Geri Dön

Molecular genetic analysis of benign epilepsy syndromes

Selim epilepsi sendromlarının moleküler genetik analizi

PDF İndir

  1. Tez No: 246257
  2. Yazar: MELEK ASLI KAYSERİLİ
  3. Danışmanlar: PROF. HANDE ÇAĞLAYAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Epilepsi, Gen amplifikasyonu, Polimorfizm-genetik, Potasyum, Sodyum, Epilepsy, Gene amplification, Polymorphism-genetic, Potassium, Sodium
  7. Yıl: 2009
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

GEFS+ ve BFIS selim epilepsi sendromlarındandır. GEFS+ ateşli nöbetlerin 6 yaş sonrasında da devam ettiği ve afebril nöbetlerin de eşlik ettiği çeşitli fenotiplerden oluşur. Genotipik olarak GEFS+ iyon kanal genlerinden SCN1A, SCN2A, SCN1B, GABRG2 ve GABRD ile ilişkilendirilmiştir. Diğer bir selim idyopatik epilepsi olan BFIS üç aydan sonra ortaya çıkar ve genellikle bir yaşın üzerinde kaybolur. Bu fenotip diğer selim sendromlardan BFNC ve BFNIS fenotiplerinden sadece hastalık başlangıç yaşındaki fark ile ayrılır. Bu sendromlar genellikle otozomal baskın geçiş gösterirler. Epilepsi patojenezinin kompleks doğasını açıklayabilmek için genetik temelin incelenmesi gereklidir. Bu çalışma kapsamında bir GEFS+ hastasında aday genlerden SCN1B ve SCN2A'nın moleküler genetik analizi ve bir BFIS hastasında aday genlerden SCN1B, KCNQ2 ve SCN2A'nın moleküler genetik analizi yapılmıştır. GEFS+ hastasında SCN2A geninde memelilerde evrimsel olarak korunmuş bir amino asitin (Ser1536Asn) değişimine yol açan bir mutasyon bulunmuştur. BFIS hastasında ise SCN1B geninde transkripsiyonel olarak sessiz olan ancak aile hastalık ile birlikte geçiş gösteren c492T>C transisyonuna rastlanmıştır. Primatlarda korunmuş olan bu nükleotidin Türk toplumunda polimorfik olmadığı gösterilmiştir. Kırpılma bölgelerini tanımlayan biyoinformatik gereçler, bu değişikliğin bir enhancer bağlanma bölgesi yarattığını ve bir susturucu motifi ortadan kaldırdığını göstermektedir. Ancak, hasta kan hücrelerinde mRNA incelendiğinde kırpılma paterninde bir fark gözlenmemiştir. SCN1B geninde gözlenen bu yeni değişikliğin kullanılan yöntemler ile her ne kadar BFIS fenotipinden sorumlu olduğu kanıtlanamamış olsada, bu değişiklik ileride fonksiyonel çalışmalarla incelenmeyi, BFIS ile bağlantı kurulmuş olan 19q bölgesinde bulunan ilk mutasyon olma özelliğini taşıyabileceği için, hak etmektedir.

Özet (Çeviri)

Generalized Epilepsy with Febrile Seizures Plus (GEFS+) and Benign Familial Infantile Seizures (BFIS) are some of the benign epilepsy syndromes. GEFS+ is a collection of phenotypes that show febrile seizures beyond the age of six associated with afebrile seizure types. Genotypically, GEFS+ was associated with several ion channel genes such as SCN1A, SCN2A, SCN1B, GABRG2 and GABRD. BFIS is another benign type of idiopathic epilepsy which typically appears on the third month and retracts after the first year. The phenotype overlaps with two other benign syndromes BFNC and BFNIS that differs only in the age of onset. These syndromes are generally inherited in a autosomal dominant manner. To understand the complex nature of epilepsy pathogenesis, the syndromes must be investigated. In this study, the mutational analysis of the two of the candidate genes, SCN1B and SCN2A, was performed on a GEFS+ patient. And the mutational analysis of the candidate genes, SCN1B, KCNQ2 and SCN2A, was performed on the index patient of a multiplex BFIS family. In the GEFS+ patient, a missense mutation was found in the SCN2A gene causing a Ser1536Asn substitution which is evolutionarily conserved in mammals. In the index BFIS, a translationally silent variant c492T>C in the SCN1B gene which co-segregated with the disease in the family was found. This nucleotide change was conserved in the primates and was not polymorphic in the Turkish population. According to the splice site prediction tools, it created a binding site for an enhancer protein and distrupts a silencer motif. However, there was no change in splicing pattern in the mRNA examined from whole blood cells. Although the novel transition in the SCN1B gene could not conclusively be shown to have a causative role in the BFIS phenotype, it deserves further investigation through functional studies since it could be the first mutation in the 19q locus linked to BFIS.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    409284

    Identification of novel genes involved in the etiology of benign neonatal/infantile epilepsy syndromes and genetic epilepsy with febrile seizures plus (GEFS+)

    Selim yenidoğan/bebeklik epilepsi sendromları ve ateşli nöbetli genetik epilepsi etiyolojisinde yer alan yeni genlerin belirlenmesi

    SUNAY USLUER

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Moleküler TıpBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERVER HANDE ÇAĞLAYAN

  2. Tez No

    731214

    Epilepsi tanılı çocuk hastalarda genetik etiyolojinin hedeflenmiş yeni nesil dizi analizi verilerine dayanarak retrospektif olarak araştırılması

    Retrospective investigation of genetic etiology in pediatric epilepsy patients based on targeted next generation sequence analysis datas

    ÖZDEN ÖZTÜRK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİnönü Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İBRAHİM TEKEDERELİ

  3. Tez No

    342051

    Nöroblastik tümörlerdeki bölgesel DNA kopya sayısı değişikliklerinin ve allelik dengesizliklerin tanımlanması

    Analysis of allelic imbalances and local DNA copy number changes in neuroblastic tumors

    SAİT TÜMER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. OĞUZ ALTUNGÖZ

  4. Tez No

    728662

    Moleküler etiyolojisi aydınlatılamamış cinsiyet gelişim bozukluğu hastalarında mikroarray yöntemi ile kopya sayısı değişikliklerinin saptanması ve klinik varyasyonlarla ilişkilendirilmesi

    Detection of copy number variations by microarray in disorders of sex development of unexplained molecular etiology and association with clinical findings

    MURAT ÇAĞLAR KARATAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SAMİM ÖZEN

  5. Tez No

    745404

    Alport sendromu ile ilişkili genlere ait varyasyonların yeni nesil dizileme (YND) metodu ile incelenmesi

    Investigation of genes variations associated with alport syndrome via the next generation sequencing (NGS) method

    CÜNEYD YAVAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Tıbbi BiyolojiYıldız Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEHİR ÖZDEMİR ÖZGENTÜRK

Geri Dön