Dermatofitlerin çabuk tanısında (Gaca)4, Its1 ve Its2 bölgelerini hedef alan primerlerin etkinliğinin karşılaştırılması
Comparison of efficiency of (Gaca)4 and primers targeting Its1-Its2 regions in rapid identification of dermatophytes
- Tez No: 281844
- Danışmanlar: PROF. DR. MACİT İLKİT
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Dermatofitler, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Sporlar-mantar, Teşhis, Dermatophytes, Polymerase chain reaction, Spores-fungal, Diagnosis
- Yıl: 2011
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Dermatofitozların patogenezinin ve klinik öneminin tam olarak anlaşılabilmesi için dermatofit grubu mantarların doğru identifikasyonu gereklidir. Rutin çalışmalarda, dermatofit grubu mantarların doğru sınıflandırılması ve tanısı kolay değildir. Uygun in vitro koşullar altında bol miktarda üretilebilen makrokonidiyum morfolojisi dermatofitlerin sınıflandırılmasında önemli bir kriterdir. Ancak, bazı dermatofit türleri, M. audouinii, M. ferrugineum, T. concentricum, T. schoenleinii, T. soudanense, T. verrucosum, T. violaceum, ve T. yaoundei, nadiren makrokonidiyum oluşturur ve identifikasyonları güçtür. Bu çalışmada, real-time PCR yönteminin dizaynı, optimizasyonu ve değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Testin performansı, nadiren makrokonidiya üreten ve yukarıda bahsedilen 8 türü temsil eden 26 standart köken ile laboratuvarımızda izole ve identifiye edilen, M. canis (n = 4), T. mentagrophytes (n = 2), T. rubrum (n = 20), T. rubrum morfotip“raubitschekii”(n = 2) ve T. tonsurans (n = 1 )'ın dahil olduğu 29 klinik izolat olmak üzere toplam 55 dermatofit suşu ile değerlendirilmiştir. Çalışmada real-time PCR 12 dermatofit türünü de doğru tanıdı. Sonuç olarak, real-time PCR yüksek özgüllük ve duyarlılığı ile dermatofit türlerinin, özellikle nadiren makrokonidiya oluşturan türlerin tanısını kolaylaştırdı ve çabuklaştırdığı görüldü. Bu yöntemin en önemli avantajı dermatofit grubu mantarların doğru ve güvenilir tanısına olanak sağlamasıdır.
Özet (Çeviri)
It is essential to correctly identified the dermatophytic fungi in order to well-understand the pathogenicity and clinical significance of such tinea. In routine practice, reliable identification of dermatophytic fungi are notoriously difficult to classify and identify. The morphology of macroconidia, which are produced abundantly under suitable conditions, in vitro, has provided useful criteria for classifying dermatophytes. However, several dermatophytic fungi, e.g., M. audouinii, M. ferrugineum, T. concentricum, T. schoenleinii, T. soudanense, T. verrucosum, T. violaceum, and T. yaoundei are rarely produce macroconidia and cannot be easily identified. The objective of this study was to analyse the design, optimization, and evaluation of real-time PCR assay in the laboratory setting. The performance of the assay was evaluated with 55 dermatophyte isolates; 29 clinical strains from our laboratory including M. canis (n = 4), T. mentagrophytes (n = 2), T. rubrum (n = 20), T. rubrum with the“raubitschekii”morphotype (n = 2), and T. tonsurans (n = 1 ) as well 26 rare macroconidia producing reference strains including above mentioned eight species. Real-time PCR correctly identified the all 12 dermatophyte species. Finally, real-time PCR assay facilitated the identification of dermatophytic species with excellent sensitivity and specificity, particularly for rare macroconidia producing species. The advantage of the assay is to provide accurate and reliable diagnosis of dermatophytic fungi.
Benzer Tezler
- Sivas yöresinde izole edilen dermatofitler
Dermathopytes isolated in the Sivas area of Turkey
ÖZDER ÖZTUNALI
Yüksek Lisans
Türkçe
1984
MikrobiyolojiCumhuriyet ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YAHYA HAKGÜDENER
- İmidazol türevlerinin antifungal etkilerinin in vitro ve in vivo incelenmesi
Başlık çevirisi yok
MEHMET FEVZİ CANDAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1988
DermatolojiErciyes ÜniversitesiDermatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÜMİT SOYUER
- İzmir ve çevresinde dermatomikozlar
Başlık çevirisi yok
EMEL ÇERÇİOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1990
DermatolojiDicle ÜniversitesiDermatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET DERİCİ
- Dermatofitozların laboratuvar tanısında direkt mikroskopik inceleme ve kültür yöntemlerinin karşılaştırılması
Başlık çevirisi yok
ŞÜKRAN YAVUZDEMİR