Hematolojik maligniteli hastalarda DNA tamir genlerindeki (XRCC1 ve XPD) polimorfizmlerin araştırılması
DNA repair genes (XRCC1 and XPD)polimorphisms research in hematological malignancies
- Tez No: 222998
- Danışmanlar: PROF. DR. FİLİZ ÖZDEMİR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Biyoloji, Moleküler Tıp, Genetics, Biology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: DNA Tamiri, XPD geni, XRCC1 geni, DNA, PCR-RFLP, DNA repair, XPD gene, XRCC1 gene, DNA, PCR-RFLP
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Hematolojik maligniteli hastalarda DNA tamir genlerindeki (XRCC1 ve XPD) polimorfizmlerin araştırılmasıİç ve dış faktörler bütün organizmaların DNA'larında hasarlara neden olur. DNA tamir mekanizmasının amacı genomun bütünlüğünü korumaktır. DNA tamir genlerinde meydana gelen polimorfizmler DNA tamir yeteneğini etkileyerek hematolojik malignitelerde risk faktörü oluşturmaktadır. X-ray repair cross-complementing group 1 (XRCC1) ve Xeroderma pigmentosum complementetion group D (XPD), DNA tamir genleri; baz kesip-çıkarma tamir (BER) mekanizması ve nükleotid-kesip çıkarma tamir (NER) mekanizmasında görev alır. XRCC1 geni kodon 399 ve XPD geni kodon 751 polimorfik bölgelerindeki polimorfizmler DNA tamir kapasitesini etkilemektedir.Bu çalışmada, 100 hematolojik maligniteli (HM) hasta (36 akut myelositer lösemi [AML], 64 lenfoid malignite [LM]) ve 100 sağlıklı kontrolde X-ray repair cross-complementing group 1 (XRCC1) geni kodon 399 ve Xeroderma pigmentosum complementetion group D (XPD) geni kodon 751 polimorfizmleri polimeraz zincir reaksiyonu-enzim kesimi (PCR-RFLP) yöntemiyle araştırılmış, genotip ve allel dağılımları hasta ve kontrol gruplarında karşılaştırılmıştır.HM'li hastaların 46'sı kadın, 54'ü erkek olup ortalama yaş 46 (16-82) dır. XPD-751Gln variantı, HM'ler ve sağlıklı kontroller arasındaki genotip ve allel frekansları yaş ve cinsiyete göre düzenlenerek karşılaştırıldığında, koruyucu olduğu bildirilen Gln/Gln genotipinin AML'de anlamlı olarak azaldığı (p=0.042), allel frekansları arasında ise bir ilişki bulunmadığı saptanmıştır (p=0.054). XRCC1-399'da ise Gln/Gln genotipinin AML (p=0.014) ve tüm HM'lerde (p=0.033) anlamlı olarak azaldığı ve Gln allelinin AML'de daha az oranda bulunduğu saptanmıştır (p=0.046). Her iki gene ait polimorfizmlerin dağılımında, yaş ve cinsiyete göre istatistiksel bir anlam saptanmamıştır. Erken relaps olan lösemilerde, XPD 751 Lys/Lys genotipinin istatistiksi olarak daha yüksek oranda olduğu görülmüştür (p=0.042). Her iki gen birlikte değerlendirildiğinde, Gln/Gln+Lys/Gln haplotip sıklığının azalması ile HM'ler arasında bir ilişkinin varlığı saptanmıştır (p= 0.048).Bu çalışma ile, AML'de XRCC1 kodon 399 ve XPD kodon 751 polimorfizmlerinde koruyucu olduğu bildirilen Gln/Gln genotipi ve Gln allelinin azalması ve akut lösemilerde Lys/Lys genotip artışının erken relaps ile ilişkili olduğu ortaya konulmuştur.
Özet (Çeviri)
DNA repair genes (XRCC1 and XPD) polimorphisms research in hematological malignanciesEndogenous and exogenous factors cause DNA damage in all organisms. The aim of the DNA repair mechanism is to protect integrity of genome. The polymorphisms that occur in DNA repair genes have risk factors in hematological malignancies by affecting ability of DNA repair. X-ray repair cross-complementing group D (XRCC1) and Xeroderma pigmentosum complementation group D (XPD); DNA repair genes have an important role in base excision repair (BER) and nucleotid excision repair (NER) mechanisms. The polymorphisms in polymorphic areas of the XRCC1 gene codon 399 and XPD gene codon 751 affect DNA repair capacity.In this study, codon 399 in the XRCC1 gene and codon 751 in the XPD gene polimorphisms were investigated in 100 hematological malignancies patients (HM) (36 acute myeloid leukemia [AML], 64 lymphoid [LM]) and 100 healthy control groups with polymerase chain reaction?restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. The distribution of genotype and allele in patient and control groups were compared.The median age of hematological malignancy patients including female (n= 46) and male (n=54) were 46 years (range 16-82). In comparison of genotype and allele frequency between hematological malignancies and healthy controls that adjusted for gender and age, XPD-751 Gln variant showed that Gln/Gln genotype which have a protective effect in acute myeloid leukemia (AML) significantly is decreased (p= 0.042). However, no relationship between allele frequencies determined (p=0.054). Moreover, Gln/Gln genotype in AML (p= 0.014) and all HM showed a significant decrease in XRCC1-399 (p= 0.033). We determined that AML have a less Gln allele (p=0.046). The distribution of polymorphisms in both genes as age and gender are not meaning as statistically. XPD-751 Lys/Lys genotype is increased in early relapse leukemia patients. When both genes has evaluated, a relationship between HMs by decreasing of Gln/Gln+Lys/Gln haplotype frequency is determined (p=0.048).In this study, reduced Gln allele and Gln/Gln genotype which have protective effect in the XRCC1 gene codon 399 and the XPD gene codon 751 polymorphisms in AML and increased Lys/Lys genotype in acute leukemia may be associated with early relapse.
Benzer Tezler
- Down sendromunda HLA-DQA1 allel polimorfizmi ile DR53 homozigotluğunun araştırılması
The Role of DR53 homozygosity in Down syndrome evaluated by HLA-DQA1 allele polymorphism
HÜLYA KAYSERİLİ
Doktora
Türkçe
1998
Tıbbi Biyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEMNUNE YÜKSEL-APAK
- Hematolojik maligniteli hastalarda akciğer nokardiyozu araştırılması
Başlık çevirisi yok
RÜÇHAN YAZAN SERTÖZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1998
MikrobiyolojiEge ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. RAMAZAN İNCİ
- Hematolojik maligniteli hastalarda serum CA125 ve ferritin düzeyleri
Başlık çevirisi yok
CEZMİ MERAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2003
HematolojiYüzüncü Yıl Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İMDAT DİLEK
- Hematolojik maligniteli hastalarda febril nötropeni surveyansı
Başlık çevirisi yok
KIVANÇ ŞEREFHANOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2003
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyolojiİnönü ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YASEMİN ERSOY
- Hematolojik maligniteli hastalarda toksoplazmozis aktivasyonunun avidite testi ile araştırılması
Investigation of toksoplazmosis activation by avidity test in patients with hematological malignancy
ERGÜN GÜLEŞCİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2004
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiTrakya ÜniversitesiKlinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. MÜŞERREF TATMAN OTKUN