Geri Dön

Rotavirusun 0-5 yaş arası çocuklarda polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile serotiplendirilmesi ve poliakrilamid jel elektroforezi ile elektroferotiplendirilmesi

Serotyping rotavirus by PCR method and electropherotyping by PAGE between 0-5 years old children

PDF İndir

  1. Tez No: 260727
  2. Yazar: MELDA MERAL
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. GÜLENDAM BOZDAYI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Rotavirus, Serotip, PAGE, Elektroferotip, Elektroforez-poliakrilamid jel, Poliakrilamid jel elektroforezi, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Rotavirüsler, Stereotip, Rotavirus, Serotype, PAGE, Electropherotype, Electrophoresis-polyacrylamide gel, Polyarcrylamide gel electrophoresis, Polymerase chain reaction, Rotaviruses, Stereotyping
  7. Yıl: 2010
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gazi Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Rotavirus tüm dünyada 0-5 yaş arası çocuklarda akut gastroenteritin en önemli etkenidir. Bu çalışmada hastanemize başvuran akut gastroenteritli 0-5 yaş arasındaki çocuklarda rotavirus enfeksiyonlarının prevalansının belirlenmesi ve bölgemizde yaygın olan rotavirus serotip ve elektroferotiplerin saptanması amaçlanmıştır.Çalışma Nisan 2009 ile Şubat 2010 tarihleri arasında gastroenterit ile hastanemize başvuran 0-5 yaş arasındaki 251 hastanın gaita örnekleri ile gerçekleştirilmiştir. Antijen pozitifliği ELISA ile saptanmış ve pozitif örneklerden fenol-kloroform-izoamil-alkol methodu ile dsRNA'lar izole edilmiştir. İzolatlar PAGE ile elektroferotiplendirilmiştir. Rotavirus G ve P serotipleri RT-PZR ve Nested PZR ile belirlenmiştir.Çalışmaya alınan örneklerin 53'ü (%21.1) ELISA pozitif bulunmuştur. Bunların 31'inde (%58.5) G tipleri ve 24'ünde (%45.3) P tipleri saptanmıştır. Çalışmamızda G tiplerini G1(%16.1), G2(%12.9), G3(%38.7), G4(%25.8) ve G9 (%6.5) serotipleri, P tiplerini de P[8]( %87.5), P[6] (%8.3) ve P[9] (%4.2) serotipleri oluşturmuştur. Rotavirus G/P(%34) kombinasyonlarından en sık G3P[8] serotipi (%38.9) saptanmıştır. Dört farklı elektroferotip gözlenmiş ve E (%43.4) tipi sıklığı; E1(%43.5), E2(%43.5), E3(%4.3) ve E5(%8.7) olarak saptanmıştır.Çalışmamızın sonucunda, bölgemizde G1-4 ve G9 tiplerinin yaygınlını koruduğu, ancak belirgin şekilde G1'den G3 ve G4'e geçiş olduğu ve G9'un azaldığı gözlenmiştir. Daha önce yaygın görülen G1P[8]`in yerini G3P[8]'in aldığı saptanmıştır. Önceki çalışmalarda tüm E tipleri görülebilmesine rağmen çalışmamızda 4 E tipi tespit edilmiştir. Globalleşmenin bir sonucu olarak önceki dönemlerde rastlanan sıklıklarda sapmalar olduğu gösterilmiştir.

Özet (Çeviri)

Rotavirus is the major cause of gastroenteritis between 0-5 years old children worldwide. To determine the prevalance of rotavirus infection between 0-5 years old children attended our hospital with acute gastroenteritis and to confirm the prevalent serotypes and electropherotypes in our region was aimed in this study.This study is conducted with the stool speciments of 251 children between 0-5 years old, attended our hospital from April 2009 to February 2010. Rotavirus antigen was detected by ELISA and dsRNA was extracted from the positive samples using phenol-chloroform-isoamyl alcohol method. Isolates were electropherotyped by PAGE. Serotypes G and P were determined by RT-PCR and Nested PCR.Fifty-three of the collected samples (21.1%) were ELISA positive. In 31(58.5%) and in 24(45.3%) of the samples G and P types were detected respectively. Serotypes G1(16.1%), G2(12.9%), G3(38.7%), G4(25.8%) and G9(6.5%) constituted G types and P[8]( 87.5%), P[6](8.3%) and P[9](4.2%) types constituted P types. The most predominant serotype was G3P[8](38.9%) among the identified G/P(34%) combinations. Four different electropherotypes were observed (43.4%) and the prevalance of E types were detected as; E1(43.5%), E2(43.5%), E3(4.3%) and E5(8.7%).In conclusion, it was observed that G1-4 and G9 types are stil prevalent in our region, but there is a transition from the prevalance of G1 to G3 and G4, also a decrease in G9 prevalance. Instead of previously circulated G1P[8], G3P[8] was detected as the predominant combination. Althougt all E types were visible in previous studies, only four E types were detected in our study. As a result of globalisation a diversion in the previously observed ratio was presented.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    379343

    Erzurum bölgesinde 0-5 yaş arası gastroenteritli çocuklarda tespit edilen rotavirüslerin moleküler tiplendirilmesi

    Molecular typing of rotaviruses detected in children aged 0-5 with gastroenteritis in Erzurum region

    HAKAN AYDIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OSMAN AKTAŞ

  2. Tez No

    331258

    Akut gastroenteritli çocuklarda sekiz farklı viral etkenin araştırılması

    Eight different viral agents in childhood acute gastroenteritis

    DERYA BOZKURT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİnönü Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUKADDER AYŞE SELİMOĞLU

  3. Tez No

    489792

    0-5 yaş arası akut gastroenteritli çocuklarda rotavirus ve adenovirus sıklığı

    Rotavirus and adenovirus frequency among 0-5 years old children with acute gastroenteritis

    ARİF KIZILIRMAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    MikrobiyolojiDüzce Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. EMEL ÇALIŞKAN

  4. Tez No

    115524

    Konya bölgesi 0-5 yaş grubu çocuklarda rotavirus enfeksiyonlarının seroepidemiyolojisi ve 0-3 yaş arası ishalli çocuklarda rotavirus enfeksiyonlarının lateks aglütinasyon (LA), enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) ve polyacrylamide gel elec ...

    Seroepidemiology of rotavirus infection among 0-5 years children and determination of rotavirus infection with the methods of latex, ELISA and polyacrylamide gel elektrophoresis (PAGE) among 0-3 years old diarrhoeic children in Konya region

    MUSTAFA ALTINDİŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    MikrobiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Viroloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİBEL YAVRU

  5. Tez No

    306280

    Erzurum ve çevresinde 0-5 yaş arası çocuklarda rotavirüs prevelansı'nın araştırılması

    Research the prevelance of rotavirus in erzurum area between 0-5 years old children

    ÇİĞDEM EDA BALKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELAHATTİN ÇELEBİ

Geri Dön