Staphylococcus aureus'larda metisilin direncinin tespitinde oksasilin-sefoksitin disk difüzyon, oksasilin agar tarama, lateks aglütinasyon, mecA gen tespiti ve bir otomatize sistemin karşılaştırılması
Comparison of oxascillin-cefoxitin disc diffusion, oxacillin agar screening, latex aglutination, mecA gene detection and an automatized system for detection of methicillin resistance in Staphylococcus aureus
- Tez No: 224580
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET SAİT TEKEREKOĞLU
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Microbiology, Infectious Diseases and Clinical Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Aglütinasyon testleri, Metisilin, Oksasilin, Sefoksitin, Staphylococcus aureus, Özgüllük, Agglutination tests, Methicillin, Oxacillin, Cefoxitin, Staphylococcus aureus, Specificity
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İnönü Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Bu çalışmada: Turgut Özal Tıp Merkezi rutin mikrobiyoloji laboratuvarında MRSA saptanmasında kullanılan fenotipik yöntemlerle MRSA lateks aglütinasyon testi ve bir otomatize sistemin karşılaştırılması amaçlandı.Gereç ve Yöntem: Çalışmaya alınan 214 izolatın koloni morfolojisi, Gram boyama, katalaz, mannitol fermantasyonu ve koagülaz testleriyle S. aureus oldukları doğrulandı. MRSA'nın tanımlanmasında PZR ile mecA genin tespiti referans alındı. Daha sonra, bütün suşlara oksasilin ve sefoksitin disk difüzyon, oksasilin agar tarama, MRSA lateks aglütinasyon testi ve otomatize sistem uygulandı. Yöntemlerin duyarlılık ve özgüllüğü değerlendirildi.Bulgular: Çalışmaya alınan suşların %40'ı mecA pozitifliğine göre MRSA olarak tanımlandı. Uygulanan oksasilin disk difüzyon, sefoksitin disk difüzyon, oksasilin agar tarama, MRSA lateks aglütinasyon testi ve otomatize sistemin MRSA tespitindeki duyarlılıkları sırasıyla %95.1, %96.3, %95.1, %96.3 ve %98.7; özgüllükleri %95.3, %98.4, %98.4, %98.4 ve %97.6 olarak tespit edildi. Üç suş, mecA pozitif ve oksasilin MİK'i >2 µg/ml olup; disk difüzyon, agar tarama ve lateks aglütinasyon yöntemleriyle metisiline duyarlı bulundu. Dört suş ise mecA pozitif olduğu halde, bütün testlerde metisiline duyarlı olup, oksasilin MİK'leri <2 µg/ml olarak saptandı ve bu suşlar oksasiline duyarlı MRSA'lar (OS-MRSA) olarak değerlendirildi.Sonuç: Otomatize sistem MRSA suşlarının tespitinde en yüksek duyarlılık değerine sahipken; lateks aglütinasyon ve sefoksitin disk difüzyon testleri aynı duyarlılığa sahipti. Otomatize sistem ve lateks aglütinasyon testinin hızlı sonuç vermesi diğer fenotipik yöntemlerden daha iyi olduklarını düşündürmektedir. Ancak maliyet etkinlik göz önünde bulundurulduğunda sefoksitin disk difüzyon testi rutin laboratuvarlarda kullanım açısından daha uygun görünmektedir. Ayrıca, OS-MRSA suşlarının tespiti için mecA varlığı ve oksasilin MİK değerlerinin eşzamanlı olarak araştırılması gereklidir.
Özet (Çeviri)
Purpose: In this study, we aimed to compare the phenotypic methods that are employed at the routine microbiology laboratory of Turgut Ozal Medical Center in determining methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), MRSA latex agglutination test, and an automatized system.Materials and Methods: The of 214 isolates that were included in the study, were verified as Staphylococcus aureus using colony morphology, Gram staining, catalase, mannitol fermentation, and coagulase tests. Determination of mecA gen by PCR was referred to define MRSA. Later on, oxacillin and cefoxitin disc diffusion, oxacillin agar screening, MRSA latex agglutination test, and the automatized system were applied to all species. Sensitivity and specificity of the methods were evaluated.Results: Of the species included in the study, 40% were determined as MRSA since they were mecA positive. The sensitivity of oxacillin disc diffusion, cefoxitin disc diffusion, oxacillin agar screening, MRSA latex agglutination test, and the automatized system in determining MRSA were 95.1%, 96.3%, 95.1%, 96.3% and 98.7%, respectively; the specifity of oxacillin disc diffusion, cefoxitin disc diffusion, oxacillin agar screening, MRSA latex agglutination test, and the automatized system in determining MRSA were 95.3%, 98.4%, 98.4%, 98.4% ve 97.6%, respectively. Three species were mecA positive and their oxacillin MIC were greater than 2 µg/ml; and they were determined as sensitive to methicillin by disc diffusion, agar screening and latex agglutination. Another 4 species were determined as sensitive to methicillin by all tests, though they were mecA positive. The MIC values to oxacillin of these 4 species were lower than 2 µg/ml and these species were determined as oxacillin- sensitive MRSAs (OS-MRSA).Conclusion: The automatized system had the highest sensitivity values in determining the MRSA species. Also, cefoxitin disc diffusion and latex agglutination tests showed the same sensitivity values. The rapid results achieved by automatized system and latex agglutination tests suggests us that they are superior to the other phenotypic methods. Nevertheless, cefoxitin disc diffusion test seems to be more appropriate to perform at routine laboratories in terms of cost and efficiency. Furthermore, presence of mecA and oxacillin MIC values should be performed simultaneously to determine OS-MRSA species.
Benzer Tezler
- Metisiline Dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) suşlarında MecA geninin tespitinde Evigene Testi,Latex Aglütinasyon Testi ve PZR Yönteminin karşılaştırılması
Tha comparison of Evigene Test,Latex Agglutination Test and PCR Metods for detecting of mecA Gene in Methicilline Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains
EMİN ÖZEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ONUR KAYA
- Metisiline dirençli staphylococcus aureus'un polimeraz zincir reaksiyonu ile hızlı tanısı.
Rapid identification with polymerase chain reaction of methicillin resistant staphylococcus aureus.
MELTEM ÇAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. MELAHAT KURTULUŞ ÜLKÜER
- Metisilin dirençli Staphlococcus aureus suşlarında mupirosin direncinin fenotipik ve genotipik olarak araştırılması
Genotipic and fenotipic analysis of methicillin resistant staphylococcus aureus expressing mupirocin resistance
MEHMET BARIŞ KURAL
Doktora
Türkçe
2005
MikrobiyolojiEskişehir Osmangazi ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. TERCAN US
- Staphylococcus aureus izolatlarında metisilin direncinin belirlenmesinde sefoksitin disk difüzyon ve phoenix otomatize sisteminin meca/mecc pzr yöntemi ile karşılaştırılması ve pvl gen varlığının araştırılması
Comparison of cefoxitin disc diffusion, phoenix automated system and meca/mecc pcr for detection of methicillin resistance in s.aureus isolates and investigation the presence of pvl genes.
NESLİHAN ARICI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BANU BAYRAKTAR
- Irak'ta klinik ve çevresel metisiline dirençli staph aureus'larda bazı biyofilm genlerinin bakteriyolojik ve moleküler incelenmesi
Bacteriological and molecular study of some biofilm genes in clinical and environmental methicillin resistant staphylococcus aureus in Iraq
ZINA MURSHD KADIM ABDULRASOL