Globular protein çözeltilerinde etkin etkileşme potansiyelleri
Interaction effective potentials of globular protein solutions
- Tez No: 269272
- Danışmanlar: PROF. DR. SERAP ŞENTÜRK DALGIÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Trakya Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada temeli kısa-menzilli, merkezi makro atomlar arasındaki çiftler etkileşme potansiyeli temsiline dayanan globular protein çözelti modelinde teorik ve simülasyon çalışmaları incelenmiştir. İlk olarak, Derjaguin ve Landau, Verwey ve Overbeek (DLVO), genelleştirilmiş Lenard-Jones ve Girifalco gibi etkileşme model potansiyelleri ile C60 için literatürde yapılan araştırmalar gözden geçirilmiştir.Globular protein çözeltilerinde makro parçacıklar arasındaki etkileşmeleri; kısa menzilli, merkezi, çiftler potansiyelleri kullanarak tanımlayan Pellicane-Costa-Caccamo (PCC) modeli incelenmiştir. Prototip Globular protein çözeltilerinden, lysozyme çözeltilerini ele alarak kısa menzilli etkileşme potansiyellerine ve sıvıhal teorilerinden VMHNC'ye dayanan bir model oluşturulmuş sistemin statik yapı faktörleri ve radyal dağılım fonksiyonları hesaplanmıştır. Bu amaçla lisozim katkılı globular protein çözeltileri için Girifalco, Yukawa, Modifiye Lennard-Jones, DLVO model potansiyelleri ile VMHNC yaklaşımını kullanarak hesaplanan yapı sonuçları daha önceki PCC modeli sonuçları ve MD ile karşılaştırılmıştır.
Özet (Çeviri)
In this work, it was investigated the theoretical and simulation studies of the globular solution model based on short-range, central the pair potential representations of the interaction among macro-atoms. Firstly, we have examined the literature for the studies of C60 with the interaction model potentials such as DLVO, generalized Lennard-Jones and Girifalco.Then, the Pellicane-Costa-Caccomo (PCC) model of globular protein solutions based on short-range, central the pair potential representations of the interaction among macro-particles is investigated. We have proposed a model for Prototype like globular protein solutions as Lysozme solutions using short range interaction potentials with one of the liquid state theories as VMHNC inorder to calculate the static sructure factors and radial distribution functions of the system. The computed structural results using Girifalco, Yukawa, Modified LJ and DLVO potential with VMHNC approximation have been compared with those obtained by PCC model and MD results.
Benzer Tezler
- Polikatvon-protein etkileşiminin ve makromoleküller arası kompleks oluşumunun incelenmesi
Başlık çevirisi yok
ORHAN GÜNEY
Doktora
Türkçe
1997
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABDÜLKADİR SEZAİ SARAÇ
- Hydrogels and self-assembled nanostructures based on wool keratose
Yün keratozu bazlı hidrojeller ve kendiliğinden düzenlenebilen nanoyapılar
EFECAN PAKKANER
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Kimya Mühendisliğiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. AYBEN TOP
- Poliakrilik asidin bovine serum albumin ile etkileşiminin dinamik ve elektroforetik ışık saçılması yöntemleri ile araştırılması
The investigation of interaction of polyacrylic acid with bovine serum albumin by dynamic and electrophoretic light scattering methods
ERAY DALGAKIRAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF.DR. MEHMET MUSTAFAEV AKDESTE
- Squence-structure relationships in globular proteins
Küresel proteinlerde dizin yapı ilişkisi
MİNE KAPLAN
- Development of a hybrid methodology for investigation and manipulation of functional mechanisms of biological macromolecules with a focus on non-globular proteins
Globüler olmayan proteinler kapsamında biyolojik makromoleküllerin işlevsel mekanizmalarının incelenmesi ve manipülasyonu için hibrid bir yöntemin geliştirilmesi
BURÇİN ACAR
Doktora
İngilizce
2021
BiyomühendislikBoğaziçi ÜniversitesiPROF. DR. AHMET ADEMOĞLU
PROF. DR. TÜRKAN HALİLOĞLU