Pseudomonas aeruginosa kökenlerinde kinolon direncinin moleküler olarak saptanması
Use of molecular techniques for the detection of quinolone resistance in pseudomonas aeruginosa
- Tez No: 204226
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MELTEM YALINAY ÇIRAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Microbiology, Molecular Medicine, Infectious Diseases and Clinical Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Kinolonlar, Ofloksasin, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas enfeksiyonları, Quinolones, Ofloxacin, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas infections
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Pseudomonas aeruginosa hastalarda ciddi seyirli enfeksiyonlara yol açan ve antibiyotik direncinin sorun olduğu bir patojendir. Son yıllarda, hem hastane hem de toplum kaynaklı enfeksiyonlardan izole edilen P. aeruginosa'da antimikrobiyallere karşı direnç artış göstermektedir.Bu çalışmanın amacı, P. aeruginosa suşlarında kinolon direncinin konvansiyonel ve moleküler yöntemler kullanılarak saptanmasıdır.Hastanemize gönderilen çeşitli örneklerden izole edilen 93 nonfermentatif bakteri konvansiyonel yöntemlerle tiplendirilmiştir. Tiplendirilen 39 P.aeruginosa suşu çalışmaya dahil edilmiştir. Bu P. aeruginosa suşlarına CLSI önerilerine uygun olarak agar dilüsyon yöntemi ile ofloksasine olan duyarlılıkları araştırılmıştır. P. aeruginosa'da kinolon direncine sebep olduğu düşünülen ve üzerinde en çok çalışılan bölge DNA giraz geninin A altünitesidir. Ofloksasine duyarlı ve dirençli tüm P. aeruginosa suşlarına gyrA gen bölgesinin dizi analizi yapılarak moleküler olarak incelenmiştir.Elde ettiğimiz verilere göre, agar dilüsyon metodu ile ofloksasine duyarlılıkları araştırılan 39 P. aeruginosa suşunun 14'ünde (%35,89) direnç görülürken, orta düzeyde direnç oranı 3 suşta (%7,69) tespit edilmiştir.gyrA geninde yapılan dizi analizinde farklı kodonlarda mutasyonlar saptanmıştır. gyrA gen bölgesinin dizi analizi sonuçları incelendiğinde, 83. kodonda treonin aminosidinin izolösin aminoasidine dönüşümü sonucu oluşan mutasyon yalnız ofloksasine dirençli 5 suşta (%12,82) saptanmıştır. Duyarlı suşlarda da çok sayıda sessiz mutasyon gözlenmiştir.gyrA geninde incelenen diğer kodonlarda da çok sayıda sessiz mutasyonlara rastlanmıştır. Çalıştığımız örneklerde en sık rastlanan sessiz mutasyon 132. kodonda gösterilmiştir. 6 P. aeruginosa (%15,38) suşunda ise hiçbir değişikliğe rastlanmamıştır.P. aeruginosa suşlarında kinolon direncinin gyrA gen bölgesinin moleküler analizi ile değerlendirildiği bilindiği kadarıyla ülkemizde yapılan ilk çalışmadır.P.aeruginosa'ya yüksek direnç görülmesi nedeniyle antimikrobiyal direncin aydınlatılabilmesi için bu gibi çalışmalara ihtiyaç duyulmaktadır. Dirençle ilişkili olabilecek gyrB, parC ve parD gen bölgelerininde araştırılması, direncin moleküler özelliklerinin ortaya konulabilmesi açısından gereklidir.
Özet (Çeviri)
Pseudomonas aeruginosa is responsible for serious infections in critically ill patients. In recent years, increasing antimicrobial resistance in both nosocomial and community acquired P. aeruginosa isolates is alarming.The aim of study was to detect the quinolone resistance of P. aeruginosa strains isolated from various clinical specimens in our hospital, by conventional and molecular metods. Ninety ? three nonfermentative bacterial isolates were included in the study. Thirty ? nine of them was identified as P. aeruginosa by using conventional metods. Ofloxacin susceptibility of the stains were assessed by using agar dilution method according to the recommendations of CLSI and DNA sequencing of gyrA was done.Fourteen of 39 (35,89%) P. aeruginosa strains were resistant to ofloxacin. Further 3 (7,69%) strains were found intermediate ? resistant. The substitution of threonine to isoleucine was observed in 5 of 14 (35.71%) quinolone resistant strains. Various silent mutations had been detected in quinolone resistant and susceptible strains, where codon 132 was most frequently affected. None of the susceptible strains had missense or nonsense mutations in gyrA. Six of 39 (12,82%) of the strains did not have any gyrA mutations.These data confirm that the primary mechanism of quinolone resistance in P. aeruginosa is mediated through target site alterations, specifically leading to the amino acid substitution of an isoleucine for a threonine in gyrA.To our knowledge this is the first study which the quinolone resistance examined by molecular analyzes in the gyrA gene of the P. aeruginosa in Turkey.We requirement new studies for clarifying the antimicrobial resistance because of the high level resistance in P. aeruginosa. The gene region must examined which can be related with resitance this is necessary for showing molecular chracteristic.
Benzer Tezler
- Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürü örneklerinden izole edilen mikroorganizmaların identifikasyonu, antibiyotik duyarlılıkları ve ESBL direnç durumunun araştırılması
Identification, antibiotic susceptibility and investigation of ESBL resistance of microorganisms isolated from blood culture samples of inpatients in intensive care units
OSMAN ORUÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASHABİL AYGAN
- Boğazdan izole edilen coliform bakterilerin B- laktamaz enzim aktivitelerinin tesbit edilmesi ve B-laktamaz pozitif coliformların penisilinetkisinin inaktivasyonunun in vitro deneylerle gösterilmesi
The Detection of beta-lactamasa activity of coliform bacteria isolated from th roat cultures and slovving the inactivation of penicilin by this beta lactamase produced by this caliform organisms
GÜVEN URAZ
Doktora
Türkçe
1986
MikrobiyolojiGazi ÜniversitesiGenel Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERDOĞAN BERKMAN
- Pseudamanas syringae ve pathavarlarının tanılanmalarında biyokimyasal ve morfolojik özelliklerin belirlenmesi üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
A.ALEV GÖKDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
ZiraatEge ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HİKMET SAYGILI
- Antalya ili domates alanlarında bakteriyel hastalıklar üzerinde araştırmalar
An Investigation on the bacterial diseases of tomato in Antalya
ERDEM KAHVECİ
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
ZiraatAnkara ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABDULLAH GÜRCAN