Biyolojik aktif bazı maddelerin teorik olarak incelenmesi
A theoretical study on the biologically active some substances
- Tez No: 256000
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. TEMİR ALİ DEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: pürin katabolizması, hipoksantin, ürik asit, tautomerizm, Se atomu, HF(Hartree-Fock), DFT, Pürinler, Taumetri, Purin catabolism, hypoxanthine, uric asid, tautomerism, Selenium atoms, HF(Hartree-Fock), DFT, Purines, Taumetry
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada biyolojik aktif olan, pürin katabolizmasında önemli rolleri bulunan adenozin, guanozin, guanin, inozin, hipoksantin, ksantin ve ürik asit teorik olarak incelendi.Moleküllerin gaz, su ve kan fazında, fiziksel ve termodinamik özellikleri ile yapısal parametreleri Gaussian 03W programında Hartree-Fock (HF) metodu ve Yoğunluk Fonksiyonu Teorisi (DFT/B3LYP) hibrit yaklaşımı ile 6-31G(d,p) ve 6-31+G(d,p) temel setleri kullanılarak hesaplandı.Yapılan hesaplamalarda çalışılan moleküllerin yapılarını aydınlatmak için bağ uzunlukları, bağ açıları, dihedral açıları, dipol moment, en yüksek dolu moleküler orbital (HOMO), en düşük boş moleküler orbital (LUMO) enerjileri, nükleofilite(?) ve serbest enerji (?G) değerleri HF ve DFT metotları ile hesaplandı. Elde edilen sonuçlara göre herbir molekül için en kararlı tautomer bulundu. Sonra bu kararlı tautomerlere Se atomu bağlandı. Tekrar serbest enerji (?G) değerleri kontrol edildi Sonuçta ürik asit miktarını kontrol etmek için, bizim çalışmamızda bulunan sonuçlara göre, Se atomunun bağlanması gereken en uygun molekülün hipoksantin olduğu saptandı.Bu hesaplamalarda DFT yöntemi HF yöntemine göre daha başarılı bulundu.
Özet (Çeviri)
In this study, some biologically active substances which plays important roles of adenosine, guanosine, guanin, inosine, hypoxanthine, xanthine and üric asid in the purins catabolism were investigated theoretically.Gas, liquid and blood phase, structural parameters along with physical and thermodynamic properties of the studied molecules were calculated using Hartree-Fock (HF) and Density Function (DFT/B3LYP) methods with hybrid approach and 6-31G(d,p) basis set.In the present work structural parameters such as bond lenths, bond angles, dihedral angles and dipole moments, HOMO(Highest Occupied Molecular Orbital), LUMO(Lowest Unaccupied Molecular Orbital) energies; nükleofilite(?) and free energy (?G) values studied using B3LYP/6-31G(d,p) and HF/6-31G(d,p) methods. According to result for each molecule the most stable tautomer found. Then Se atoms determined to tautomers linked. Free energy (?G) values were checked again. As a result, to control the amount of uric acid, which result in our study, according to the most appropriate to connect the Se atoms of the molecule were identified as hypoxanthine.That HF calculations according to the method of DFT methods were more successful.
Benzer Tezler
- A Study on oxygen transfer organic matter removal and nitrification in sewer lines
Kanalizasyon sistemlerinde oksijen transferi, organik madde giderimi ve nitrifikasyon
AHMET BABAN
Doktora
İngilizce
1998
İnşaat Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLHAN TALINLI
- Hastane ve medikal laboratuvarı atıksularının membran biyoreaktör (MBR) ile farklı koşullarda arıtılması: İlaç etken madde giderim performansının ve akut inhibisyon etkisinin incelenmesi
Treatment of hospital and medical laboratory wastewater under different conditions by membrane bioreactor (MBR): Investigation of removal performance of pharmaceuticals and acute inhibition effect
RECEP PARTAL
Doktora
Türkçe
2020
Çevre MühendisliğiSüleyman Demirel ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVZAT ÖZGÜ YİĞİT
DOÇ. DR. SELDA MURAT HOCAOĞLU
- Bazı biyolojik aktif bileşiklerin moleküler yapılarının ve spektroskopik özelliklerinin deneysel ve teorik yöntemler ile incelenmesi
Study of the molecular structure and spectroscopic properties of some biologically active compounds with experimental and theoretical methods
EBRU KARAKAŞ SARIKAYA
Doktora
Türkçe
2018
Fizik ve Fizik MühendisliğiSelçuk ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER DERELİ
- Treatability of İstanbul Yenikapı discharge wastewater by chemical precipitation
Başlık çevirisi yok
DEMİR A. MÜFTÜOĞLU
- Biogas recovery during anaerobic treatment of lignocellulose-rich pollutants with high sulphate content: an investigation via innovative applications
Yüksek sülfat içerikli lignoselüloz bakımından zengin kirleticilerin havasız arıtımı sırasında biyogaz geri kazanımı: yenilikçi uygulamalarla bir araştırma
EDA YARSUR
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÇİĞDEM GÖMEÇ