Raman cımbızlama spektrometresi kullanarak tekil biyolijik hücrelerdeki farklılıkların çok değişkenli analiz yöntemi ile saptanması
Determination of differences in single biological cells by multivariate analysis using raman tweezers spectrometer
- Tez No: 282589
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GÜNAY BAŞAR, PROF. DR. GÖNÜL BAŞAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Biyofizik, Physics and Physics Engineering, Biophysics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Atom ve Molekül Fiziği Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Preeklampsi hastalığı gebelikte karşılaşılan, görülme sıklığı ırklara, sosyoekonomik sınıflara göre değişmekle birlikte, tüm gebeliklerin yaklaşık olarak %8-10'unda rastlanan sistemik bir hastalıktır. Hipertansiyon ve proteinüri ile tanımlanır. Hastalığın erken teşhisi hem anne hem bebek için hayati önem taşıdığından erken dönem biyoişaretiçilerinin belirlenmesi ilgi konusudur.Preeklampsi hastalığı bugüne kadar Raman spektroskopik olarak incelenmemiştir. Çalışmamızda, çalışılan preeklampsi biyoişaretçileri serum ve plazma örnekleri için Raman spektroskopi ve tam kan örnekleri için Raman cımbızlama yöntemi ile incelenerek kontrol gruplarına göre bir farklılık sergileyip sergilemediği araştırılmıştır. Bu biyoişaretçilerden en belirgin olanları aromatik amino asitler, beta karoten ve yağ asitleridir.Tez çalışması çerçevesinde, yukarıda sayılan biyoişaretçiler için iki sınıf arasında bir ayrım bulunmak istenmiştir. Alınan spektrumlar yüksek benzerliğe sahip olduğunda geleneksel yöntemlerle iki sınıf arasındaki ayrımı yapmak oldukça zordur. Bunun için kemometrik yöntemlere başvurulmuştur. Kemometrik yöntemlerden biri olan Temel Bileşenler Analizi (PCA) açıklayıcı grafikler elde etmek ve bir başka kemometrik yöntem olan LDA'ya (Doğrusal Ayırma Analizi) veri hazırlamak üzere kullanıldı. Kemometrik analizleri yapmak için Matlab platformunda bir arayüz hazırlandı.
Özet (Çeviri)
Preeclampsia is a preganancy specific disorder whose frequency depends on races, socioeconomical classes but generally it is encountered about 8-10% of all pregnancies around the world. It is defined as hypertension and proteinurea. Early diagnosis of the disase is a focus point beacuse of its mortality for both mother and infantTo date, preeclampsia disease has not been investigated by Raman spectroscopy. In our study, we studied preeclampsia biomarkers for serum and plasma samples using Raman spectroscopy and for red blood cells using Raman tweezers, all taken from preeclamptic and healthy pregnants. We investigated if there is a difference between preeclamptic and healthy samples. The most clear differences in biomarkers are aromatic amino acids, beta caroten and fatty acids.In the view of thesis study, we wanted to make a classification between two classes by means of the biomarker mentioned above. When there is a big similarity between spectra, it is very difficult to make a classification between two classes. That is why we oriented chemometric methods. One of these chmeometric methods is PCA (Principal Component Analysis) which was used to obtain descriptive results by means of scores plots and to make input for another chemometric method, LDA (Linear Discriminant Analysis). A software interface was programmed on Matlab platform in order to make chemometric analysis mentioned above.
Benzer Tezler
- Sorting of biological cells in a microfluidic channel using holographic optical tweezers combined with raman spectroscopy
Biyolojik hücrelerin holografik optik tuzaklama ve raman spektroskopi kullanılarak bir mikroakışkan kanal içerisinde ayrıştırılması
UĞUR PARLATAN
Doktora
İngilizce
2017
Biyofizikİstanbul Teknik ÜniversitesiFizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜNAY BAŞAR
- Preeclampsia hastalığının raman cımbızlama yöntemiyle incelenmesi
Investigation of preeclampsia disease using raman tweezers
ŞEYMA ŞENİNAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜNAY BAŞAR
PROF. DR. GÖNÜL BAŞAR
- Introducing a novel optical microcavity: A glycerol/water microdroplet on a superhydrophobic surface
Yeni bir mikrokovuk tanıtımı: Su tutmayan yüzey üzerinde duran yağ/su mikrodamlacığı
MEHMET ALİ DÜNDAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
Fizik ve Fizik MühendisliğiKoç ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ADEM LEVENT DEMİREL
PROF. ALPHAN SENNAROĞLU
Y.DOÇ.DR. ALPER KİRAZ
- Measurement of the ultrasound velocity in various liquids using Raman-Nath diffraction technique
Raman-Nath difraksiyon tekniğini kullanarak sesötesi hızın değişik sıvılardaki ölçümü
MEHDİ BEHBOUDNİA
Yüksek Lisans
İngilizce
1993
Fizik ve Fizik MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. RAMAZAN AYDIN
- Civa (II) klorür ve civa (II) bromürün çeşitli çözücüler içinde yapısal davranışının raman spektroskopisi ile incelenmesi
Başlık çevirisi yok
SEMA ŞAHİN
Yüksek Lisans
Türkçe
1994
Fizik ve Fizik MühendisliğiGazi ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZİYA KANTARCI