Bazı gram-negatif bakteriyel balık patojenlerinde çevreyi algılama sisteminin incelenmesi
Investigation of quorum sensing system in some gram-negative fish pathogenic bacteria
- Tez No: 268663
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYŞEGÜL KUBİLAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Su Ürünleri, Aquatic Products
- Anahtar Kelimeler: Çevreyi algılama sistemi, biyofilm, pigment, N-acyl homoserin lakton, bakteriyel balık patojenleri, Quorum sensing system, biofilm, pigment, N-acyl homoserine lactones, fish pathogens bacteria
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Su Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Araştırmada bakteriyel balık patojenlerinden Vibrio anguillarum (5 suş), Vibrio alginolyticus (3 suş), Pseudomonas fluorescens (3 suş), Aeromonas hydrophila (2 suş) ve Yersinia ruckeri (12 suş) izolatları kullanılmıştır. İzolatlarda öncelikle N-butanoyl-L-homoserin lakton (BHL) ve N-(3-okzododekanoyl)-L-homoserin lakton (OdDHL) sinyal moleküllerinin üretimi, Chromobacterium violaceum CV026 ve Agrobacterium tumafeciens NT1 indikatör suşları kullanılarak test edilmiştir. C. violaceum CV026 suşu kullanılarak yapılan testlerde A. hydrophila ve Y. ruckeri suşlarının BHL sinyal molekülünü ürettiğinin tespit edilirken V. anguillarum, V. alginolyticus ve P. fluorescens suşlarının ise üretmediği tespit edilmiştir. BHL sinyal molekülünü üretmeyen suşlar ve üreten suşların tamamının A. tumefaciens NT1 suşu kullanılarak yapılan testte ise OdDHL sinyal molekülünü üretebildiklerini göstermiştir. Araştırmanın sonucunda çalışılan tüm Gram negatif bakteriyel balık patojenlerinin OdDHL sinyal molekülünü üretebildikleri tespit edilmiştir. Üretmiş oldukları sinyal molekülleri aracılığıyla birbirleri ile iletişim kurmakta ve istedikleri çoğunluğa ulaştıkları anda balık için kritik gen ekspresyonlarını tetiklemektedir. Gram negatif bakteriyel balık patojenleri BHL ve OdDHL sinyal moleküllerinin tespitiyle bu moleküllere bağımlı olan biyofilm, pigment, ramnolipid, elastaz, proteaz, amilaz, hemoliz üretimi gibi çevreyi algılama sistemi tarafından kontrol edilen virülens faktörlerinin varlığı bakımından fenotipik olarak test edilmiştir.Çalışılan Gram negatif balık patojenlerinin birbirleriyle aynı ya da farklı olarak araştırılan virülens faktörlerini üretebildikleri tespit edilmiştir. V. anguillarum, V. alginolyticus, P. fluorescens suşlarının tamamının biyofilm ve pigment ürettikleri belirlenmiştir. Pigment için yapılan ikinci test olan tirozin saydamlaştırmada ise sadece P. fluorescens`in bir suşunda belirlenmiştir. P. fluorescens, A. hydrophila suşlarının ramnolipid ürettikleri belirlenmiştir. PAO1 kontrol suşuna göre daha az elastaz aktivitesine sahip olan suşlar P. fluorescens, A. hydrophila, Y. ruckeri, V. anguillarum suşlarıdır. PAO1 kontrol suşuna göre daha yüksek elastaz aktivitesine sahip olan V. alginolyticus suşlarıdır. V. anguillarum, A. hydrophila suşları ve P. fluorescens suşlarından ikisinin proteaz aktivitesi pozitifken Y. ruckeri ve V. alginolyticus suşlarında negatiftir. V. anguillarum, V. alginolyticus, P. fluorescens, A. hydrophila suşlarının amilaz testi pozitifken Y. ruckeri suşları negatiftir. V. anguillarum, P. fluorescens, A. hydrophila suşlarının hemoliz testi pozitif olarak Y. ruckeri ve V. alginolyticus suşları negatif olarak tespit edilmiştir.Bu klinik Gram negatif bakteriyel balık patojen izolatları çevreyi algılama sistemiyle organize olmakta, aynı anda etki göstermekte ve virülens faktörleriyle balıklarda çeşitli şekillerde enfeksiyonlara sebep olmaktadır.
Özet (Çeviri)
Some Gram Negative fish pathogen bacteria in Vibrio anguillarum (5 strains), Vibrio alginolyticus (3 strains), Pseudomonas fluorescens (3 strains), Aeromonas hydrophila (2 strains) and Yersinia ruckeri (12 strains) isolates were used in this investigation. Before all else these isolates were tested for the production of N-butanoyl-L-homoserine lacton (BHL) and N-(3-okzododekanoyl)- L-homoserine lacton (OdDHL) signal molecules using indicator strains the Choromobacterium violaceum strain CV026 and the Agrobacterium tumefaciens strain NT1. V. anguillarum, V. alginolyticus and P. fluorescens strains had no BHL activity while A. hydrophila and Y. ruckeri strains had BHL activity by using bioassay strain C. violaceum CV026. Strains produce had no BHL activity and strains produce had BHL activity all A. tumefaciens NT1 strain showed using tested the produce of OdDHL signal molecules. All working in Gram Negative fish pathogen bacteria identified the produce of OdDHL signal molecules was investigated. The signal molecules of the produce via communication with each other and majority of desirable access at the same time when triggers critical gene expression for fish. Gram Negative fish pathogen bacteria identified of BHL and OdDHL signal molecules this molecules dependent which the produce of biofilm, pigment, rhamnolipid, elastase, protease, amilase and hemolysis as phenotype tested as virulence factors entity controlled of quorum sensing system.Working in Gram negative fish pathogen bacteria with each other identified alike or different virulence factors can produce has been invested. Biofilm and pigment product determined of all V. anguillarum, V. alginolyticus, P. fluorescens strains. Only one strain of P. fluorescens identified if doing secondary test which make sth transparent of thyrosine tested for pigment. P. fluorescens, A. hydrophila strains identified rhamnolipid product. According P. aeruginosa PAO1 control strain P. fluorescens, A. hydrophila, Y. ruckeri, V. anguillarum strains had less elastase activity. According P. aeruginosa PAO1 control strain V. alginolyticus strains had higher elastase activity. V. anguillarum, A. hydrophila strains and two of P. fluorescens strains are protease activity positive while Y. ruckeri ve V. alginolyticus strains were activity negative. V. anguillarum, V. alginolyticus, P. fluorescens, A. hydrophila strains were amilase activity positive while Y. ruckeri strains were activity negative. V. anguillarum, P. fluorescens, A. hydrophila strains were hemolysis activity positive while Y. ruckeri and V. alginolyticus strains were hemolysis activity negative.This clinic Gram negative fish pathogen bacteria isolate to have one's ducks in a row with quorum sensing system and adduced alike at the same time show effect and with virulence factors at fish induced cause different shape of infections.
Benzer Tezler
- Deniz kültür balıklarında görülen bakteriyel patojenlerin teşhisi ve antibakteriyel maddelere duyarlılıklarının belirlenmesi
Determination of antibacterial drugs sensitivity and diagnosis of bacterial pathogens in cultured marine fish
HİLAL GÜRALP
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
Su Ürünleriİstanbul ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SÜHEYLA KARATAŞ STEİNUM
- Balık yağındaki eikosapentaenoik asit (EPA) ve dokosaheksaenoik asit (DHA)in yüksek performanslı sıvı kromatografi (HPLC) yöntemi ile saflaştırılması ve bazı patojenik bakteriler üzerine etkisinin incelenmesi
Purification of eicosapentaenoic acid (EPA) and docosahexaenoic acid (DHA) from fish oil using HPLC method and investigation of their antibacterial effects on some pathogenic bacteria
YILMAZ UÇAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Su ÜrünleriÇukurova ÜniversitesiSu Ürünleri Avlama ve İşleme Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH ÖZOĞUL
- Desıgn, synthesıs and bıologıcal actıvıty studıes on some novel acyl homoserıne lactone analogues
Bazi yeni açilhomoserinlakton analoglarinin tasarimi, sentezi ve biyolojik aktiviteleri üzerinde çalişmalar
ANOOSHİRVAN M. MİANDJİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
Eczacılık ve FarmakolojiGazi ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİNGUR NOYANALPAN
- Investigation of antimicrobial resistance in wild-type and stress-resistant Saccharomyces cerevisiae strains
Yaban-tip ve strese dirençli Saccharomyces cerevisiae suşlarında antimikrobiyal dirençliliğinin incelenmesi
RIZIQ NAHIDH ISMAEEL ALSAMAWI
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Kültür deniz balıklarında stafilokok enfeksiyonlarının çeşitli diyagnostik metotlarla tespiti üzerine bir çalışma
A study on the detection of staphylococcal infections in cultured marine fish using various diagnostic methods
ÖZGÜR ÇANAK
Doktora
Türkçe
2017
Su Ürünleriİstanbul ÜniversitesiSu Ürünleri Yetiştiriciliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLŞEN TİMUR