Mesane kanserlerinde miRNA'ların ekspresyonlarının belirlenmesi
Determination of miRNAs' expressions in bladder cancers
- Tez No: 248786
- Danışmanlar: PROF. DR. SEVİLHAN ARTAN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Üroloji, Genetik, Tıbbi Biyoloji, Urology, Genetics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Ürotelyal karsinom, miRNA, mikroarray, Karsinoma, Mesane neoplazmları, Mikro RNA, Mikrodizilim analizi, Neoplazmlar, urothelial carcinoma, miRNA, microarray, Carcinoma, Urinary bladder neoplasms, Micro RNA, Microarray analysis, Neoplasms
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Mesane kanseri gelişmiş ülkelerde genitoüriner sistemde 2. Sıklıkta görülen kanserdir. Ürotelyal karsinom mesane kanserinin en sık (% 90) görülen hitolojik türüdür. Bir çok güncel tedavi yaklaşımına rağmen ileri evre mesane kanserinde 5 yıllık sağ kalım % 20-40 kadardır. Günümüzde miRNA'ların ürotelyal karsinom patogenezindeki rolleri ve potansiyel terapotik etkileri araştırılmaya devam etmektedir.Çalışmamızda 17 ürotelyal karsinom örneği ve 6 normal mesane dokusu miRNA ekspresyon profilleri açısından karşılaştırılmıştır. T-test sonrası mir-143 (27 kat ?), mir-145 (16 kat ?), mir-125b (11 kat ?), mir-99a (11 kat ?), mir-133b (10 kat ?), mir-100 (6 kat ?), mir-497 (4.9 kat ?), mir-139-5p (3.7 kat ?), mir-18a (3.1 kat ?) ürotelyal karsinomda normal ürotelyuma göre farklı eksprese olduğu belirlenmiştir (p<0.01). Farklı eksprese olan miRNA'ların hedef genleri internet tabanlı biyoinformatik programlarla değerlendirilmiştir. Derece ve evreye göre ürotelyal karsinom dokuları karşılaşılaştırıldığında mir-10a, mir-34a, mir-141 ve mir-210'un derece ve evre arttığında azalan ekspresyon paternleri olduğu belirlenmiştir (p<0.05). Özellikle bu miRNA'lar ürotelyal karsinom prognozunu tahmin etmede kullanılabilirler. Farklı eksprese olan miRNA'larla hiyerarşik kümeleme analizi yaptığımızda, tümör örnekleri patolojik derece ve evrelerine göre ayrılabilmiştir. Sonuç olarak ürotelyal karsinomda mikroRNA ekspresyon patternini belirlemede mikroarray yöntemi etkin bir yöntemdir. Ürotelyal karsinomda mikroRNA'ların normal ürotelyoma göre farklı eksprese olmalarından dolayı ürotelial karsinom patogenezinde önemli rolleri olabilir. Özellkile belirgin şekilde azalan miRNA'lar tümörsüpresör miRNA'lar olabilirler. MiRNA'ların ürotelyal karsinom yolağındaki net rollerinin ortaya konulması için ayrıntılı fonksiyonel çalışmalar yapılması gerekmektedir.
Özet (Çeviri)
Bladder cancer is the second malignancy of genitourinary system in developed countries. Urothelial carcinoma is the most frequent (%90) histological type of bladder cancer. Although several treatment options, 5 year survival is nearly %20-40 in the advanced stage bladder cancer. Nowadays microRNAs? functions in the pathogenesis of urothelial carcinoma and therapeutic effects have been investigated. In our study microRNA expression profiles of 17 urothelial carcinomas and 6 normal bladder tissues were compared. After t-test mir-143 (27 fold ?), mir-145 (16 fold ?), mir-125b (11 fold ?), mir-99a (11 fold ?), mir-133b (10 fold ?), mir-100 (6 fold ?), mir-497 (4.9 fold ?), mir-139-5p (3.7 fold ?) and mir-18a (3.1 fold ?) were determined that differently expressed in urothelial carcinoma than normal urothelium. Target genes of differently expressed miRNA were evaluated by web based bioinformatic programmes. According to grade and stage urothelial carcinoma samples were compared and determined that mir-10a, mir-34a, mir-141, mir-210 had decreased expression patterns if stage and grade increased (p<0.05). Especially these miRNAs might be use to predict prognosis of urothelial carcinoma. When we perform hiyerarshic clustering analisis with differently expressed miRNAs, tumor samples could be distinguished according to grade and stage. In conclusion, microarray is efficient method for determining expression pattern of miRNAs in urothelial carcinoma. MiRNAs are differently expressed in urothelial carcinoma than normal urothelium so, they might be have very important roles in the pathogenesis of urothelial carcinoma. Especially distinctly decreased miRNAs might be tumorsupresor miRNAs. Detailed functional studies are necessary to identify real roles of miRNAs in urothelial carcinoma pathway.
Benzer Tezler
- Effect of doxorubicin and microrna-140-3p on pd-L1 expression in colon cancer
Kolon kanserinde doxorubıcın ve mıcrorna-140-3p'nin pd-L1 ifadesine olan etkisi
NOEL MOPOUGUINI NABA
Doktora
İngilizce
2020
Allerji ve İmmünolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
Assoc. Prof. Dr. AYÇA SAYI YAZGAN
- Yüksek riskli kasa invaze olmayan mesane kanserlerinde intravezikal immunoterapi sonrası nüks izlenmeyen olgularda mikro-RNA ekspresyonları
Micro-RNA expressions in cases with high grade non-muscle-invasive bladder cancer which don?t relapse following intravesical immunotherapy
FURKAN DURSUN
- Mesane kanserinde miR-182-5p ekspresyon düzeyinin araştırılması
Investigation of miR-182-5p expression levels in bladder cancer
İHSAN DÖNMEZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
BiyokimyaMersin ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LÜLÜFER TAMER
- Olası bir RNA bağlayıcı protein olan coiled-coil domain containing protein 124 (CCDC 124)'ün etkileştiği RNA hedeflerinin belirlenmesi ve insan kanser doku örneklerinde ifade seviyelerinin incelenmesi
Identifying the RNA targets of coiled-coil domain contaning protein 124 (CCDC 124) and it's expression level in human cancer tissues
ÖZGE ARSLAN
Doktora
Türkçe
2021
BiyolojiGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UYGAR HALİS TAZEBAY
- Kas invazyonu yapmayan PTA ve PT1 mesane kanserlerinde immünohistokimyasal yöntemlerle moleküler sınıflama ve bu sınıflamanın klinikopatolojik parametreler ile ilişkisi
Molecular classification in non-invasive (PTA and PT1) bladder carcinomas by immunohistochemical methods and it's relationship with clinicopathologic parametetres
TUBA OĞUZSOY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
PatolojiMarmara ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DENİZ FİLİNTE