Türk toplumunda küçük hücreli olmayan akciğer kanserli hastalarda, epidermal growth faktör reseptör genindeki en sık mutasyonların araştırılması, mRNA ekspresyon ve protein düzeyinin belirlenmesi
Investigation of the most common mutations in the Epidermal Growth Factor Receptor Gene, determination the level of mRNA and protein expression in Non-Small Cell Lung Cancer Patients in Turkish Society
- Tez No: 247166
- Danışmanlar: PROF. DR. YUSUF ÖZKUL
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Genetik, Onkoloji, Genetics, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Akciğer neoplazmları, Epidermal büyüme faktörü, Genler, Karsinoma-küçük hücreli olmayan-akciğer, Mutasyon, RNA-haberci, Türk toplumu, Lung neoplasms, Epidermal growth factor, Genes, Carcinoma-non small cell-lung, Mutation, RNA-messenger, Turkish society
- Yıl: 2010
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Toplumlar arasında farklı oranlarda EGFR mutasyonları, EGFR amplifikasyonları ve EGFR protein ekspresyonları görülmesi ve bunların EGFR tirozin kinaz inhibitörlerine cevapta etkili olması nedeniyle bu çalışmada Türk toplumunda EGFR gen mutasyonlarının sıklığı, EGFR mRNA ve protein ekspresyon düzeyinin araştırılması planlandı.Gereç ve Yöntem: Çalışma Küçük Hücreli Olmayan Akciğer Kanseri nedeniyle opere edilen 34 hasta ile yapıldı. Cerrahi rezeksiyonla çıkartılan akciğer dokusunun, kanserli ve kanserli olmayan kısımlarından örnek alınarak RNA ve DNA ları elde edildi. EGFR geninde en sık görülen mutasyonları araştırmak için; exon 19 sekanslandı, exon 21 deki L858R mutasyonunu tespit etmek için mutasyona spesifik primer kullanılarak PZR yapıldı ve ürünler agoroz jelde koşturuldu. Hastaların EGFR mRNA expresyon düzeyi K-RT-PZR ile ölçüldü. Hastaların parafinli dokularından alınan kesitlerde immunohistokimsayal yöntemle EGFR protein düzeyi belirlendi.Bulgular: Hastaların hiçbirinde EGFR geninde exon 19 veya L858R mutasyonları tespit edilemedi. İncelenen 34 olgunun 16 (%47) sında EGFR geni mRNA ekspresyon ve 15 (%44) inde ise EGFR protein ekspresyon artışı belirlendi. İstatistik sonuçlarına göre, EGFR geninin mRNA ve protein ekspresyonundaki artışla cinsiyet, yaş, sigara, histopataloji ve patolojik evre paremetreleri arasında anlamlı bir ilişki tespit edilemedi.Sonuç: Bu çalışmada Türk toplumunda EGFR geninin exon 19 ve L858R mutasyonlarının çok nadir, EGFR protein expresyonunun literatürle uyumlu, EGFR mRNA ekspresyonunun literatüre göre belirgin şekilde artmış olduğu tespit edildi. Türk toplumunda EGFR tirozin kinaz inhibitörlerine cevabı belirlemek için EGFR geninin tamamının mutasyonlar açısından araştırılması ve mRNA ekspresyonundaki farklanmaları aydınlatacak yeni çalışmaların gerekli olduğunu kanısındayız
Özet (Çeviri)
Aim: In this study we are planning to investigate the frequency of EGFR gene mutations, the level of EGFR mRNA and protein expression in Turkish population because of indicating substantial differences in the frequency of EGFR mutations, EGFR amplification and EGFR protein expression between populations and the effect of these parameters for response to EGFR tyrosine kinase inhibitors.Materials and Methods: The study was made in 34 patients with non small cell lung cancers. The RNA and DNA were eluted from the normal and tumor portion of the lung tissue that rejected with surgery. For researching the common EGFR gene mutations; exon 19 was sequenced, for detecting the L858R mutation in exon 21 of the EGFR gene PCR was performed with mutation specific primers and the products were electrophoresed. EGFR mRNA expression was measured by quantitative reverse transcription PCR. The EGFR protein levels were detected with immunohistochemistry methods from the sections of the patients paraffin blocks.Results: In the patients, there was no exon 19 or L858R mutations in EGFR gene detected. Overexpression of EGFR gene mRNA was identified in 16 of 34 (%47) patients and overexpression of EGFR protein was detected in 15 (%44) patients. Statistical analysis failed to show correlation between gender, age, smoking, histopathology, pathological stage and overexpression of EGFR mRNA and protein.Conclusion: In this research determinated that, in Turkish population EGFR gene exon 19 and L858R mutations were rare, EGFR protein expression was compatible and EGFR mRNA expression was markedly high according to literature. We are thinking the necessity of the new studies that identifying the changes in the EGFR mRNA expression and researching the whole EGFR gene for mutations to determining the response to EGFR tyrosine kinase inhibitors in Turkish population.
Benzer Tezler
- Küçük hücreli dışı akciğer kanseri nedeniyle anatomik rezeksiyon yapılan hastalarda akciğer yaşının postoperatif morbidite ve prognoz üzerine etkisinin değerlendirilmesi
Evaluation of the effect of lung age on postoperative morbidity and prognosis in anatomical resection studies due to lung calcium lung cancer
TUBA APAYDIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
Göğüs Kalp ve Damar CerrahisiOndokuz Mayıs ÜniversitesiGöğüs Cerrahisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET BAŞOĞLU
- Mobil telefon kullanımına bağlı oluşan 900-1800 mhz radyo frekans dalgalarının meydana getirdiği elektromanyetik alanın iliak kanat kemik mineral yoğunluğuna etkisi
The effect of electromagnetic fields on bone mineral density of iliac bone produced by 900-1800 mhz radio frequency waves dependent on cellular phone usage
BEŞİR ANDAÇ AKSOY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2006
Ortopedi ve TravmatolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiOrtopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. NEVRES HÜRRİYET AYDOĞAN
- Prostat adenokarsinomlarında psa değerlerinin gleason skor ve klinik evre ile ilişkisi
The relation between psa and gleason score and clinical phase in prostate adenocarsinoma
HACI HASAN ESEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2005
PatolojiSelçuk ÜniversitesiPatoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. MUSTAFA CİHAT AVUNDUK
- Manisa yöresinde demir eksikliği anemi prevalansı ve demir eksikliği anemisinde tarama testi olarak rutin hemogram, RDW ve ferritinin kullanımı
The prevalance of iron deficieny anemia in Manisa and using of hemogram, RDW and ferritin for searcing of iron deficiency anemia
VİLDAN ÜRK TAŞYENEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2006
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıCelal Bayar ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ALİ ONAĞ
- Akciğer kanserinde paraoksonaz 192 ve 55 gen polimorfizmleri ve serum paraoksonaz aktivitesinin incelenmesi
Investigation of assocation between paraoxonase-1 192/55 polymorphisms and serum paraoxanase activity in lung cancer
PINAR AKSOY