Domateste demir kloruzuna toleransın haritalanmasında kullanılacak rekombinant saf hatlarda DNA izolasyonu ve AFLP optimizasyonu
DNA isolation and AFLP optimization in recombinant inbred lines used to map iron chlorosis tolerance in tomato
- Tez No: 233977
- Danışmanlar: DOÇ. DR. SUAT ŞENSOY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: AFLP, Domates, DNA izolasyonu, Kloroz, Rekombinant saf hat, Demir, AFLP, Chlorosis, DNA isolation, Recombinant inbred lines, Tomatoes, Iron, Tomato
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez çalışmasında demir eksikliğine toleransları belirlenmiş olan, duyarlı ve tolerant ebeveynlerden elde edilmiş resiprokal saf hatların, AFLP yöntemi ağırlıkta olmak üzere, bağlantı haritaları oluşturulmadan önce DNA izolasyonu yapılarak uygun PZR reaksiyon şartları ve gümüş nitrat tekniğiyle etkin bir şekilde görüntülenebilme etkinliklerini belirlemek amaçlanmıştır. Bu tezden elde edilecek ön bilgiler ışığında domateste rekombinant saf hatlar kullanarak Fe eksikliğine toleransta etkili QTL'leri içeren bir genetik harita ortaya çıkarılmasının ön adımı atılmış olacaktır. Domateste Roza x 227/1 ve 227/1 x Roza resiprokal melezlemelerinden elde edilen 224 adet rekombinant saf hattan (107 A hattı ve 117 B hattı) DNA izolasyonu, CTAB'lı ve ticari bir kitin prosedürüne göre olmak üzere iki farklı yöntemle yapılmış ve ebeveynler kullanılarak moleküler AFLP ön çalışmaları gerçekleştirilmiştir.Çalışmada denenen 64 primer çiftinden 57 tane primer çifti olumlu sonuç vermiştir. Sonuç veren 57 primer çiftinden 1535 toplam bant ve yaklaşık 126 polimorfik bant elde edilmiştir. Denenen primer kombinasyonlarının toplam okunabilir bant sayıları genelde beklenen düzeyde çıkmıştır. Ebeveyn hatlar arasındaki polimorfizm (%8,27) tür içi melezleme olması nedeniyle, beklediğimiz düzeyden az fakat yeterli düzeyde çıkmıştır.
Özet (Çeviri)
This thesis aimed to isolate DNA and to optimize PCR reaction -basically with AFLP- and silver nitrate visualization in recombinant inbred lines obtained from tolerant and intolerant parents which will be used to molecularly map quantitative trait locus related to iron chlorosis tolerance in tomato. The information obtained from this thesis will be the first step used to molecularly map quantitative trait locus related to iron chlorosis tolerance in tomato. DNAs of 224 recombinant inbred lines (107 A lines and 117 B lines) from reciprocal crosses from (A line: Roza x 227/1 and B line: 227/1 x Roza) were isolated with two methods- one with CTAB and one with a commercial kit- and pre-AFLP works were done by using parents.Of the tried 64 primer combinations, 57 gave encouraging results. Total and polymorphic band numbers of these 57 primer combinations were 1535 and 126, respectively. Total band numbers from the primer combinations were a predictive level. Polymorphism (8.27 %) between parents was low, but adequate when considering intra-specific cross.
Benzer Tezler
- Domateste dayanıklı ve duyarlı genotiplerin melezlenmesinden elde edilen saf hatlarda demir (Fe) eksikliğine tolerans
Iron (Fe) deficiency tolerance in tomato recombinant inbreed lines obtained from resistant and sensitive genotypes
MAHMUT BAYRAM
- Domateste demir eksikliğine dayanıklılığın morfolojik, fizyolojik ve genetiksel açıdan incelenmesi
Morphological, physiological and genetic studies in tomato under iron (Fe) deficiency conditions
HAYRİYE YILDIZ DAŞGAN
Doktora
Türkçe
1999
ZiraatÇukurova ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KAZIM ABAK
PROF. DR. İSMAİL ÇAKMAK
- Organik ve geleneksel tarım yöntemleri ile yetiştirilen bazı sebzelerin kimi kalite kriterleri bakımından karşılaştırılması
Comparisons of organically and conventionally grown some vegetable crops in terms of quality parameters
HALİL DEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ERSİN POLAT
- Sebze tohumlarında hızlı yaşlandırma testinin kullanımına yönelik uygun sıcaklık ve süre kombinasyonlarının belirlenmesi
Determination of appropriate combination of temperature and duration for accelerated ageing test in vegetable seeds
YILDIRIM ŞAMİL ÖZDEN
- Sera koşullarında hümik asit katkılı katı ortam kültürüyle yetiştirilen domatesin gelişim, verim ve meyve özelliklerinin belirlenmesi
Determination of yield and fruit characteristics of tomato crop grown in humic acids added aggregate culture at greenhouse conditions
EVRAN DOĞAN