Geri Dön

An investigation of bacterial and fungal xylanolytic systems

Bakteriyel ve fungal ksilanolitik sistemlerinin araştırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 199168
  2. Yazar: AYŞEGÜL ERSAYIN YAŞINOK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. UFUK BAKIR, PROF. DR. ZÜMRÜT ÖGEL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Biyoloji, Biyoteknoloji, Biochemistry, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Ksilanolitik sistemler, ksilanaz, arabinofuranosidaz, Bacilluspumilus ve Scytalidium thermophilum.vii, Xylanolytic systems, xylanase, arabinofuranosidase, Bacillus pumilusand Scytalidium thermophilum.v
  7. Yıl: 2006
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Endo-β-1,4 ksilanazlar (EC. 3.2.1.8) tipik olarak β-1,4-ksilosidaz (EC. 3.2.1.37) ,α-L-arabinofuranosidaz (EC. 3.2.1.55) ve feruloyl esteraz (EC 3.1.1.73) gibifarklı hidrolitik enzimler ile birlikte üretilirler ve doğada ağaç ve bitkisel atıklarınağırlığının % 20-30 `lık kısmını oluşturan ksilan molekülünü hidrolize ederler.Böylece geri dönüşümü olan ksilan molekülü, substrat olarak kullanılarak yakıt,çözücü ve kozmetik ürünlerinin hazırlanmasında kullanılabilir. Ayrıca, ksilanolitikenzimler gıda, yem, tekstil ve kağıt beyazlatma işlemlerinde de kullanılırlar.Çalışmamızın ilk aşamasında, bir toprak izolatı olan Bacillus pumilus SB-M13 vetermofilik bir küf olan Scytalidium thermophilum'un ksilanolitik enzim sistemleriaraştırılmıştır. Ksilanolitik enzimlerin tipi, çeşitliliği ve üretim seviyesi karbonkaynağı ve mikroorganizmaya bağlı olarak değişmiştir. Fakat, her ikimikroorganizma için de, ksilanolitik enzimlerin sentezinin sırasal, sinerjik vekarbon catabolit engellemesi altında olduğu bulunmışturÇalışmanın ikinci kısmında, B. pumilus SB-M13 β-1,4 ksilanaz enzimi saflaştırılıpbiyokimyasal olarak karakterize edilmiştir. Enzim alkalin pH'larda dayanıklı olup,vienzime ait en yüksek aktivite 60ºC ve pH 7.5'ta gözlenmiştir. Enzime ait Km vekcat değerleri sırasıyla 1.87 mg/ml and 43,000 U/mg olarak belirlenmiştir.B. pumilus SB-M13 ve S .thermophilum α-L-arabinofuranosidaz enzimlerisaflaştırılıp, biyokimyasal karakterizasyonu yapılmıştır. Mezofilik birmikroorganizma tarafından üretilmesine rağmen, B. pumilus SB-M13arabinofuranosidaz enzimi ısıya dayanıklıdır. Üstelik, diğer küflerin tersine, S.thermophilum alkalin dayanıklı arabinofuranosidaz üretmiştir. Her iki enzim demutimerik, alkalin dayanıklı ve 70ºC ve pH 7.0'de en aktiftir. Fakat, S.thermophilum arabinofuranosidazı ile karşılaştırıldığında, B. pumilus SB-M13arabinofuranosidazının substrat seçiciliği ve katalitik gücü daha fazladır.

Özet (Çeviri)

Endo-β-1,4 xylanases (EC. 3.2.1.8) are typically produced as a mixture of differenthydrolytic enzymes such as β-1,4-xylosidase (EC. 3.2.1.37) , α-L-arabinofuranosidases (EC. 3.2.1.55), and feruloyl esterase (EC 3.1.1.73) thathydrolyze xylan molecule, which constitutes 20-30% of the weight of wood andagricultural wastes. Thus, xylan, a renewable biomass, can be utilized as asubstrate for the preparation of many products such as fuels, solvents andpharmaceuticals. Besides, xylanolytic enzymes themselves are also used in food,feed, textile industries and pre-bleaching of kraft.In the first part of the study, xylanolytic systems of a soil isolate Bacillus pumilusSB-M13 and a thermophilic fungus Scytalidium thermophilum were investigated.Production rate and type of xylanolytic changed depending on the carbon sourceand the microorganism. However, xylanolytic enzyme production was found to besequential, in synergy and under the control of carbon catabolite repression forboth microorganisms.In the second part, B. pumilus SB-M13 β-1,4 xylanase was purified andivbiochemically characterized. The enzyme was stable at alkaline pHs and highestactivity was observed at 60ºC and pH 7.5. Enzyme Km and kcat values weredetermined as 1.87 mg/ml and 43,000 U/mg, respectively.B. pumilus SB-M13 and S .thermophilum α-L-arabinofuranosidases were alsopurified and biochemically characterized. Although produced from a mesophilicmicroorganism, B. pumilus SB-M13 arabinofuranosidase was quite thermostable.Moreover, unlike other fungi, S. thermophilum produced alkaline stablearabinofuranosidases. Both enzymes were multimeric, alkaline stable and mostactive at 70ºC and pH 7.0. However, when compared to S. thermophilum,catalytic power of B. pumilus SB-M13 arabinofuranosidase was higher.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    224996

    Aseptik menenjit/ensefalitli hastalarda herpes grubu virusların araştırılması

    The investigation of herpes group viruses in patients with aseptic meningitis/encephalitis

    FATMA POLAT SEMERCİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FÜGEN YARKIN

  2. Tez No

    224753

    İntertrigo etkenlerinin direkt yayma, Wood Işığı ve kültür yöntemleri ile araştırılması

    Investigation of causative agents of intertrigo with direct smear, Wood light and culture methods

    BİRGÜL TEPE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Dermatolojiİnönü Üniversitesi

    Dermatoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ŞENOL

  3. Tez No

    32990

    Maligniteli hastalarda sitomegalovirus antikor seroprevalansının incelenmesi

    The investigation of anti-cytomegalovirus antibody seroprevalance in patients with malignant diseases

    BÜLENT AHMET BEŞİRBELLİOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1994

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiGata

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

  4. Tez No

    225339

    Deneysel kandida albikans endoftalmili tavşan gözlerinde intravitreal ve oral moksifloksasin uygulamasının göz içi sıvılara geçişinin ve antifungal etkisinin değerlendirilmesi

    Evaluation of antifungal activity and intraocular fluid penetration of intravitreally and orally administered moxifloxacin in eyes with endophthalmitis due to candida albicans in an experimental rabbit model

    SEDAT ARIKAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Göz HastalıklarıGazi Üniversitesi

    Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞENGÜL ÖZDEK

  5. Tez No

    90356

    Fonksiyonel endoskopik sinüs cerrahisi (FESC) uygulanan kronik sinüzitli hastaların sinüs materyallerinin bakteriyolojik yönden değerlendirilmesi

    Başlık çevirisi yok

    MURAT ARAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    MikrobiyolojiFırat Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. HATİCE HANDAN AKBULUT

Geri Dön