Bazı organik bileşiklerin kristalografik ve kuantum mekaniksel yöntemlerle yapısal karakterizasyonu
Structural characterization of some organic compounds with crystallographic and quantum mechanical methods
- Tez No: 213429
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞAMİL IŞIK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Bölümü
- Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez çalışmasında adı geçen molekül yapıları, tek kristal X-ışınları kırınım yöntemiyle çözülmüştür. Söz konusu kristallerin kırınım verileri Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Fizik Bölümü, X-ışınları laboratuarında mevcut olan STOE IPDS II difraktometresinden elde edilmiştir. İncelenen, 3-[(5-Methyl-2-benzoxazolinone-3-yl)methyl]-4-ethyl-1H-1,2,4-triazole-5(4H)-thione, (C13H16N4O3S), 4-Allyl-3-[(5-methyl-2-oxo-1,3-benzoxazol-3-yl)methyl]-1H-1,2,4-triazole-5(4H)-thione, (C14H14N4O2S), 3-[(5-methyl-2-benzoxazolinone-3-yl)methyl]-4-phenyl-1H-1,2,4-triazole-5(4H)-thione,(C17H14N4O2S), 3-Phenyl-5-(2-thienyl)-2-pyrazoline-1-thioamide, (C14H13N3S2), 1-Thiocarbamoyl-3,5-di(2-thienyl)-2-pyrazoline, (C12H11N3S3), molekülleri Hacettepe Üniversitesi, Eczacılık Fakültesi, Farmasötik Kimya laboratuarında kristallendirilmişlerdir.Bu tez çalışmasında incelenen, (C13H16N4O3S), (C14H14N4O2S), (C17H14N4O2S), (C14H13N3S2), (C12H11N3S3) kristallerinden elde edilen X-ışını kırınım verileri, direkt yöntemler metodu ile çözülmüş ve model yapılar elde edilmiştir. Çözümü sağlanan kristallere en küçük kareler metodu ve Fourier analizi uygulanarak arıtım işlemleri tamamlanıp yapı analizi sonuçlandırılmıştır.Yapı analizleri tamamlanan kristaller ayrıca kuramsal olarak incelenmiştir. Bu amaçla kuantum mekaniği içinde yer alan yarı deneysel metotlara ait olan AM1 ve PM3 yöntemleri kullanılmıştır. Bu iki yöntemden AM1 yönteminin incelenen kristal yapıları için daha iyi sonuçlar verdiği tespit edilmiş ve hesaplamalar AM1 yöntemiyle yapılmıştır. Kuramsal çalışmalar kapsamında incelenen kristal yapıları için X-ışınları başlangıç geometrisi ve model başlangıç geometrilerinin her ikisi için potansiyel enerji yüzeyi analizleri (PES), moleküler dipol momentleri, elektrostatik eş potansiyel yüzeyleri (EPS) hesaplanmış ve karşılaştırılarak tartışılmıştır.
Özet (Çeviri)
The single crystal X-ray diffraction method is used to solve the molecular structures in this study. The diffraction data of studied crystals are obtained from STOE IPDS II Diffractometer located in the X-ray laboratory of the Department of Physics, Ondokuz Mayıs University. The examined molecules, namely 3-[(5-Methyl-2-benzoxazolinone-3-yl)methyl]-4-ethyl-1H-1,2,4-triazole-5(4H)-thione, (C13H16N4O3S), 4-Allyl-3-[(5-methyl-2-oxo-1,3-benzoxazol-3-yl)methyl]-1H-1,2,4-triazole-5(4H)-thione, (C14H14N4O2S), 3-[(5-methyl-2-benzoxazolinone-3-yl)methyl]-4-phenyl-1H-1,2,4-triazole-5(4H)-thione,(C17H14N4O2S), 3-Phenyl-5-(2-thienyl)-2-pyrazoline-1-thioamide, (C14H13N3S2), 1-Thiocarbamoyl-3,5-di(2-thienyl)-2-pyrazoline, (C12H11N3S3), are crystallized in the Pharmaceutical Chemistry Laboratory of the Faculty of Pharmacy, Hacettepe University.The X-ray diffraction data collected from examination of (C13H16N4O3S), (C14H14N4O2S), (C17H14N4O2S), (C14H13N3S2), (C12H11N3S3) crystals are solved by direct methods and, model structures are obtained. The refinement processes are completed and structural analysis are finalized by applying least square method and Fourier analysis to the solved crystals.The crystals with completed strucrural analysis are also examined theoretically. The AM1 ve PM3 methods belonging to semi-amprical methods of quantum mechanics are used for this purpose. Among these two methods AM1 method gave better results for the examined crystal structures and calculations are done by AM1 method. In the scope of theoretical studies, potential energy surface analysis (PES), molecular dipole moments and electrostatic equipotential surface analysis (EPS) are calculated, compared and discussed for both initial X-ray geometry and initial model geometry of the examined crystal structures.
Benzer Tezler
- Bazı skuarik asit komplekslerinin spektroskopik ve kristalografik yöntemlerle incelenmesi
Spectroscopic and crystallographic investigation of some squaric acid compounds
OKTAY OZAN YILAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
Fizik ve Fizik MühendisliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. HÜMEYRA PAŞAOĞLU
- Crystal and molecular structure etermination of some monomeric, dimeric, trimeric, polymeric metal complexes and organic compounds by x-ray diffarction
X-ışınları kırınımı yöntemi ile bazı monomerik, dimerik, trimerik, polimerik metal kompleksleri ile organik bileşiklerin kristal ve molekül yapı analizi
MUHAMMD NAWAZ TAHİR
Doktora
İngilizce
1997
Fizik ve Fizik MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİNÇER ÜLKÜ
- Bazı metalorganik ve organik bileşiklerin x-ışınları kristal yapı araştırmaları (C21 H15 N6 O21 Sm, C24 H26 Cu2 N2 O4, C11 H12 CINO2)
X-rar structure analysis of some organometallic and organic compounds (C21 H15 N6 O21 Sm, C24 H26 Cu2 N2 O4, C11 H12 CINO2)
CENGİZ ARICI
Yüksek Lisans
Türkçe
1997
Fizik ve Fizik MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİNÇER ÜLKÜ
- Bazı organik ve organo-metalik kristallerin kristal yapılarının tayini
Başlık çevirisi yok
CEM CÜNEYT ERSANLI
Doktora
Türkçe
2004
Fizik ve Fizik MühendisliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF.DR. AHMET ERDÖNMEZ
- MgB2 ve bazı 3-d geçiş element bileşiklerinin moleküler ve manyetik özelliklerinin incelenmesi
Investigation of molecular and magnetic properties of MgB2 and some transition element compounds
YÜKSEL KÖSEOĞLU
Doktora
Türkçe
2003
Fizik ve Fizik MühendisliğiGebze Yüksek Teknoloji EnstitüsüFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BEKİR AKTAŞ