri arasında Trabzon, Giresun, Artvin, Rize, Adana, Antalya, Muğla ve?zmir bölgelerinden toplam 254 adet kötek (Umbrina cirrosa) ve işkine (Sciaena umbra)balık türleri örneklenmiştir. Cyt-b, 16S rRNA gen bölgelerinin sekans ve Cyt-b, 16S rRNAve ND1 gen bölgeleri için RFLP analiz sonuçları irdelenerek filogenetik ve populasyonanalizleri yapılmıştır. Sekans analizi sonuçlarına göre Cyt-b geninde işkinede 25, kötekte20 haplotip belirlenirken, 16S rRNA geni için işkinede 4 ve kötekte 8 haplotipbulunmuştur. Ayrıca Cyt-b ve 16S rRNA gen bölgeleri için haplotip çeşitliği işkinedesırası ile %83,8 ve %52,6 ve kötek de ise %80,5 ve %73,6 olarak bulunmuştur. Yapılanmoleküler varyans analizi sonucuna göre Fst değeri 0,07364 (P < 0.001) olarak bulunmuşolup, Trabzon Rize popülâsyonu hariç diğer popülâsyonlar birbirinden ayrılmıştır. KötekCyt-b moleküler varyans analizi sonucunda Fst değeri 0,1881 ve (P < 0.001) dir. Rize-Artvin populasyonları yalnız kendi aralarında ayrılmaz iken Antalya tüm populasyonlarlaaynı özelliği göstermiştir. İşkine ve Kötek için hesaplanan Nükleotid çeşitliliği (Pi) venükleotid farklığı (k) Cyt-b geni için sırası ile % 2,97 ve 2,87 ve 16S rRNA geni için isesırası ile 1,54 ile 0,61 olarak belirlenmiştir. Filogenetik analizlerde genus düzeyindeayrışma sağlanamamıştır. Yapılan RFLP analiz sonucunda ise populasyon düzeyindepolimorfik bir yapılanma bulunamamıştır.

Özet (Çeviri)

To analyze filogenetic and population structure of shi drum and brown meagre, 254 fishwere sampled from eight locations of Turkish coastal. The sequence analysis of Cyt-b, 16SrRNA and RFLP analysis of Cyt-b, 16S rRNA and ND1 gene sites were examined tofilogenetic and population structure of these fish. Based on sequence analyses, 25 and 20haplotypes were specified for brown meagre and for Shi Drum in Cyt-b gene and 4haplotypes for brown meagre and 8 haplotypes for shi drum in 16S rRNA. Nucleotidediversity in 16S rRNA and Cyt-b genes were found 83.8% and 52.6% for brown meagreand 80.5% and 73.6% for shi drum, respectively. Molecular variances analysis showed thatFST value was found 0.07364, Cyt-b molecular variances analysis for shi drum indicatedthat FST value was 0.1881 (P<0.001). The calculated nucleotide diversity (Pi) anddivergence (k) for brown meagre and shi drum were between 2.97% and 2.87% for Cyt-bgene and between 1.54% and 0.61% for 16S rRNA gene, respectively. Based onphylogenetic analysis no differentiation was achieved at the level of genus. According toRFLP analysis results, no polymorphic structure was found in population level.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    557652

    Preparation of poly(N-tris[hydroxymethyl]methyl acrylamide) based hydrogels and composites for removal of boron from aqueous solutions

    Sulu çözeltilerden bor giderilmesi için poli(N-tris[hidroksimetil]metil akrilamid) bazlı hidrojel ve kompozitlerin hazırlanması

    SARE NAZ ÇİFTÇİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Polimer Bilim ve Teknolojisiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Polimer Bilim ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BAHİRE FİLİZ ŞENKAL

  2. Tez No

    660472

    Türkiye'de su hakkı

    The right to water in Turkey

    YILDIZ AKEL ÜNAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    HukukGalatasaray Üniversitesi

    Kamu Hukuku Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERDOĞAN BÜLBÜL

  3. Tez No

    66453

    İstanbul iline içme-kullanma suyu temini amacıyla Sapanca Gölü Havzası'nın incelenmesi

    The examination of the sapanca lake basin in order to supply domestic water to the İstanbul project area

    YEŞİM KARCI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    İnşaat Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. M. EMİN KARAHAN

  4. Tez No

    559431

    Potential benefits of satellite-based automatic identification system in the context of intelligent transportation systems

    S-AIS teknolojisinin akıllı ulaşım sistemleri bağlamındaki potansiyel faydaları

    BORA ŞAN TURGUT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Denizcilikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Deniz Ulaştırma İşletme Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ İSMAİL ÇİÇEK

  5. Tez No

    238465

    Türkiye kıyısal sularındaki istavrit (Trachurus mediterraneus Steindachner, 1868, Trachurus trachurus Linnaeus, 1758 ve Trachurus picturatus Bowdich, 1825) populasyonlarının genetik ve morfolojik analizi

    Genetic and morphological analyses of horse mackerel (Trachurus mediterraneus Steindachner, 1868, Trachurus trachurus Linnaeus, 1758 and Trachurus picturatus Bowdich, 1825) distributed along Turkish coastal waters

    YUSUF BEKTAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    BiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ OSMAN BELDÜZ

Geri Dön