EPCR genindeki olası değişimlerin trombozlu olgularda sEPCR seviyeleri üzerindeki etkisinin araştırılması
Screening of EPCR gene on the effects of sEPCR in thrombotic patients
- Tez No: 256333
- Danışmanlar: PROF. DR. NEJAT AKAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Biyoloji, Biotechnology, Genetics, Biology
- Anahtar Kelimeler: Koagülasyon, Tromboz, Endotelyal Protein C Reseptörü (EPCR), solubl EPCR (sEPCR), Coagulation, Thrombosis, Endothelial Protein C Receptor (EPCR), soluble EPCR (sEPCR)
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Protein C yolağı, koagülasyonun düzenlenmesi için fizyolojik olarak önemli bir mekanizmadır. Bu yolak, trombin endotel hücre yüzey reseptörü trombomoduline bağlandığında harekete geçirilir. Trombin-trombomodulin kompleksi protein C'yi aktive eder. Aktive edilmiş protein C (APC), kofaktörü protein S ile birlikte faktör Va (FVa) ve faktör VIIIa'nın (FVIIIa) proteolitik inaktivasyonuyla koagülasyon kaskadının gelişmesini ve amplifikasyonunu sınırlandırır. Bu işlem, aktive edilmiş trombositlerin negatif yüklü yüzeyi üzerinde meydana gelir.Endotelyal protein C reseptörü (EPCR), bir tip I transmembran proteinidir ve daha çok geniş damarların endotelinde ifade edilir. Protein C'nin (PC) EPCR'ye bağlanması, trombin-trombomodulin kompleksi için PC'nin afinitesini arttırarak PC aktivasyonunu uyarır. EPCR, CD1 (major histocompatibility class I) ailesine yapısal olarak çok benzerdir. EPCR, ekstraselüler domainlerine ilavaten, bir transmembran domaini ve çok kısa bir sitoplazmik kuyruğa sahiptir. EPCR geni 20q11.2'de lokalizedir. Dört ekzondan oluşur. Bu reseptörün çözünmüş formu (sEPCR) ise plazmada dolaşır ve hem PC aktivasyonunu hem de APC'nin antikoagulant aktivitesini inhibe eder. Yüksek sEPCR seviyeleri tromboz için risk faktörüdür.Çalışmamızın amacı, tromboza yatkınlığa neden olduğu düşünülen genlerden biri olan EPCR geninde bulunan olası değişimlerin tespit edilmesi ve bu değişimlerin plazma sEPCR seviyeleri üzerindeki etkilerinin araştırılmasıdır. Bu çalışmada, sEPCR seviyeleri 50 ng / ?l'den düşük 42 trombozlu olgu ve 29 kontrol DNA'sı ve sEPCR seviyesi 130 ng / ?l'den yüksek 74 trombozlu olgu ve 24 kontrol DNA'sı kullanılmıştır. Kanlardan izole edilen DNA'lar sırasıyla PCR, SSCP, DNA Dizi Analizi teknikleri kullanılarak analiz edilmiştir. Çalışma sonucunda sEPCR seviyeleri bilinen hastalarda c.3998C>T ve c.4678C>G baz değişimleri saptanmıştır. 3'UTR'nin RNA stabilitesindeki rolü bilindiğinden, EPCR geni 3'UTR'da belirlediğimiz c.4678C>G değişimi tromboz riski açısından önem taşıyabilir.
Özet (Çeviri)
The protein C pathway is a physiologically important mechanism for the regulation of the coagulation process. The pathway is triggered when thrombin binds to the endothelial cell surface receptor thrombomodulin. The thrombin-thrombomodulin complex activates protein C. Activated protein C (APC), together with its cofactor protein S, limits the amplification and progression of the coagulation cascade by proteolytic inactivation of factors (F)Va and FVIIIa. This process occurs on the negatively charged surface of activated platelets.Endothelial cell protein C receptor (EPCR) is a type I transmembrane protein that is almost exclusively expressed on the endothelium of large vessels. Binding of protein C (PC) to EPCR stimulates PC activation by increasing the affinity of PC for the thrombin-thrombomodulin complex. EPCR is similar to molecules of the class I major histocompatibility complex, in particular the CD1-subfamily. In addition to the extracellular domains, EPCR has a transmembrane domain and a very short cytoplasmic tail. EPCR gene is located on chromosome 20q11.2. It consists of four exons. A soluble form of this receptor (sEPCR) circulates in plasma and inhibits both PC activation and APC anticoagulant activity.The aim of this study was to investigate the detection of the variations in the EPCR gene which has a role for thrombosis and the effects of this variations on the plasma sEPCR levels. We have 42 thrombotic patients and 29 healthy subject samples that have lower sEPCR levels (sEPCR< 50 ng / ?l) and 74 thrombotic patients and 24 healthy subject samples that have higher sEPCR levels (sEPCR>130 ng / ?l). Following DNA extraction, PCR, SSCP and DNA sequencing analysis of EPCR gene were performed. We detected 3998C>T and 4678 C>G polymorphisms in patients that have known sEPCR levels. The role of 3?UTR at RNA stability is known. Thus, EPCR 3?UTR 4678G>C polymorphism might have important effect on the thrombotic risk.
Benzer Tezler
- Plazminojenaktivatör inhibitor-1(PAI-1) 4g/5g gen değişiminin uzun yaşama etkisi
Effect of PAI-1 4g/5g gene variation on longevity
Z. GÜLİN GÜLBAHAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEJAT AKAR
- Identification of genes involved in hepatocellular carcinoma : Evaluation of hCdc4 and B-Raf genes
Hepatoselüler karsinomda R01 alan genlerinin tanımlanması: hCdc4 and B-Raf genlerinin değerlendirilmesi
BANU SÜRÜCÜ
Yüksek Lisans
İngilizce
2003
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CENGİZ YAKICIER
- Bop (cd8 beta opposite) geninin hipertrofik kardiyomiyopatili hastalarda mutasyon analizi
Mutation analysis of bop(cd8 beta opposite) gene in hyperthrophic cardiomyopathy patients.
NESLİHAN ABACI
Doktora
Türkçe
2006
Tıbbi Biyolojiİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
PROF.DR. NİHAN ERGİNEL ÜNALTUNA
- Acquired expression of transcriptionally active p73 in hepatocellular corcinoma cells
Karaciğer kanseri hücrelerinde p73'ün transkripsiyonel olarak aktif formunun edinilmiş ifadesi
ABDÜLKADİR EMRE SAYAN
Doktora
İngilizce
2002
Tıbbi Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK
- Çeşitli klinik örneklerden izole edilen candida albicans suşlarının genotipik dağılımı
Genotypic distribution of clinical isolates of candida albicans
ZEYNEP CEREN KARAHAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAnkara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. NEJAT AKAR